62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0239 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012854  Rleg_6306  hypothetical protein  45.57 
 
 		 888 aa  710    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.990957 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4596  hypothetical protein  49.72 
 
 		 893 aa  872    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0239  hypothetical protein  100 
 
 		 894 aa  1835    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0875  hypothetical protein  29.58 
 
 		 712 aa  66.2  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2823  UvrD/Rep helicase family protein  25.99 
 
 		 691 aa  65.1  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.271387  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2615  UvrD/Rep helicase family protein  28.07 
 
 		 691 aa  65.1  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000204354  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5216  superfamily I DNA/RNA helicase  26.05 
 
 		 722 aa  64.7  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2539  UvrD/Rep helicase family protein  26.01 
 
 		 689 aa  64.3  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000078955  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2572  UvrD/Rep helicase family protein  26.01 
 
 		 689 aa  64.3  0.000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000433537  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2861  uvrD/Rep helicase family protein  26.01 
 
 		 689 aa  64.3  0.000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000106246  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2623  uvrD/Rep helicase family protein  26.01 
 
 		 689 aa  64.3  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000508135  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2814  uvrD/Rep helicase family protein  26.01 
 
 		 689 aa  64.3  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000183326  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2469  UvrD/Rep helicase family protein  25.55 
 
 		 691 aa  63.2  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00119782  normal  0.334322 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2821  uvrD/Rep helicase family protein  25.56 
 
 		 689 aa  62.8  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000164243 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2839  uvrD/Rep helicase family protein  26.01 
 
 		 689 aa  61.6  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000185117  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0025  UvrD/Rep helicase family protein  27.76 
 
 		 852 aa  60.8  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16000  DNA/RNA helicase, superfamily I  25.32 
 
 		 813 aa  57  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3121  UvrD/REP helicase  28.89 
 
 		 1033 aa  57  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7576  hypothetical protein  24.91 
 
 		 795 aa  57  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3796  putative helicase  29.63 
 
 		 735 aa  57  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1829  ATP-dependent DNA helicase  24.59 
 
 		 706 aa  55.8  0.000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4189  hypothetical protein  24.11 
 
 		 902 aa  54.3  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.060673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10650  DNA/RNA helicase, superfamily I  24.17 
 
 		 747 aa  53.9  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.85506  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0580  putative helicase  25.44 
 
 		 706 aa  53.1  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.937698  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1758  UvrD/REP helicase  29.14 
 
 		 1244 aa  52.4  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05840  DNA/RNA helicase, superfamily I  28.02 
 
 		 698 aa  51.6  0.00006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0355773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1311  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  23.95 
 
 		 748 aa  50.1  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0022  LexA repressor  22.09 
 
 		 819 aa  49.7  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000018035  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0355  UvrD/REP helicase  25.12 
 
 		 714 aa  48.5  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2268  ATP-dependent DNA helicase replicase  24.47 
 
 		 753 aa  48.1  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000472116  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0083  hypothetical protein  26.32 
 
 		 785 aa  48.5  0.0006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1050  hypothetical protein  24.46 
 
 		 702 aa  48.5  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1135  hypothetical protein  25 
 
 		 269 aa  48.5  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0285416  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2325  hypothetical protein  22.93 
 
 		 759 aa  48.1  0.0007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0788129  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0566  helicase, putative  24.88 
 
 		 706 aa  47.8  0.0008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.712813  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0809  LexA repressor  23.58 
 
 		 815 aa  48.1  0.0008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.642499  hitchhiker  0.0000861607 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1546  UvrD/REP helicase  25.94 
 
 		 564 aa  47.8  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.924385  hitchhiker  0.000024327 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4227  helicase, UvrD/Rep family  24.6 
 
 		 778 aa  47.4  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00019989  hitchhiker  0.000557099 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0461  UvrD/REP helicase  29.59 
 
 		 726 aa  47  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6025  UvrD/REP helicase  26.27 
 
 		 737 aa  47.4  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4831  ATP-dependent DNA helicase UvrD  23.19 
 
 		 704 aa  47.4  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.366653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3882  UvrD/REP helicase  23.19 
 
 		 704 aa  47.4  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.229228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1406  UvrD/REP helicase  25.86 
 
 		 708 aa  47.4  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.450912  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1592  hypothetical protein  24.35 
 
 		 776 aa  47.4  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.430325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4871  hypothetical protein  26.36 
 
 		 666 aa  46.6  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5811  ATP-dependent DNA helicase, UvrD/REP family  22.56 
 
 		 704 aa  47  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.859027 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1552  hypothetical protein  25.32 
 
 		 754 aa  46.2  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0457555  normal  0.0469841 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1206  helicase, UvrD/Rep family  24.59 
 
 		 777 aa  46.2  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2483  UvrD/REP helicase  28.24 
 
 		 1127 aa  45.8  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1108  hypothetical protein  22.17 
 
 		 593 aa  45.8  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.290007  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1808  UvrD/REP helicase  26.29 
 
 		 725 aa  45.4  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2052  UvrD/REP helicase  26.29 
 
 		 726 aa  45.8  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.322566  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2021  UvrD/REP helicase  26.8 
 
 		 745 aa  45.8  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.581041 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1110  hypothetical protein  19.92 
 
 		 702 aa  45.1  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.924141 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00160  DNA/RNA helicase, superfamily I  25.96 
 
 		 706 aa  45.1  0.006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.805287 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1075  helicase, UvrD/Rep family  25 
 
 		 777 aa  44.7  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1963  helicase  25.74 
 
 		 748 aa  44.7  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0108  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  23.53 
 
 		 804 aa  44.7  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3499  ATP-dependent DNA helicase UvrD  27.34 
 
 		 1089 aa  44.3  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1872  ATP-dependent DNA helicase UvrD  24.36 
 
 		 763 aa  44.3  0.009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1591  ATP-dependent DNA helicase UvrD  24.36 
 
 		 763 aa  44.7  0.009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.68447  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2122  UvrD/REP helicase  25.91 
 
 		 726 aa  44.3  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.370294  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>