273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1795 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_1795  taurine dioxygenase  100 
 
 		 289 aa  597  1e-170  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.119759 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2270  taurine dioxygenase  84.78 
 
 		 289 aa  518  1e-146  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3893  Taurine dioxygenase  54.67 
 
 		 290 aa  309  4e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3279  putative alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase  49.66 
 
 		 312 aa  271  7e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1796  taurine dioxygenase  45.65 
 
 		 270 aa  236  3e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.404778  normal  0.122959 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0986  taurine dioxygenase  46.04 
 
 		 271 aa  235  8e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.762036 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2004  taurine dioxygenase  44.64 
 
 		 278 aa  217  2e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.316372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0838  taurine dioxygenase  40.79 
 
 		 285 aa  202  4e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.518318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5742  Taurine dioxygenase  41.94 
 
 		 307 aa  193  4e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.448505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4542  taurine dioxygenase  37.13 
 
 		 301 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0422287  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2717  taurine dioxygenase  40.28 
 
 		 305 aa  183  3e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4982  taurine dioxygenase  39.78 
 
 		 277 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.393114  normal  0.753177 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0230  taurine dioxygenase  40.5 
 
 		 277 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.091152  hitchhiker  0.00688358 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0245  taurine dioxygenase  40.5 
 
 		 291 aa  182  6e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.311094  normal  0.333642 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7076  Taurine dioxygenase  42.22 
 
 		 282 aa  181  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2733  taurine dioxygenase  37.37 
 
 		 295 aa  180  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488932  normal  0.0804136 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0253  taurine dioxygenase  40.14 
 
 		 280 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.907637 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4751  taurine dioxygenase  38.33 
 
 		 304 aa  178  8e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.325692  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0254  taurine dioxygenase  39.78 
 
 		 277 aa  178  9e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6202  Taurine dioxygenase  42.38 
 
 		 272 aa  177  2e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1172  taurine dioxygenase  38.71 
 
 		 277 aa  175  7e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.105338  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0828  taurine dioxygenase  37.45 
 
 		 276 aa  175  8e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.297497  normal  0.696924 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2086  taurine dioxygenase  41.07 
 
 		 293 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12970  taurine dioxygenase  38.71 
 
 		 277 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.325066 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3239  Taurine dioxygenase  38.25 
 
 		 283 aa  172  6.999999999999999e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0397  taurine dioxygenase  38.25 
 
 		 283 aa  172  6.999999999999999e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4409  taurine dioxygenase 2-oxoglutarate-dependent  39.93 
 
 		 301 aa  172  7.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0425898  normal  0.500105 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0392  taurine dioxygenase  38.25 
 
 		 283 aa  171  1e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3260  taurine dioxygenase  37.32 
 
 		 283 aa  170  3e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.169566  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00318  taurine dioxygenase  37.32 
 
 		 283 aa  170  3e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0443  taurine dioxygenase  37.32 
 
 		 283 aa  170  3e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6050  taurine dioxygenase  41.88 
 
 		 291 aa  169  3e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00322  hypothetical protein  37.32 
 
 		 283 aa  170  3e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0432  taurine dioxygenase  37.89 
 
 		 283 aa  170  3e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0841  taurine dioxygenase  36.97 
 
 		 283 aa  169  4e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.149733 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5823  taurine dioxygenase 2-oxoglutarate-dependent  36.86 
 
 		 295 aa  169  4e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3604  taurine dioxygenase  40.07 
 
 		 304 aa  168  9e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0978  Taurine dioxygenase  38.28 
 
 		 287 aa  167  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.793561  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0169  TauD/TfdA family dioxygenase  38.26 
 
 		 299 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0190  taurine dioxygenase  37.92 
 
 		 299 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4136  taurine dioxygenase (TauD/TfdA family)  39.65 
 
 		 308 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.805351 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4704  taurine dioxygenase  35.66 
 
 		 282 aa  165  8e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6251  taurine dioxygenase  39.86 
 
 		 308 aa  165  8e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.81693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6536  taurine dioxygenase  39.86 
 
 		 308 aa  165  8e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.788384 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2573  dioxygenase, TauD/TfdA  38.65 
 
 		 292 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.225164  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2135  dioxygenase, TauD/TfdA  38.65 
 
 		 292 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1409  dioxygenase, TauD/TfdA  38.65 
 
 		 292 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.530858  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2661  dioxygenase, TauD/TfdA  38.65 
 
