More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0078 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0144  oligopeptidase A  49.41 
 
 		 683 aa  637    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0045  oligopeptidase A  49.48 
 
 		 683 aa  638    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0078  oligopeptidase A  100 
 
 		 741 aa  1527    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4461  oligopeptidase A  50.99 
 
 		 682 aa  647    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01090  oligopeptidase A  48.62 
 
 		 681 aa  638    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0084  oligopeptidase A  89.88 
 
 		 731 aa  1378    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.611624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2240  oligopeptidase A  69.21 
 
 		 712 aa  1031    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0067  oligopeptidase A  51.29 
 
 		 681 aa  647    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00790  oligopeptidase A  51.45 
 
 		 681 aa  653    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.983257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0111  oligopeptidase A  48.08 
 
 		 695 aa  629  1e-179  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0114  oligopeptidase A  49.55 
 
 		 695 aa  629  1e-179  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.357976  normal  0.13234 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0111  oligopeptidase A  48.08 
 
 		 695 aa  629  1e-179  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000602107 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0090  oligopeptidase A  49.77 
 
 		 692 aa  626  1e-178  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0096  oligopeptidase A  47.94 
 
 		 683 aa  625  1e-177  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.32998  hitchhiker  0.00599775 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0006  Oligopeptidase A  46.99 
 
 		 682 aa  616  1e-175  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.322163  normal  0.727066 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4207  oligopeptidase A  45.15 
 
 		 680 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4699  oligopeptidase A  45.35 
 
 		 679 aa  600  1e-170  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0006  Oligopeptidase A  45.58 
 
 		 686 aa  602  1e-170  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03492  oligopeptidase A  45.07 
 
 		 678 aa  601  1e-170  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0067  oligopeptidase A  45.69 
 
 		 683 aa  601  1e-170  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0087  oligopeptidase A  45.35 
 
 		 679 aa  600  1e-170  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4217  Oligopeptidase A  46.83 
 
 		 679 aa  598  1e-170  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3842  oligopeptidase A  45.49 
 
 		 679 aa  598  1e-170  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4256  oligopeptidase A  47.13 
 
 		 679 aa  601  1e-170  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3935  oligopeptidase A  45.63 
 
 		 679 aa  600  1e-170  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2533  oligopeptidase A  47.09 
 
 		 679 aa  598  1e-170  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.437216  normal  0.440356 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4392  oligopeptidase A  46.53 
 
 		 679 aa  593  1e-168  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3595  oligopeptidase A  46.9 
 
 		 679 aa  593  1e-168  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0399  oligopeptidase A  46.87 
 
 		 694 aa  593  1e-168  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.905041  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4051  oligopeptidase A  45.21 
 
 		 679 aa  595  1e-168  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1253  oligopeptidase A  46.44 
 
 		 682 aa  591  1e-167  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0208  oligopeptidase A  46.1 
 
 		 679 aa  591  1e-167  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0124  oligopeptidase A  46.53 
 
 		 679 aa  591  1e-167  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4086  oligopeptidase A  45.08 
 
 		 680 aa  589  1e-167  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.902618 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0124  oligopeptidase A  44.24 
 
 		 679 aa  588  1e-166  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0116  oligopeptidase A  44.94 
 
 		 680 aa  588  1e-166  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3657  oligopeptidase A  46.75 
 
 		 679 aa  587  1e-166  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.601769 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4047  oligopeptidase A  44.93 
 
 		 682 aa  587  1e-166  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.980043  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0054  oligopeptidase A  45.94 
 
 		 681 aa  588  1e-166  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0345207  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0320  oligopeptidase A  46.61 
 
 		 676 aa  584  1.0000000000000001e-165  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4701  oligopeptidase A  46.85 
 
 		 680 aa  583  1.0000000000000001e-165  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3546  oligopeptidase A  45.15 
 
 		 678 aa  584  1.0000000000000001e-165  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3907  oligopeptidase A  43.34 
 
 		 680 aa  579  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4986  oligopeptidase A  45.37 
 
 		 683 aa  578  1e-164  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001952  oligopeptidase A  43.48 
 
 		 680 aa  580  1e-164  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3787  oligopeptidase A  43.34 
 
 		 680 aa  579  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3968  oligopeptidase A  43.34 
 
 		 680 aa  579  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3864  oligopeptidase A  43.34 
 
 		 680 aa  579  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3874  oligopeptidase A  44.03 
 
 		 679 aa  582  1e-164  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3797  oligopeptidase A  43.34 
 
 		 680 aa  580  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0217  Oligopeptidase A  43.99 
 
