More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3508 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_34680  putative oxidoreductase  78.7 
 
 		 432 aa  690    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.13731  normal  0.0636806 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2943  putative oxidoreductase  78.94 
 
 		 432 aa  692    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3508  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 432 aa  889    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.300203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0613  FAD dependent oxidoreductase  69.3 
 
 		 454 aa  614  1e-175  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3299  tyramine oxidase  65.89 
 
 		 433 aa  582  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.510135  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3371  tyramine oxidase  65.65 
 
 		 433 aa  582  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.374067  normal  0.779493 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3378  tyramine oxidase  65.65 
 
 		 433 aa  582  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.824696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3473  tyramine oxidase  65.65 
 
 		 433 aa  582  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3304  tyramine oxidase  65.65 
 
 		 433 aa  581  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.582746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2568  FAD dependent oxidoreductase  41.13 
 
 		 431 aa  334  2e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3146  oxidoreductase, putative  40.9 
 
 		 431 aa  332  1e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0242  FAD dependent oxidoreductase  39.19 
 
 		 437 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2709  FAD dependent oxidoreductase  40 
 
 		 431 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.362524 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48010  D-amino acid oxidoreductase family protein  41.75 
 
 		 438 aa  327  2.0000000000000001e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70100  putative oxidoreductase  40.14 
 
 		 439 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0232  FAD dependent oxidoreductase  38.76 
 
 		 437 aa  323  5e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6084  putative oxidoreductase  39.43 
 
 		 439 aa  319  6e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2899  FAD dependent oxidoreductase  38.61 
 
 		 431 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0098  hypothetical protein  38.04 
 
 		 437 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0197  FAD dependent oxidoreductase  38.97 
 
 		 430 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00048613 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5529  FAD dependent oxidoreductase  38.28 
 
 		 436 aa  310  2e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2647  oxidoreductase  37.91 
 
 		 435 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2830  FAD dependent oxidoreductase  38.19 
 
 		 433 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5325  FAD dependent oxidoreductase  38.05 
 
 		 430 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0381154 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1162  FAD dependent oxidoreductase  37.44 
 
 		 435 aa  298  1e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.965544  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3196  FAD dependent oxidoreductase  37.2 
 
 		 435 aa  298  1e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0472268 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3014  FAD dependent oxidoreductase  37.56 
 
 		 435 aa  297  2e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1103  FAD dependent oxidoreductase  37.2 
 
 		 435 aa  296  6e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.988451  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1194  FAD dependent oxidoreductase  36.97 
 
 		 435 aa  295  8e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.202233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1090  FAD dependent oxidoreductase  36.97 
 
 		 435 aa  295  1e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.143362  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1127  FAD dependent oxidoreductase  35.78 
 
 		 435 aa  295  1e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1264  oxidoreductase  36.49 
 
 		 435 aa  291  1e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0942  FAD dependent oxidoreductase  37.2 
 
 		 435 aa  291  1e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2922  FAD dependent oxidoreductase  36.26 
 
 		 435 aa  286  5e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5183  FAD dependent oxidoreductase  38.12 
 
 		 430 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0718586 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5273  oxidoreductase, putative  38.12 
 
 		 430 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.194713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1057  FAD dependent oxidoreductase  35.31 
 
 		 435 aa  284  3.0000000000000004e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3004  FAD dependent oxidoreductase  35.78 
 
 		 435 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.917445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3101  FAD dependent oxidoreductase  36.02 
 
 		 435 aa  283  6.000000000000001e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0969  FAD dependent oxidoreductase  35.46 
 
 		 434 aa  280  4e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2124  FAD dependent oxidoreductase  35.55 
 
 		 427 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.509963  normal  0.340468 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28180  hypothetical protein  35.89 
 
 		 427 aa  263  6e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0347636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3188  FAD dependent oxidoreductase  37.28 
 
 		 428 aa  262  6.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0304337  hitchhiker  0.00908383 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2456  hypothetical protein  35.89 
 
 		 427 aa  262  6.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0482132  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1203  FAD dependent oxidoreductase  37.04 
 
 		 428 aa  262  1e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0141926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1112  FAD dependent oxidoreductase  36.79 
 
 		 428 aa  261  2e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000918343  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1170  FAD dependent oxidoreductase  36.79 
 
 		 428 aa  261  2e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000237219  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0950  FAD dependent oxidoreductase  35.41 
 
 		 440 aa  260  4e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0908  FAD dependent oxidoreductase  36.59 
 
 		 428 aa  259  6e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.314062  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1098  FAD dependent oxidoreductase  36.54 
 
 		 428 aa  258  1e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.289023  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1065  FAD dependent oxidoreductase  36.04 
 
