More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_5244 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_5184  glutamine synthetase, putative  99.56 
 
 		 458 aa  946    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.92577  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5299  glutamine synthetase, putative  87.34 
 
 		 460 aa  841    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.802661  normal  0.238566 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5310  glutamine synthetase  94.1 
 
 		 458 aa  909    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4868  glutamate--ammonia ligase  93.89 
 
 		 458 aa  908    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2122  L-glutamine synthetase  91.05 
 
 		 458 aa  879    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0668807  normal  0.202196 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5408  L-glutamine synthetase  95.85 
 
 		 458 aa  916    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.532857  hitchhiker  0.00182517 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5091  glutamate--putrescine ligase  98.47 
 
 		 458 aa  935    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.327313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0174  glutamate--putrescine ligase  87.12 
 
 		 460 aa  841    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293825 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5208  glutamate--putrescine ligase  87.34 
 
 		 460 aa  840    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.179896  normal  0.60947 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3247  glutamine synthetase  90.17 
 
 		 458 aa  860    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48880  glutamine synthetase  88.86 
 
 		 458 aa  860    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5244  glutamate--putrescine ligase  100 
 
 		 458 aa  946    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.792573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5347  glutamate--putrescine ligase  87.34 
 
 		 460 aa  841    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107252 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03860  putative glutamine synthetase  89.74 
 
 		 458 aa  858    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38140  putative glutamine synthetase  89.74 
 
 		 458 aa  858    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0019966 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0279  glutamate--putrescine ligase  98.91 
 
 		 458 aa  938    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0341  L-glutamine synthetase  88.24 
 
 		 459 aa  857    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0727612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0387  glutamine synthetase  89.74 
 
 		 458 aa  858    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4677  glutamine synthetase family protein  51.79 
 
 		 456 aa  487  1e-136  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2068  glutamate--putrescine ligase  46.29 
 
 		 472 aa  412  1e-114  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0955  glutamine synthetase catalytic region  44.3 
 
 		 461 aa  412  1e-114  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6323  glutamine synthetase  44.87 
 
 		 455 aa  395  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3216  glutamine synthetase catalytic region  44.94 
 
 		 472 aa  398  1e-109  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0110604 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01274  gamma-Glu-putrescine synthase  44.72 
 
 		 472 aa  389  1e-107  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.798701  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2349  glutamine synthetase catalytic region  44.72 
 
 		 472 aa  390  1e-107  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.582872  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1506  glutamate--putrescine ligase  44.72 
 
 		 472 aa  390  1e-107  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01285  hypothetical protein  44.72 
 
 		 472 aa  389  1e-107  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.904201  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1939  glutamate--putrescine ligase  44.72 
 
 		 472 aa  390  1e-107  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.23252 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1825  glutamate--putrescine ligase  44.72 
 
 		 472 aa  390  1e-107  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0546478 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00464  gamma-glutamylputrescine synthetase  48.16 
 
 		 459 aa  390  1e-107  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.446878  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1412  glutamate--putrescine ligase  44.72 
 
 		 472 aa  389  1e-107  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2328  glutamine synthetase catalytic region  44.72 
 
 		 472 aa  390  1e-107  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4525  L-glutamine synthetase  43.85 
 
 		 455 aa  388  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1533  glutamate--putrescine ligase  44.49 
 
 		 472 aa  387  1e-106  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3952  glutamine synthetase catalytic region  43.43 
 
 		 459 aa  387  1e-106  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0296195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1118  glutamate--ammonia ligase  41.87 
 
 		 463 aa  384  1e-105  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.770456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72850  putative glutamine synthetase  43.97 
 
 		 455 aa  384  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2717  glutamine synthetase catalytic region  43.62 
 
 		 455 aa  379  1e-104  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.648356 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1181  L-glutamine synthetase  43.78 
 
 		 451 aa  380  1e-104  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2336  glutamine synthetase catalytic region  44.65 
 
 		 466 aa  377  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4054  glutamine synthetase catalytic region  43.43 
 
 		 454 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4547  glutamine synthetase, putative  43.43 
 
 		 454 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1342  glutamate--putrescine ligase  43.65 
 
 		 459 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.738876  normal  0.165008 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3842  glutamate--putrescine ligase  43.21 
 
 		 454 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3524  glutamate--putrescine ligase  42.53 
 
 		 444 aa  372  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.435958  normal  0.190458 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3764  hypothetical protein  44.07 
 
 		 454 aa  367  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3049  glutamine synthetase, catalytic region  41.7 
 
 		 464 aa  365  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.486199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44240  putative glutamine synthetase  44.07 
 
 		 454 aa  368  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2143  L-glutamine synthetase  42.86 
 
 		 454 aa  363  2e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1174  glutamate--ammonia ligase  42.51 
 
 		 455 aa  364  2e-99  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.189992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1568  L-glutamine synthetase  41.7 
 