 		 680 aa  577  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3911  oligopeptidase A  43.28 
 
 		 680 aa  576  1.0000000000000001e-163  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0218  oligopeptidase A  43.99 
 
 		 680 aa  577  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3824  oligopeptidase A  43.77 
 
 		 680 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0007  oligopeptidase A  46.24 
 
 		 680 aa  576  1.0000000000000001e-163  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.73797  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4845  oligopeptidase A  43.99 
 
 		 680 aa  577  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.88545 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2570  oligopeptidase A  43.54 
 
 		 680 aa  577  1.0000000000000001e-163  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0791  oligopeptidase A  45.72 
 
 		 679 aa  576  1.0000000000000001e-163  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3698  oligopeptidase A  43.99 
 
 		 680 aa  577  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3787  oligopeptidase A  43.99 
 
 		 680 aa  577  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.894892 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00526  Zn-dependent oligopeptidase  42.64 
 
 		 695 aa  575  1.0000000000000001e-163  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03347  oligopeptidase A  43.85 
 
 		 680 aa  575  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.642114  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3980  oligopeptidase A  43.71 
 
 		 680 aa  572  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03300  hypothetical protein  43.85 
 
 		 680 aa  575  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.762273  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0031  oligopeptidase A  43.06 
 
 		 685 aa  574  1.0000000000000001e-162  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2458  oligopeptidase A  45.43 
 
 		 679 aa  573  1.0000000000000001e-162  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.105429  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0010  oligopeptidase A  43.4 
 
 		 680 aa  569  1e-161  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4065  oligopeptidase A  45.23 
 
 		 679 aa  571  1e-161  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0145  oligopeptidase A  44.93 
 
 		 679 aa  570  1e-161  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.491748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2132  oligopeptidase A  43.78 
 
 		 677 aa  568  1e-160  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0694294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2208  oligopeptidase A  45.43 
 
 		 679 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.696851  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2433  oligopeptidase A  44.14 
 
 		 701 aa  559  1e-158  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1642  oligopeptidase A  45.31 
 
 		 676 aa  559  1e-158  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.257802 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1860  oligopeptidase A  43.28 
 
 		 700 aa  561  1e-158  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.709239  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1623  Oligopeptidase A  42.36 
 
 		 704 aa  559  1e-158  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.932062 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0150  oligopeptidase A  43.52 
 
 		 679 aa  561  1e-158  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0372443 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1534  oligopeptidase A  41.19 
 
 		 716 aa  561  1e-158  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.122877 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4196  oligopeptidase A  42.56 
 
 		 680 aa  560  1e-158  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1951  Oligopeptidase A  42.22 
 
 		 704 aa  558  1e-157  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.844627  normal  0.0899993 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0156  oligopeptidase A  44.24 
 
 		 683 aa  557  1e-157  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2597  Oligopeptidase A  43.35 
 
 		 702 aa  558  1e-157  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.219931  normal  0.0217228 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4479  oligopeptidase A  42.98 
 
 		 680 aa  558  1e-157  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0141  oligopeptidase A  44.7 
 
 		 685 aa  553  1e-156  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1476  oligopeptidase A  41.1 
 
 		 704 aa  555  1e-156  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0816638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3984  oligopeptidase A  43.99 
 
 		 682 aa  551  1e-155  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.199844  normal  0.049802 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0212  oligopeptidase A  44.7 
 
 		 683 aa  551  1e-155  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2235  oligopeptidase A  44.19 
 
 		 699 aa  548  1e-154  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1653  Oligopeptidase A  44.21 
 
 		 677 aa  546  1e-154  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2159  oligopeptidase A  43.68 
 
 		 695 aa  547  1e-154  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2750  oligopeptidase A  44.04 
 
 		 699 aa  547  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5447  oligopeptidase A  43.33 
 
 		 695 aa  546  1e-154  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2397  oligopeptidase A  43.8 
 
 		 685 aa  547  1e-154  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3084  oligopeptidase A  44.19 
 
 		 699 aa  548  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2674  oligopeptidase A  44.19 
 
 		 699 aa  548  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.295345  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1129  oligopeptidase A  42.66 
 
 		 695 aa  548  1e-154  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.60188  normal  0.628312 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0054  oligopeptidase A  43.3 
 
 		 695 aa  546  1e-154  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03135  oligopeptidase A  45.1 
 
 		 674 aa  545  1e-154  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2618  oligopeptidase A  44.04 
 
 		 699 aa  546  1e-154  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1507  oligopeptidase A  44.19 
 
 		 699 aa  548  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2141  oligopeptidase A  43.68 
 
 		 695 aa  547  1e-154  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.388715  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>