47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_1027 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_1027  DoxX family protein  100 
 
 		 155 aa  304  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.692978 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0990  DoxX family protein  96.88 
 
 		 128 aa  215  2e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2188  DoxX family protein  77.7 
 
 		 155 aa  204  3e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.62019  normal  0.793728 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3068  DoxX family protein  72.26 
 
 		 155 aa  196  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00512546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0755  DoxX family protein  62.5 
 
 		 154 aa  181  4.0000000000000006e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.351795 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6307  DoxX family protein  67.83 
 
 		 161 aa  175  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.188963  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4682  thiosulphate:quinone oxidoreductase (TQO) small subunit(DoxD domain)  66.91 
 
 		 156 aa  175  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.459173  normal  0.864959 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0301  DoxX family protein  56.2 
 
 		 157 aa  150  7e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.30143 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1240  DoxX  52.41 
 
 		 171 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.962981 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3128  DoxX family protein  56.82 
 
 		 166 aa  145  3e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1605  DoxX  52.74 
 
 		 175 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4788  DoxX  52.71 
 
 		 154 aa  123  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2679  DoxX  46.15 
 
 		 156 aa  111  4.0000000000000004e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.777331 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2030  DoxX family protein  59 
 
 		 189 aa  101  3e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.774237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1002  hypothetical protein  44.35 
 
 		 154 aa  90.9  6e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.527815  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5936  DoxX family protein  40.28 
 
 		 172 aa  83.2  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2032  hypothetical protein  43.2 
 
 		 167 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1432  DoxX family protein  46.34 
 
 		 175 aa  82.8  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0584  hypothetical protein  42.86 
 
 		 165 aa  80.9  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.399737  normal  0.684343 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5146  DoxX family protein  39.16 
 
 		 154 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.535914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4649  DoxX  41.73 
 
 		 174 aa  78.6  0.00000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0809  DoxD family protein  36.84 
 
 		 154 aa  74.7  0.0000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.570745  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3394  hypothetical protein  39.42 
 
 		 141 aa  74.7  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.763235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00355  NADH dehydrogenase  36.67 
 
 		 151 aa  68.9  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002082  membrane protein  38.76 
 
 		 151 aa  69.7  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0702  hypothetical protein  34.62 
 
 		 154 aa  67.4  0.00000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0722  hypothetical protein  34.62 
 
 		 154 aa  67.4  0.00000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2361  DoxX family protein  41.13 
 
 		 160 aa  67  0.00000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.182713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0941  DoxX family protein  40.16 
 
 		 145 aa  65.1  0.0000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.93269 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3395  DoxD family protein  32.87 
 
 		 156 aa  62.4  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.586532  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2690  DoxX  40.4 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.360255  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1725  DoxX  31.36 
 
 		 187 aa  55.1  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0098  DoxD family protein/pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  37.21 
 
 		 752 aa  51.2  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0100  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.21 
 
 		 730 aa  51.2  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0727  hypothetical protein  36.36 
 
 		 738 aa  50.4  0.000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0707  hypothetical protein  34.09 
 
 		 738 aa  50.1  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2151  transporter  31.5 
 
 		 132 aa  47.8  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.447191  normal  0.895246 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2957  hypothetical protein  40.87 
 
 		 155 aa  47.8  0.00006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1137  hypothetical protein  32.85 
 
 		 152 aa  45.8  0.0002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0771  DoxX family protein  34.04 
 
 		 188 aa  44.7  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.135412 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2821  hypothetical protein  26.56 
 
 		 142 aa  44.7  0.0005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.149072  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7034  DoxX family protein  40.58 
 
 		 139 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.182123  normal  0.352709 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3122  DoxX family protein  31.11 
 
 		 139 aa  41.6  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.461418  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4289  DoxX family protein  35.14 
 
 		 156 aa  41.6  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1934  DoxX family protein  32.89 
 
 		 155 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.467271  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4399  DoxX family protein  35.14 
 
 		 156 aa  41.6  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3837  SURF4 domain-containing protein  34.85 
 
 		 137 aa  41.6  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  normal  0.973533 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>