More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3382 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4108  aminotransferase class-III  93.99 
 
 		 416 aa  769    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.443698 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1890  4-aminobutyrate aminotransferase  75.49 
 
 		 415 aa  647    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.597951  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3515  aminotransferase class-III  74.76 
 
 		 415 aa  639    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.54229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3681  aminotransferase class-III  94.23 
 
 		 416 aa  769    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232958  hitchhiker  0.000511444 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3382  aminotransferase class-III  100 
 
 		 414 aa  838    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1756  aminotransferase class-III  94.23 
 
 		 416 aa  767    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00824203 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0893  aminotransferase class-III  57.97 
 
 		 423 aa  494  1e-139  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0007  aminotransferase class-III  46.1 
 
 		 425 aa  374  1e-102  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.383992  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1618  4-aminobutyrate aminotransferase  48.71 
 
 		 420 aa  370  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.346531  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02518  4-aminobutyrate aminotransferase  45.99 
 
 		 426 aa  363  3e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02482  hypothetical protein  45.99 
 
 		 426 aa  363  3e-99  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3904  4-aminobutyrate aminotransferase  45.74 
 
 		 426 aa  363  3e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.888156 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2782  4-aminobutyrate aminotransferase  45.99 
 
 		 426 aa  363  3e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.480055 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4229  4-aminobutyrate aminotransferase  46.75 
 
 		 428 aa  362  6e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.94603  normal  0.717078 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1021  4-aminobutyrate aminotransferase  45.5 
 
 		 426 aa  361  1e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2797  4-aminobutyrate aminotransferase  45.5 
 
 		 426 aa  361  1e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1044  4-aminobutyrate aminotransferase  45.5 
 
 		 426 aa  361  1e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0214  4-aminobutyrate aminotransferase  42.68 
 
 		 425 aa  359  4e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0174674 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0229  4-aminobutyrate aminotransferase  42.68 
 
 		 425 aa  359  4e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0238  4-aminobutyrate aminotransferase  42.93 
 
 		 425 aa  359  6e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2972  4-aminobutyrate aminotransferase  45.41 
 
 		 427 aa  358  7e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.109466  normal  0.025416 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2937  4-aminobutyrate aminotransferase  45.41 
 
 		 427 aa  358  9e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.735836  normal  0.115833 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2942  4-aminobutyrate aminotransferase  45.01 
 
 		 426 aa  357  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2905  4-aminobutyrate aminotransferase  45.3 
 
 		 427 aa  357  2.9999999999999997e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4998  4-aminobutyrate aminotransferase  43.66 
 
 		 425 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.554548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4167  4-aminobutyrate aminotransferase  45.69 
 
 		 434 aa  355  7.999999999999999e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.130001  normal  0.207789 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2989  4-aminobutyrate aminotransferase  45.06 
 
 		 427 aa  355  8.999999999999999e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0883038 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0592  4-aminobutyrate aminotransferase  44.67 
 
 		 432 aa  354  1e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1289  4-aminobutyrate aminotransferase  46.08 
 
 		 426 aa  355  1e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0232  4-aminobutyrate aminotransferase  43.55 
 
 		 440 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2259  4-aminobutyrate aminotransferase  45.87 
 
 		 426 aa  352  5e-96  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.418729  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2371  4-aminobutyrate aminotransferase  45.74 
 
 		 440 aa  351  1e-95  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0827884  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2630  4-aminobutyrate aminotransferase  44.23 
 
 		 430 aa  349  5e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0809  4-aminobutyrate aminotransferase  43.81 
 
 		 419 aa  349  5e-95  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.615332  normal  0.0671712 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0344  4-aminobutyrate aminotransferase  42.34 
 
 		 426 aa  349  6e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03450  4-aminobutyrate aminotransferase  42.34 
 
 		 426 aa  349  6e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.22305e-16 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0819  4-aminobutyrate aminotransferase  43.56 
 
 		 446 aa  347  2e-94  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.798552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0188  4-aminobutyrate aminotransferase  42.82 
 
 		 425 aa  347  3e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4851  4-aminobutyrate aminotransferase  44.95 
 
 		 430 aa  346  6e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0280  4-aminobutyrate aminotransferase  45.06 
 
 		 429 aa  345  8.999999999999999e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.969383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3137  4-aminobutyrate aminotransferase  46.08 
 
 		 424 aa  344  2e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.213623 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2400  4-aminobutyrate aminotransferase  42.75 
 
 		 430 aa  341  1e-92  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.681516  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4695  4-aminobutyrate aminotransferase  45.15 
 
 		 430 aa  342  1e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1532  4-aminobutyrate aminotransferase  42.47 
 
 		 419 aa  341  1e-92  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2567  4-aminobutyrate aminotransferase  44.66 
 
 		 424 aa  340  2e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.78639  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3005  4-aminobutyrate aminotransferase  44.56 
 
 		 429 aa  339  4e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.742708  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5361  4-aminobutyrate aminotransferase  44.56 
 
 		 429 aa  339  4e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.984164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4711  4-aminobutyrate aminotransferase  44.3 
 
 		 446 aa  339  5e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4618  4-aminobutyrate aminotransferase  44.05 
 
 		 427 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.914156  normal  0.10828 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3398  4-aminobutyrate aminotransferase  45.36 
 
 		 426 aa  338  8e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3364  4-aminobutyrate aminotransferase  44.56 
 
