More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_1063 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1458  metabolite-proton symporter  98.61 
 
 		 432 aa  834    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.202966  normal  0.170493 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1469  major facilitator family transporter  84.49 
 
 		 438 aa  681    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0457955  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1278  citrate-proton symport  84.65 
 
 		 456 aa  684    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.258621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1015  general substrate transporter  88.43 
 
 		 438 aa  729    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.383043 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4161  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  97.91 
 
 		 433 aa  770    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.253916 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4263  general substrate transporter  97.91 
 
 		 433 aa  785    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15920  major facilitator transporter  84.05 
 
 		 437 aa  642    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.246808 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1063  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  100 
 
 		 432 aa  848    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3101  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  75.98 
 
 		 438 aa  622  1e-177  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2736  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  76.64 
 
 		 438 aa  622  1e-177  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1369  MFS family transporter  84.69 
 
 		 437 aa  617  1e-175  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1063  major facilitator superfamily MFS_1  75.12 
 
 		 435 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3419  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  75.35 
 
 		 435 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0863  general substrate transporter  74.94 
 
 		 437 aa  611  9.999999999999999e-175  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.139167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0512  general substrate transporter  75.78 
 
 		 483 aa  608  1e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.509539  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0851  general substrate transporter  74.94 
 
 		 437 aa  608  1e-173  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.80283  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0991  general substrate transporter  75.78 
 
 		 436 aa  608  1e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0201608  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2408  general substrate transporter  75.78 
 
 		 436 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4094  major facilitator transporter  75.54 
 
 		 436 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.237593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0951  general substrate transporter  75.78 
 
 		 436 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0663  general substrate transporter  75.35 
 
 		 435 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0269429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1576  metabolite:proton symporter family protein  76.56 
 
 		 506 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.342246  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2961  major facilitator superfamily permease  76.33 
 
 		 437 aa  593  1e-168  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3026  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  76.09 
 
 		 437 aa  591  1e-168  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2856  metabolite transport protein  75.36 
 
 		 439 aa  588  1e-167  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2106  metabolite:proton symporter family protein  76.09 
 
 		 437 aa  589  1e-167  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.22377  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0806  metabolite:proton symporter family protein  76.09 
 
 		 523 aa  590  1e-167  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.413485  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3059  metabolite:proton symporter family protein  76.09 
 
 		 489 aa  591  1e-167  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2638  metabolite:proton symporter family protein  76.09 
 
 		 437 aa  589  1e-167  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1974  metabolite:proton symporter family protein  76.09 
 
 		 437 aa  589  1e-167  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2710  major facilitator superfamily MFS_1  62.14 
 
 		 420 aa  461  1e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.703478 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3269  major facilitator superfamily MFS_1  60.56 
 
 		 436 aa  463  1e-129  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.643354  normal  0.0817814 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2487  major facilitator transporter  62.14 
 
 		 420 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2415  major facilitator superfamily MFS_1  63.11 
 
 		 420 aa  455  1e-127  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.510425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2238  major facilitator transporter  58.16 
 
 		 442 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.451405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4745  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  55.58 
 
 		 440 aa  426  1e-118  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0860  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  55.96 
 
 		 441 aa  425  1e-118  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2256  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  56.97 
 
 		 447 aa  427  1e-118  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.650686  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0644  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  55.5 
 
 		 442 aa  423  1e-117  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1269  multi-sensor signal transduction histidine kinase  53.66 
 
 		 839 aa  414  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.834147 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2036  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  57.31 
 
 		 433 aa  413  1e-114  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.70971  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3427  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  55.05 
 
 		 441 aa  413  1e-114  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3830  major facilitator transporter  55.74 
 
 		 463 aa  410  1e-113  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3302  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  53.92 
 
 		 444 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2850  General substrate transporter  53.32 
 
 		 437 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.290987  hitchhiker  0.00573587 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1314  General substrate transporter  48.09 
 
 		 470 aa  395  1e-109  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000012233 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3920  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  54.57 
 
 		 440 aa  396  1e-109  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.210524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4279  major facilitator transporter  54.46 
 
 		 426 aa  396  1e-109  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.646646 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1269  general substrate transporter  48.39 
 
 		 470 aa  398  1e-109  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.33062  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2079  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  53.46 
 
 		 436 aa  395  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.611047  hitchhiker  0.0017507 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1813  general substrate transporter  50.58 
 
 		 463 aa  392  1e-108  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0995372  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0706  major facilitator family transporter  54.69 
 
