More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1724 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1724  nitroreductase  100 
 
 
265 aa  555  1e-157  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0035876  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0797  nitroreductase family protein  68.92 
 
 
270 aa  374  1e-102  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0323416  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0804  nitroreductase  68.53 
 
 
270 aa  369  1e-101  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00112064  normal  0.983564 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3640  nitroreductase  39.43 
 
 
245 aa  201  8e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05892  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  32.92 
 
 
240 aa  139  3e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1678  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  34.58 
 
 
246 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.244515  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0456  nitroreductase  29.66 
 
 
240 aa  119  7e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0821  putative NADPH nitroreductase protein  28.39 
 
 
242 aa  96.7  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0528  NADH dehydrogenase  28.77 
 
 
206 aa  92  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.688745 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2827  nitroreductase  28.57 
 
 
212 aa  89.4  6e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.374853  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3070  nitroreductase family protein  28.25 
 
 
212 aa  86.3  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.511917  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3075  nitroreductase family protein  27.8 
 
 
212 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.1167  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3031  NAD  27.8 
 
 
212 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2798  NAD(P)H nitroreductase  27.8 
 
 
212 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2761  NAD(P)H nitroreductase  27.8 
 
 
212 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3044  nitroreductase  27.6 
 
 
212 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2206  nitroreductase family protein  27.6 
 
 
212 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00142362  hitchhiker  5.10468e-16 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1374  nitroreductase  26.19 
 
 
202 aa  80.1  0.00000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4112  nitroreductase family protein  27.63 
 
 
205 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.662244  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4176  nitroreductase family protein  27.63 
 
 
205 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00113273  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5933  putative nitroreductase  27.96 
 
 
200 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3786  nitroreductase family protein  27.43 
 
 
205 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.776099  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1136  nitroreductase  26.83 
 
 
200 aa  76.6  0.0000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.710664  normal  0.0578189 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4065  nitroreductase family protein  27.43 
 
 
205 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.960529 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3955  nitroreductase family protein  27.43 
 
 
205 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00205855  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4264  nitroreductase family protein  27.43 
 
 
205 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.17491  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3801  nitroreductase family protein  27.43 
 
 
205 aa  75.9  0.0000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000117971  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0182  NADH dehydrogenase  23.64 
 
 
206 aa  75.9  0.0000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263837  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0106  nitroreductase  25.71 
 
 
200 aa  75.9  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.76235 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1846  nitroreductase  27.19 
 
 
206 aa  75.9  0.0000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1084  nitroreductase family protein  27.43 
 
 
205 aa  75.5  0.0000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4154  nitroreductase family protein  27.43 
 
 
205 aa  75.5  0.0000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.156889  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0109  nitroreductase  25.24 
 
 
200 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47329  predicted protein  26.51 
 
 
261 aa  73.9  0.000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.910141  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1696  nitroreductase  25.58 
 
 
213 aa  73.2  0.000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.451691 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1083  nitroreducatase family protein, authentic frameshift  21.94 
 
 
206 aa  73.6  0.000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68560  putative nitroreductase  27.57 
 
 
200 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4824  NADH dehydrogenase  27.23 
 
 
208 aa  72  0.000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2969  nitroreductase  25.32 
 
 
209 aa  71.6  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000187798  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2744  nitroreductase  26.17 
 
 
205 aa  72  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.613458  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1805  nitroreductase  23.19 
 
 
199 aa  71.6  0.00000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000108045  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1006  nitroreductase  25.59 
 
 
202 aa  70.9  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269661  normal  0.607301 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1324  NAD(P)H nitroreductase, putative  23.64 
 
 
210 aa  69.7  0.00000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000367676  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1071  nitroreductase  26.18 
 
 
215 aa  68.6  0.00000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0920  nitroreductase  22.98 
 
 
202 aa  68.6  0.0000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0905  nitroreductase  25.36 
 
 
212 aa  68.2  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000395807  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1322  nitroreductase  25.75 
 
 
210 aa  67.8  0.0000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1679  nitroreductase  24.2 
 
 
199 aa  67  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2283  nitroreductase  25.24 
 