 		 468 aa  362  1e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.719328  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0219  glutamine synthetase, catalytic region  41.7 
 
 		 464 aa  360  2e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4366  glutamine synthetase, catalytic region  42.63 
 
 		 471 aa  358  9e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2416  glutamine synthetase catalytic region  38.7 
 
 		 455 aa  338  1.9999999999999998e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.175652 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0887  glutamine synthetase catalytic region  38.31 
 
 		 459 aa  333  4e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0546  glutamine synthetase, catalytic region  38.98 
 
 		 453 aa  330  2e-89  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0584  glutamine synthetase catalytic region  39.87 
 
 		 465 aa  320  1.9999999999999998e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3702  glutamate--ammonia ligase  38.6 
 
 		 443 aa  318  2e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.928007 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0777  glutamine synthetase  41.57 
 
 		 456 aa  305  1.0000000000000001e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0866  glutamate--putrescine ligase  39.78 
 
 		 445 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2019  glutamate--ammonia ligase  38.88 
 
 		 445 aa  297  2e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0375  L-glutamine synthetase  38.88 
 
 		 445 aa  297  2e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3559  glutamine synthetase, catalytic region  36.69 
 
 		 448 aa  297  2e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.610228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2634  glutamate--putrescine ligase  37.92 
 
 		 448 aa  296  5e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0507413  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2178  glutamine synthetase, putative  36.47 
 
 		 448 aa  294  3e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1785  glutamine synthetase catalytic region  36.47 
 
 		 448 aa  292  7e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1406  glutamine synthetase  36.81 
 
 		 451 aa  292  7e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.483277  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1836  L-glutamine synthetase  38 
 
 		 439 aa  291  2e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.406794 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1127  L-glutamine synthetase  37.95 
 
 		 479 aa  288  2e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.278504  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1253  glutamine synthetase, catalytic region  36.14 
 
 		 454 aa  285  9e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1845  glutamine synthetase catalytic region  35.35 
 
 		 451 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.561959  hitchhiker  0.00870398 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3721  glutamine synthetase catalytic region  35.57 
 
 		 448 aa  281  1e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.504584  normal  0.0215831 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0951  glutamine synthetase catalytic region  37.82 
 
 		 450 aa  280  3e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.771272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4806  glutamine synthetase catalytic region  34.74 
 
 		 448 aa  278  1e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.583178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4278  glutamine synthetase, catalytic region  34.74 
 
 		 448 aa  278  2e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.702735  normal  0.233785 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2079  L-glutamine synthetase  36.53 
 
 		 454 aa  276  6e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3465  glutamine synthetase, catalytic region  34.68 
 
 		 448 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2897  glutamate--putrescine ligase  33.41 
 
 		 452 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5385  glutamine synthetase catalytic region  34.68 
 
 		 448 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.347557 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4901  glutamine synthetase, catalytic region  34.68 
 
 		 448 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.653152 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0804  glutamine synthetase, catalytic region  34.45 
 
 		 448 aa  274  3e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0418139  normal  0.144728 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1100  Glutamate--putrescine ligase  38.25 
 
 		 458 aa  272  9e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.2027 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3148  glutamine synthetase, putative  33.19 
 
 		 452 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2380  Glutamate--putrescine ligase  36.26 
 
 		 456 aa  270  2.9999999999999997e-71  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0068155  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2707  glutamate--putrescine ligase  32.97 
 
 		 452 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.210959  normal  0.606055 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2566  glutamate--putrescine ligase  33.19 
 
 		 452 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5183  glutamine synthetase, putative  34.73 
 
 		 452 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5309  glutamine synthetase  34.29 
 
 		 452 aa  267  2e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5243  glutamate--putrescine ligase  34.73 
 
 		 452 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.689829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1093  glutamate--ammonia ligase  34.51 
 
 		 451 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.440027  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4867  glutamate--ammonia ligase  34.29 
 
 		 452 aa  266  4e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0918007  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48860  putative glutamine synthetase  33.63 
 
 		 453 aa  266  4e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.467779  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5090  glutamate--putrescine ligase  34.51 
 
 		 452 aa  266  5.999999999999999e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0280  glutamate--putrescine ligase  34.51 
 
 		 452 aa  264  2e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0389  glutamine synthetase  33.85 
 
 		 452 aa  264  2e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03880  glutamine synthetase  33.85 
 
 		 452 aa  264  2e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5407  L-glutamine synthetase  33.85 
 
 		 452 aa  264  3e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000279947 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1939  glutamate--putrescine ligase  35.15 
 
 		 467 aa  261  1e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0199472  normal  0.0178394 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1268  glutamine synthetase  33.85 
 
 		 451 aa  261  2e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3572  glutamate--putrescine ligase  34.23 
 
 		 444 aa  261  2e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.701465  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>