 		 428 aa  258  1e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2914  FAD dependent oxidoreductase  36.3 
 
 		 428 aa  258  1e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00154313  normal  0.633175 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3005  FAD dependent oxidoreductase  35.85 
 
 		 428 aa  258  1e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.432332  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1909  FAD dependent oxidoreductase  36.27 
 
 		 427 aa  257  2e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.275266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3093  FAD dependent oxidoreductase  36.3 
 
 		 428 aa  258  2e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0147187  normal  0.775348 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1835  FAD dependent oxidoreductase  36.34 
 
 		 429 aa  258  2e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.508691 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2142  FAD dependent oxidoreductase  35.98 
 
 		 427 aa  257  3e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2996  FAD dependent oxidoreductase  36.3 
 
 		 428 aa  256  4e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0244962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2064  FAD dependent oxidoreductase  35.28 
 
 		 426 aa  256  5e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2694  hypothetical protein  34.92 
 
 		 427 aa  255  9e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.177617  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2528  FAD dependent oxidoreductase  36 
 
 		 429 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.642393 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1784  FAD dependent oxidoreductase  36.1 
 
 		 429 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2193  FAD dependent oxidoreductase  36.1 
 
 		 429 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2383  FAD dependent oxidoreductase  33.41 
 
 		 435 aa  254  3e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.155247  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2077  oxidoreductase  35.92 
 
 		 429 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2052  oxidoreductase  35.85 
 
 		 429 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2638  putative oxidoreductase  35.45 
 
 		 428 aa  253  6e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000755871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2427  FAD dependent oxidoreductase  35.7 
 
 		 427 aa  251  1e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.214399 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1949  FAD dependent oxidoreductase  34.56 
 
 		 427 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.764265  decreased coverage  0.00013363 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7678  FAD dependent oxidoreductase  33.49 
 
 		 430 aa  252  1e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.196419 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3245  FAD dependent oxidoreductase  34.8 
 
 		 427 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.363775  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2448  FAD dependent oxidoreductase  34.56 
 
 		 427 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1274  hypothetical protein  35.56 
 
 		 428 aa  251  2e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3524  FAD dependent oxidoreductase  34.56 
 
 		 427 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193766 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2176  FAD dependent oxidoreductase  36 
 
 		 429 aa  251  2e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.930184  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1938  FAD dependent oxidoreductase  36.25 
 
 		 429 aa  250  4e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4055  FAD dependent oxidoreductase  34.6 
 
 		 435 aa  249  6e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.80988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1943  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  34.2 
 
 		 426 aa  248  1e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2410  FAD dependent oxidoreductase  35.75 
 
 		 429 aa  248  1e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.269083  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01278  gamma-Glu-putrescine oxidase, FAD/NAD(P)-binding  33.96 
 
 		 426 aa  248  2e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.648235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2345  FAD dependent oxidoreductase  33.96 
 
 		 426 aa  248  2e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000869786  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1821  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  33.96 
 
 		 426 aa  248  2e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.151789 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01289  hypothetical protein  33.96 
 
 		 426 aa  248  2e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.667562  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2421  FAD dependent oxidoreductase  35.75 
 
 		 429 aa  248  2e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.347894  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1416  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  33.96 
 
 		 426 aa  248  2e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1975  FAD dependent oxidoreductase  34.52 
 
 		 427 aa  247  3e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.185752  normal  0.0484481 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1537  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  33.96 
 
 		 426 aa  247  3e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.263675  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1135  FAD dependent oxidoreductase  36.15 
 
 		 428 aa  247  3e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2324  FAD dependent oxidoreductase  33.73 
 
 		 426 aa  246  4e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1511  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  33.73 
 
 		 426 aa  246  4e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0935  putative oxidoreductase  35.11 
 
 		 430 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340528  normal  0.725116 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1198  FAD dependent oxidoreductase  33.73 
 
 		 433 aa  246  6.999999999999999e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4365  FAD dependent oxidoreductase  35.13 
 
 		 437 aa  246  8e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2625  FAD dependent oxidoreductase  33.57 
 
 		 423 aa  244  1.9999999999999999e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.526109  normal  0.108457 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4548  FAD dependent oxidoreductase  34.12 
 
 		 435 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20380  FAD-dependent oxidoreductase  34.9 
 
 		 427 aa  243  7e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1341  FAD dependent oxidoreductase  34.12 
 
 		 435 aa  242  1e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.268345  normal  0.168111 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3526  FAD dependent oxidoreductase  34.12 
 
 		 427 aa  241  2e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0175987  normal  0.130087 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3843  FAD dependent oxidoreductase  34.28 
 
 		 435 aa  240  4e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1899  oxidoreductase  34.02 
 
 		 449 aa  239  8e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.152308 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>