 
199 aa  67  0.0000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.671339  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2239  nitroreductase family protein  25.89 
 
 
215 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.153685  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0247  nitroreductase  24.77 
 
 
206 aa  66.6  0.0000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3085  nitroreductase family protein  27.78 
 
 
215 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000156331 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2038  nitroreductase family protein  25.89 
 
 
215 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119654  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3874  nitroreductase  27.88 
 
 
205 aa  65.1  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2080  nitroreductase  25.45 
 
 
215 aa  64.3  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.123305  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2367  nitroreductase family protein  25.45 
 
 
215 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.130661  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1122  nitroreductase  22.17 
 
 
200 aa  64.3  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2286  nitroreductase family protein  25.45 
 
 
215 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.153669  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  22.6 
 
 
204 aa  63.5  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1084  nitroreductase family protein  22.67 
 
 
201 aa  63.2  0.000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1204  nitroreductase  46.3 
 
 
174 aa  62.8  0.000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.460953  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5547  nitroreductase  45.31 
 
 
241 aa  62.4  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5314  nitroreductase  50.98 
 
 
226 aa  62  0.000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4933  nitroreductase  50.98 
 
 
226 aa  62  0.000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.850383  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5021  nitroreductase  50.98 
 
 
226 aa  62  0.000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.227652  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0657  nitroreductase family protein  21.49 
 
 
201 aa  62  0.000000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2101  nitroreductase family protein  25 
 
 
215 aa  62  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.320716  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2040  nitroreductase family protein  25 
 
 
215 aa  62  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0134367  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2257  nitroreductase family protein  25 
 
 
215 aa  62  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.328438  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1405  nitroreductase  25.47 
 
 
204 aa  61.6  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2282  nitroreductase family protein  25 
 
 
215 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.1661e-35 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0382  nitroreductase  23.58 
 
 
213 aa  61.6  0.00000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000218228  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1657  nitroreductase  27.73 
 
 
215 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0325303  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0341  nitroreductase family protein  25.37 
 
 
208 aa  62  0.00000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0277871  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1220  nitroreductase family protein  22.27 
 
 
200 aa  61.2  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.168432  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0073  nitroreductase family protein  26.43 
 
 
178 aa  60.8  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0360  nitroreductase  20.38 
 
 
200 aa  61.2  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0774  nitroreductase family protein  22.81 
 
 
208 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.139157 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1615  nitroreductase  23.38 
 
 
257 aa  60.8  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00251246  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4422  nitroreductase family protein  24.04 
 
 
207 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3079  nitroreductase family protein  23.41 
 
 
199 aa  60.1  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3952  DrgA protein  23.56 
 
 
201 aa  59.7  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.335836  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1731  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  27.06 
 
 
212 aa  59.7  0.00000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.178884  normal  0.507851 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4463  nitroreductase family protein  23.92 
 
 
208 aa  59.7  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.325624  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4241  nitroreductase family protein  24.29 
 
 
207 aa  59.3  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4079  nitroreductase family protein  24.29 
 
 
207 aa  59.3  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0494988  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4090  nitroreductase family protein  24.29 
 
 
207 aa  59.3  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.192687  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  26.7 
 
 
202 aa  59.3  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4571  nitroreductase family protein  24.29 
 
 
207 aa  59.3  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  23.58 
 
 
183 aa  58.9  0.00000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1209  nitroreductase family protein  21.05 
 
 
201 aa  59.3  0.00000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0494654  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0736  nitroreductase  24.39 
 
 
211 aa  58.5  0.0000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000777903  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0664  nitroreductase  22.33 
 
 
180 aa  58.5  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.237638  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1699  nitroreductase  24.63 
 
 
201 aa  58.2  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2280  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  50 
 
 
221 aa  57  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1408  nitroreductase  24.89 
 
 
217 aa  57  0.0000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2969  nitroreductase  20.61 
 
 
218 aa  57  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2003  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  50 
 
 
221 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1158  nitroreductase  19.2 
 
 
209 aa  55.8  0.0000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  23.56 
 
 
190 aa  55.8  0.0000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>