 		 292 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.719861  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3179  dioxygenase, TauD/TfdA  38.65 
 
 		 292 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1633  dioxygenase, TauD/TfdA  38.65 
 
 		 292 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4383  Taurine dioxygenase  41.76 
 
 		 281 aa  163  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6587  taurine dioxygenase  39.86 
 
 		 308 aa  163  3e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.51854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1245  taurine dioxygenase  39.86 
 
 		 308 aa  163  3e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.830783  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2520  dioxygenase, TauD/TfdA  38.3 
 
 		 292 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1958  dioxygenase, TauD/TfdA  38.73 
 
 		 292 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3666  Taurine dioxygenase  35.21 
 
 		 304 aa  162  5.0000000000000005e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4158  taurine dioxygenase  39.37 
 
 		 297 aa  162  6e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.670587  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4563  taurine dioxygenase  36.97 
 
 		 282 aa  162  6e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.737071 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5198  dioxygenase, TauD/TfdA family  35.37 
 
 		 298 aa  161  1e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5058  taurine dioxygenase  37.54 
 
 		 299 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6191  taurine dioxygenase  39.13 
 
 		 308 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1374  Taurine dioxygenase  40.07 
 
 		 306 aa  160  3e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1665  taurine dioxygenase  38.25 
 
 		 303 aa  159  4e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0188  taurine dioxygenase  37.19 
 
 		 299 aa  159  4e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354503 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0153  taurine dioxygenase  38.36 
 
 		 302 aa  159  4e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.93116 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3776  Taurine dioxygenase  37.29 
 
 		 315 aa  159  5e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0623  taurine dioxygenase  38.85 
 
 		 277 aa  159  7e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0658151  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2819  taurine dioxygenase  38.16 
 
 		 282 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.373247 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2012  taurine dioxygenase  37.41 
 
 		 281 aa  157  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2223  taurine dioxygenase  38.41 
 
 		 335 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0799  taurine dioxygenase  39.01 
 
 		 277 aa  157  2e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.229107  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2137  taurine dioxygenase  38.85 
 
 		 277 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.625225  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0511  Taurine dioxygenase  38.06 
 
 		 299 aa  156  3e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30930  taurine catabolic dioxygenase protein  37.77 
 
 		 273 aa  156  4e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433901  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2101  Taurine dioxygenase  37.46 
 
 		 315 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2676  taurine dioxygenase  37.81 
 
 		 282 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2175  taurine dioxygenase  38.81 
 
 		 306 aa  155  5.0000000000000005e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.129597 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7176  taurine dioxygenase  37.68 
 
 		 282 aa  155  6e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3507  taurine dioxygenase  36.77 
 
 		 315 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220581 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2066  taurine dioxygenase  36.43 
 
 		 315 aa  155  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.214366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2155  putative alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase  36.77 
 
 		 315 aa  154  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.546962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2169  taurine dioxygenase  37.41 
 
 		 302 aa  155  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4017  taurine dioxygenase  36.77 
 
 		 315 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4567  taurine dioxygenase  36.77 
 
 		 315 aa  154  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0137  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  36.84 
 
 		 298 aa  154  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04663  taurine dioxygenase  38.18 
 
 		 305 aa  154  2e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22390  Taurine dioxygenase protein  38.68 
 
 		 318 aa  152  5e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0261  taurine dioxygenase  35.36 
 
 		 282 aa  152  7e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3935  taurine dioxygenase  35.36 
 
 		 282 aa  152  7e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3692  taurine dioxygenase  35.36 
 
 		 282 aa  152  7e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2006  taurine dioxygenase  38.43 
 
 		 282 aa  152  7e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0337  taurine dioxygenase  35.23 
 
 		 298 aa  152  8e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3847  taurine dioxygenase  36.71 
 
 		 282 aa  150  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21960  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA family  36.13 
 
 		 317 aa  151  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.162155  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1351  alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase  37.32 
 
 		 282 aa  150  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2043  alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase  37.32 
 
 		 282 aa  150  3e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3100  TauD/TfdA family dioxygenase  37.68 
 
 		 282 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2333  alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase  37.32 
 
 		 282 aa  150  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0021  taurine dioxygenase  37.02 
 
 		 299 aa  150  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1440  taurine catabolism dioxygenase TauD, TfdA family protein  37.68 
 
 		 282 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>