 		 426 aa  394  1e-108  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3923  major facilitator superfamily MFS_1  51.85 
 
 		 452 aa  394  1e-108  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0699267  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1832  general substrate transporter  50.58 
 
 		 463 aa  392  1e-108  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.326977  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1879  general substrate transporter  50.58 
 
 		 463 aa  392  1e-108  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1332  major facilitator superfamily MFS_1  53.11 
 
 		 433 aa  388  1e-107  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.423362 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30660  sugar phosphate permease  50.11 
 
 		 466 aa  391  1e-107  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.488584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2295  major facilitator superfamily MFS_1  51.74 
 
 		 452 aa  388  1e-107  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05660  metabolite-proton symporter  49.23 
 
 		 482 aa  385  1e-106  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.232091  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03371  predicted transporter  54.59 
 
 		 440 aa  382  1e-105  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03324  hypothetical protein  54.59 
 
 		 440 aa  382  1e-105  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3881  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  55.29 
 
 		 440 aa  383  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.148005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3816  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  55.29 
 
 		 440 aa  383  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3803  MFS transporter metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  55.29 
 
 		 440 aa  383  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3984  MFS transporter metabolite:H+ symporter family protein  55.29 
 
 		 440 aa  383  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.139706 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3925  MFS transporter/metabolite:H+ symporter family protein  55.29 
 
 		 440 aa  383  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0190  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  54.35 
 
 		 440 aa  380  1e-104  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4886  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  54.59 
 
 		 440 aa  381  1e-104  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3928  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  54.35 
 
 		 440 aa  380  1e-104  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4011  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  54.35 
 
 		 440 aa  379  1e-104  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00467  metabolite transport protein  51.82 
 
 		 412 aa  380  1e-104  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3827  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  54.35 
 
 		 440 aa  380  1e-104  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.151355 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1510  major facilitator transporter  51.53 
 
 		 425 aa  382  1e-104  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0194  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  54.35 
 
 		 440 aa  380  1e-104  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3726  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  54.35 
 
 		 440 aa  380  1e-104  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11030  Sugar (and other) transporter  48.88 
 
 		 472 aa  373  1e-102  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.267916  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2888  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  50.47 
 
 		 434 aa  374  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0536186  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4675  major facilitator transporter  49.89 
 
 		 628 aa  371  1e-101  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.85896  normal  0.483748 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3159  general substrate transporter  50.23 
 
 		 428 aa  364  2e-99  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.761686  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2691  general substrate transporter  48.1 
 
 		 445 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4973  major facilitator transporter  48.67 
 
 		 425 aa  357  2.9999999999999997e-97  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1295  general substrate transporter  52.81 
 
 		 423 aa  356  5.999999999999999e-97  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.659237  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2741  general substrate transporter  47.83 
 
 		 431 aa  354  1e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.879641  normal  0.395533 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1328  putative permease  45.94 
 
 		 436 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0662  major facilitator family transporter  50 
 
 		 393 aa  340  2.9999999999999998e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0161  major facilitator transporter  47.7 
 
 		 440 aa  338  9.999999999999999e-92  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7815  major facilitator superfamily MFS_1  46.56 
 
 		 442 aa  330  4e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4531  general substrate transporter  43.61 
 
 		 456 aa  322  7e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3744  General substrate transporter  42.44 
 
 		 465 aa  319  5e-86  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33020  arabinose efflux permease family protein  44.09 
 
 		 446 aa  314  1.9999999999999998e-84  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.471979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1587  major facilitator transporter  40.09 
 
 		 450 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4431  putative transmembrane transport protein (general substrate transporter)  41.53 
 
 		 468 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.90441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2766  permease of the major facilitator superfamily  45.41 
 
 		 427 aa  307  2.0000000000000002e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0928432  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3334  major facilitator superfamily protein  44.79 
 
 		 439 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.998489 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2127  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  43.45 
 
 		 441 aa  304  3.0000000000000004e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0076  major facilitator transporter  42.86 
 
 		 450 aa  301  1e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1490  major facilitator superfamily MFS_1  41.18 
 
 		 432 aa  300  3e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.81003  normal  0.0711824 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1794  major facilitator family transporter  40.28 
 
 		 433 aa  299  7e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0265236  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11224  integral membrane transport protein  42.15 
 
 		 425 aa  299  8e-80  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000679327  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0376  major facilitator family transporter  39.86 
 
 		 444 aa  298  1e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.538502  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>