 		 429 aa  338  9e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.158842 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4909  4-aminobutyrate aminotransferase  44.56 
 
 		 427 aa  338  9e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5241  4-aminobutyrate aminotransferase  44.3 
 
 		 427 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3864  4-aminobutyrate aminotransferase  42.79 
 
 		 421 aa  335  9e-91  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0197143 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4356  4-aminobutyrate aminotransferase  44.96 
 
 		 426 aa  334  1e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00363071 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3721  4-aminobutyrate aminotransferase  44.85 
 
 		 426 aa  334  2e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2912  4-aminobutyrate aminotransferase  43.8 
 
 		 430 aa  334  2e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0029  4-aminobutyrate aminotransferase protein  44.36 
 
 		 426 aa  333  4e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.717101 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2545  4-aminobutyrate aminotransferase  40.63 
 
 		 421 aa  333  4e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.505618  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0301  4-aminobutyrate aminotransferase  44.1 
 
 		 426 aa  332  6e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0090  4-aminobutyrate aminotransferase  43.07 
 
 		 426 aa  332  6e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3928  (S)-3-amino-2-methylpropionate transaminase  44.55 
 
 		 427 aa  332  7.000000000000001e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3494  4-aminobutyrate aminotransferase  43.93 
 
 		 424 aa  332  8e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.782932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0910  4-aminobutyrate aminotransferase  43.55 
 
 		 425 aa  330  2e-89  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000169324  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4677  4-aminobutyrate aminotransferase  44.5 
 
 		 422 aa  331  2e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.300302  normal  0.0763833 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0429  4-aminobutyrate aminotransferase  46.88 
 
 		 433 aa  330  3e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.286831  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1978  4-aminobutyrate aminotransferase  43.6 
 
 		 425 aa  330  3e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.514602 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5663  4-aminobutyrate aminotransferase  44.95 
 
 		 429 aa  330  4e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2338  4-aminobutyrate aminotransferase  44.23 
 
 		 422 aa  330  4e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.384271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4026  4-aminobutyrate aminotransferase  44.77 
 
 		 426 aa  329  7e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.35866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0146  4-aminobutyrate aminotransferase  46.12 
 
 		 434 aa  328  8e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0259  4-aminobutyrate aminotransferase  45.15 
 
 		 434 aa  325  8.000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0834  4-aminobutyrate aminotransferase  45.01 
 
 		 429 aa  325  9e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.379614 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4519  4-aminobutyrate aminotransferase  44.5 
 
 		 427 aa  325  1e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46670  4-aminobutyrate transaminase  43.72 
 
 		 426 aa  324  1e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4306  4-aminobutyrate aminotransferase  45.27 
 
 		 421 aa  324  2e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4211  4-aminobutyrate aminotransferase  45.06 
 
 		 425 aa  324  2e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.225868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4414  4-aminobutyrate aminotransferase  47.76 
 
 		 426 aa  324  2e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.877124 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2233  4-aminobutyrate aminotransferase  39.85 
 
 		 421 aa  322  6e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.4744  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0047  4-aminobutyrate aminotransferase  44.42 
 
 		 425 aa  322  8e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1784  4-aminobutyrate aminotransferase  42.09 
 
 		 421 aa  322  9.000000000000001e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.988641  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3172  4-aminobutyrate aminotransferase  43.44 
 
 		 426 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0310  4-aminobutyrate aminotransferase  41.73 
 
 		 454 aa  320  3e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0325  4-aminobutyrate aminotransferase  41.73 
 
 		 454 aa  320  3e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01279  GABA aminotransferase, PLP-dependent  43.88 
 
 		 421 aa  320  3.9999999999999996e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2344  4-aminobutyrate aminotransferase  43.88 
 
 		 421 aa  320  3.9999999999999996e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00720647  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1867  4-aminobutyrate aminotransferase  41.36 
 
 		 421 aa  320  3.9999999999999996e-86  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01290  hypothetical protein  43.88 
 
 		 421 aa  320  3.9999999999999996e-86  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2755  4-aminobutyrate aminotransferase  41.18 
 
 		 448 aa  320  3.9999999999999996e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2323  4-aminobutyrate transaminase  43.88 
 
 		 421 aa  320  3.9999999999999996e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1512  4-aminobutyrate transaminase  43.88 
 
 		 421 aa  320  3.9999999999999996e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3262  4-aminobutyrate aminotransferase  44.23 
 
 		 425 aa  319  5e-86  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.129895 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4286  4-aminobutyrate aminotransferase  46.27 
 
 		 425 aa  319  6e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.012329 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3862  4-aminobutyrate aminotransferase  42.75 
 
 		 427 aa  319  6e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.612157 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0354  4-aminobutyrate aminotransferase  41.73 
 
 		 468 aa  319  7e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0399  4-aminobutyrate aminotransferase  41.73 
 
 		 454 aa  318  1e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0326575  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1820  4-aminobutyrate transaminase  44.13 
 
 		 421 aa  318  1e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.144249 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3070  4-aminobutyrate aminotransferase  44.86 
 
 		 433 aa  318  1e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0281034 
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_2245  4-aminobutyrate aminotransferase  39.86 
 
 		 441 aa  318  1e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.120834  n/a   
 
 
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NC_011773  BCAH820_0357  4-aminobutyrate aminotransferase  41.48 
 
 		 478 aa  318  2e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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