More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1961 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_1961  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 
437 aa  885    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0839  Co/Zn/Cd cation transporter  51.31 
 
 
428 aa  421  1e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000456084  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1832  cation efflux system protein  31.12 
 
 
410 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0618  cation diffusion facilitator family transporter  30.41 
 
 
411 aa  177  4e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000865863  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0044  cation diffusion facilitator family transporter  31.33 
 
 
381 aa  173  5.999999999999999e-42  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1366  cation diffusion facilitator family transporter  28.21 
 
 
422 aa  157  3e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1276  cation diffusion facilitator family transporter  31.18 
 
 
416 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1360  cation diffusion facilitator family transporter  29.12 
 
 
396 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2100  cation diffusion facilitator family transporter  29.63 
 
 
310 aa  119  9e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.70845  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0567  cation diffusion facilitator family transporter  28.18 
 
 
402 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.714766  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2257  cation diffusion facilitator family transporter  26.97 
 
 
416 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2005  cation diffusion facilitator family transporter  26.21 
 
 
299 aa  114  3e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2012  hypothetical protein  28.12 
 
 
380 aa  114  5e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2017  hypothetical protein  27.68 
 
 
380 aa  112  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0936  cation diffusion facilitator family transporter  30.03 
 
 
300 aa  109  8.000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1144  cation efflux family protein  25.26 
 
 
289 aa  109  8.000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0182712  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1788  cation diffusion facilitator family transporter  27.49 
 
 
299 aa  109  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0431575 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2428  cation diffusion facilitator family transporter  27.08 
 
 
299 aa  109  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000439977  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2008  cation efflux family protein  25 
 
 
293 aa  108  2e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.536733  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1722  cation diffusion facilitator family transporter  24.74 
 
 
299 aa  107  4e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0983  cation efflux family protein  24.56 
 
 
289 aa  107  5e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0179207  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0634  cation efflux family protein  25.84 
 
 
314 aa  104  4e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3150  cation diffusion facilitator family transporter  27.78 
 
 
401 aa  102  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0321624 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0858  cation efflux protein  25.09 
 
 
299 aa  101  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3126  cation diffusion facilitator family transporter  26.6 
 
 
297 aa  101  3e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1794  cation diffusion facilitator family transporter  25.68 
 
 
299 aa  101  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1450  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  25.53 
 
 
378 aa  100  4e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.59644  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1517  cation diffusion facilitator family transporter  25.53 
 
 
378 aa  100  4e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4529  cation efflux family protein  25.93 
 
 
297 aa  100  4e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3458  cation diffusion facilitator family transporter  29.27 
 
 
413 aa  100  5e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1774  cation diffusion facilitator family transporter  25.68 
 
 
293 aa  100  6e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000103729  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1437  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  28.04 
 
 
303 aa  99.8  8e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.929913 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0706  cation efflux family protein  25.59 
 
 
297 aa  99.8  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4494  cation efflux family protein  25.93 
 
 
298 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4305  cation efflux family protein  25.93 
 
 
298 aa  98.6  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.901101  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4143  cation efflux family protein; cobalt-zinc-cadmium resistance protein  25.93 
 
 
297 aa  98.6  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4154  cation efflux family protein; cobalt-zinc-cadmium resistance protein  25.93 
 
 
298 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4490  cation efflux family protein  25.93 
 
 
297 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000013867 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4640  cation efflux family protein  25.93 
 
 
298 aa  98.6  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4544  cation efflux family protein  25.93 
 
 
297 aa  99  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04060  cation diffusion facilitator family transporter  26.57 
 
 
292 aa  98.2  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0491  cation diffusion facilitator family transporter  26.86 
 
 
354 aa  97.8  3e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0566502 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2443  cation diffusion facilitator family transporter  25.6 
 
 
288 aa  97.4  4e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2491  cation diffusion facilitator family transporter  25.6 
 
 
288 aa  97.4  4e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1861  cation diffusion facilitator family transporter  27.43 
 
 
292 aa  97.1  5e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.350904  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2889  cation diffusion facilitator family transporter  25.61 
 
 
388 aa  97.1  6e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000320508  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1752  cation diffusion facilitator family transporter  27.24 
 
 
301 aa  96.7  7e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00011926  normal  0.0299978 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2127  cation diffusion facilitator family transporter  25.09 
 
 
293 aa  95.9  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.139968  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0663  cation diffusion facilitator family transporter  24.83 
 
 
312 aa  95.5  1e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0132428  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4257  cation diffusion facilitator family transporter  25.59 
 
 
297 aa  95.1  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002221  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  28.96 
 
 
302 aa  95.5  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000518265  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0167  cation diffusion facilitator family transporter  29.08 
 
 
305 aa  94.7  3e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1214  cation diffusion facilitator family transporter  31.72 
 
 
406 aa  94  4e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0101557  hitchhiker  0.000000113777 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1496  cation diffusion facilitator family transporter  31.72 
 
 
400 aa  94  4e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2576  cation diffusion facilitator family transporter  25.35 
 
 
423 aa  94  5e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00102277 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1549  cation diffusion facilitator family transporter  23.88 
 
 
290 aa  93.6  6e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00146  ferrous iron efflux protein F  28.21 
 
 
302 aa  93.6  6e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0465  cation efflux family protein  25.58 
 
 
391 aa  93.6  7e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.326406  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0625  cation diffusion facilitator family transporter  25.58 
 
 
391 aa  93.6  7e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1220  cation efflux family protein  28.93 
 
 
376 aa  92.4  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3583  cation diffusion facilitator family transporter  25.33 
 
 
392 aa  92.8  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000126728  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2089  cation efflux protein  25.09 
 
 
296 aa  92  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.328738  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3033  cation efflux family protein  24.74 
 
 
293 aa  92.4  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2291  cation efflux family protein  24.74 
 
 
293 aa  92.4  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2418  cation efflux family protein  25.27 
 
 
293 aa  92  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0125  cation diffusion facilitator family transporter  28.09 
 
 
317 aa  91.7  2e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0195839  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2343  cation efflux family protein  24.91 
 
 
293 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.412902  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2239  cation diffusion facilitator family transporter  28.9 
 
 
305 aa  91.3  3e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.482091  normal  0.467458 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1668  cation diffusion facilitator family transporter  24.91 
 
 
291 aa  91.3  3e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0340924  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1146  cation efflux family protein  24.49 
 
 
411 aa  90.9  4e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00680044  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2098  cation diffusion facilitator family transporter  27.86 
 
 
285 aa  90.9  4e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2155  cation efflux family protein  24.74 
 
 
296 aa  90.5  5e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.112799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2093  cation efflux protein  24.74 
 
 
296 aa  90.5  5e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0345856  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2147  cation efflux system protein  26.18 
 
 
380 aa  90.5  5e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.809019  normal  0.389636 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2310  cation efflux family protein  24.74 
 
 
296 aa  90.5  5e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2334  cation efflux family protein  24.74 
 
 
293 aa  90.5  5e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2613  cation efflux family protein  24.39 
 
 
296 aa  90.1  7e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1011  cation diffusion facilitator family transporter  25.86 
 
 
289 aa  90.1  7e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2090  cation efflux family protein  29.45 
 
 
302 aa  89.7  9e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3649  cation efflux system protein  24.73 
 
 
384 aa  89.4  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.29953 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2262  ferrous iron efflux protein F  27.12 
 
 
302 aa  88.6  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000896639  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0074  cation diffusion facilitator family transporter  24.38 
 
 
313 aa  89  2e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1224  cation diffusion facilitator family transporter  25.36 
 
 
421 aa  88.2  3e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1417  cation diffusion facilitator family transporter  26.06 
 
 
384 aa  88.2  3e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0245  cation diffusion facilitator family transporter  23.16 
 
 
291 aa  87  6e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11850  cation diffusion facilitator family transporter  26.88 
 
 
312 aa  86.7  8e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0051  cation diffusion facilitator family transporter  23.88 
 
 
306 aa  86.3  0.000000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1127  cation diffusion facilitator family transporter  23.96 
 
 
323 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2256  cation diffusion facilitator family transporter  29.37 
 
 
332 aa  85.5  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00134926  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0051  cation diffusion facilitator family transporter  23.88 
 
 
306 aa  84.7  0.000000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1741  cation diffusion facilitator family transporter  27.4 
 
 
307 aa  84.7  0.000000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00244826  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1036  cation diffusion facilitator family transporter  25.17 
 
 
387 aa  84.3  0.000000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.246594  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0938  cation diffusion facilitator family transporter  27.66 
 
 
387 aa  84  0.000000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1215  cation diffusion facilitator family transporter  29.25 
 
 
302 aa  82.8  0.00000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.322219 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0858  cation efflux system protein  26.14 
 
 
331 aa  82  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20770  cation diffusion facilitator family transporter  27.31 
 
 
380 aa  82  0.00000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.799337  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0960  cation diffusion facilitator family transporter  23.51 
 
 
291 aa  81.3  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1700  cation diffusion facilitator family transporter  22.06 
 
 
293 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0374  cation diffusion facilitator family transporter  28.77 
 
 
303 aa  81.3  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2795  ferrous iron efflux protein F  26.55 
 
 
301 aa  81.3  0.00000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00102947  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>