More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2631 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2631  ABC transporter related  100 
 
 		 264 aa  539  9.999999999999999e-153  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000448343  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2291  ABC transporter related  54.55 
 
 		 255 aa  256  3e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000398246 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1805  ABC transporter related  49.6 
 
 		 259 aa  242  5e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1074  ABC transporter related  53.56 
 
 		 265 aa  237  1e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2008  ABC-type transport system, ATPase component  46.28 
 
 		 253 aa  223  3e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00806638  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0253  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  40.57 
 
 		 240 aa  159  3e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000710517  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0853  ABC methionine transporter, ATPase subunit  36.86 
 
 		 386 aa  154  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00389788  hitchhiker  0.00726443 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4539  ABC transporter related  37.15 
 
 		 386 aa  153  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.342354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1540  ABC transporter related  39.73 
 
 		 244 aa  152  5.9999999999999996e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00440464  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2681  ABC transporter related  38.11 
 
 		 372 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4687  ABC transporter related  36.92 
 
 		 391 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00669309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2304  ABC transporter related  39.22 
 
 		 360 aa  149  3e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.297775  normal  0.671211 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34270  putative ATP-binding component of ABC transporter  38.71 
 
 		 369 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00850133 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5216  ABC transporter related  37.8 
 
 		 391 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.329969 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1172  ABC transporter related  42.22 
 
 		 251 aa  146  3e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.867834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0236  ABC transporter-like  36.22 
 
 		 374 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.127209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2652  ABC transporter related  40 
 
 		 340 aa  145  5e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31520  ABC transporter, ATP-binding component  36.61 
 
 		 385 aa  144  1e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.100251  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2365  ABC transporter related  35.29 
 
 		 365 aa  144  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0817479  hitchhiker  0.00312127 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1172  ABC transporter related protein  44 
 
 		 269 aa  143  3e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.193419  normal  0.054455 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3079  ABC transporter related protein  35.86 
 
 		 342 aa  143  3e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3393  ABC transporter related  39.26 
 
 		 391 aa  143  3e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.671185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3485  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  37.87 
 
 		 335 aa  143  3e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.762526 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4992  ABC transporter related  37.24 
 
 		 369 aa  142  4e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2912  ABC transporter ATP-binding protein  37.75 
 
 		 366 aa  142  4e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.702011  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2926  ABC transporter related  36.25 
 
 		 342 aa  142  5e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000015869  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0311  ABC metal ion transporter, ATPase subunit  37.65 
 
 		 398 aa  142  5e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3225  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  39 
 
 		 382 aa  142  6e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.384288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3029  ABC transporter related  37.65 
 
 		 394 aa  142  6e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.193089  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0244  ABC transporter related  37.1 
 
 		 369 aa  142  6e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.177795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5337  ABC transporter related  37.65 
 
 		 394 aa  142  6e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.874002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4931  ABC transporter related  37.65 
 
 		 392 aa  142  8e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.247063  normal  0.893842 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1610  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  39 
 
 		 368 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0235  ABC transporter related  37.66 
 
 		 369 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.472278 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0350  ABC transporter  37.14 
 
 		 376 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.100794  normal  0.782008 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0483  ABC transporter related  33.19 
 
 		 342 aa  140  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000112326  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0563  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  37.3 
 
 		 356 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0496  ABC transporter related  33.19 
 
 		 342 aa  140  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000100343  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0785  ABC transporter related  36.11 
 
 		 425 aa  140  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2530  ABC transporter related  37.34 
 
 		 326 aa  139  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.484579  hitchhiker  0.00171141 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0220  ABC transporter ATP-binding protein  37.24 
 
 		 369 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.333916  hitchhiker  0.00688358 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5188  D-methionine ABC transporter, ATP-binding protein  37.3 
 
 		 343 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2821  ABC transporter, ATPase subunit  36.92 
 
 		 237 aa  139  4.999999999999999e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.341071  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0489  ABC transporter, ATP-binding protein  34.31 
 
 		 341 aa  139  6e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7234  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  38.79 
 
 		 384 aa  139  7e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.235387  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2604  ABC transporter related  38.5 
 
 		 354 aa  138  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2286  ABC transporter related  34.51 
 
 		 258 aa  138  8.999999999999999e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0145591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1771  ABC transporter related  35.15 
 
 		 340 aa  138  8.999999999999999e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.237525  hitchhiker  0.000187341 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0857  ABC transporter related protein  36.65 
 
 		 338 aa  137  1e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1503  ABC transporter related protein  32.74 
 
 		 350 aa  137  1e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0234  ABC transporter related  39.91 
 
 		 243 aa  137  1e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1894  ABC transporter-related protein  37.84 
 
 		 365 aa  138  1e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1431  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  38.39 
 
 		 256 aa  137  2e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0343  ABC transporter, ATP-binding protein  33.48 
 
 		 339 aa  137  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0297  ABC transporter ATP-binding protein  33.48 
 
 		 339 aa  137  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1467  ABC transporter related protein  37.14 
 
 		 222 aa  137  2e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0854  ABC transporter related  34.17 
 
 		 341 aa  137  2e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000171814  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0312  ABC transporter ATP-binding protein  33.48 
 
 		 339 aa  137  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5550  glutamine ABC transporter  37.71 
 
 		 507 aa  137  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.488891  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0838  ABC transporter related  34.17 
 
 		 341 aa  137  2e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00107302  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3606  ABC transporter related  33.89 
 
 		 566 aa  137  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0477  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  34.4 
 
 		 252 aa  137  2e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0297  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  35.71 
 
 		 375 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0082  ABC transporter related protein  35.87 
 
 		 367 aa  136  3.0000000000000003e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.193863  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2430  hypothetical protein  36.55 
 
 		 345 aa  136  3.0000000000000003e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0121441  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5613  ABC transporter related  36.91 
 
 		 388 aa  136  3.0000000000000003e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.309158  normal  0.370742 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0358  ABC transporter, ATP-binding protein  33.48 
 
 		 339 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0961  ABC transporter, ATP-binding protein  38.84 
 
 		 352 aa  135  5e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22300  ABC transporter related  37.5 
 
 		 352 aa  135  5e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.321678  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1769  ABC transporter related  36.32 
 
 		 344 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000333241  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3856  DL-methionine transporter subunit  36.93 
 
 		 274 aa  135  6.0000000000000005e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0471  ABC transporter related  33.78 
 
 		 240 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.185653  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0281  ABC transporter, ATP-binding protein  33.48 
 
 		 339 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2860  ABC transporter related  36.16 
 
 		 242 aa  135  7.000000000000001e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1395  ABC transporter related  40.19 
 
 		 337 aa  135  7.000000000000001e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11080  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  32.02 
 
 		 643 aa  135  8e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0341  ABC transporter, ATP-binding protein  33.48 
 
 		 339 aa  135  9e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1292  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  38.63 
 
 		 250 aa  135  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000759261 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0385  ABC transporter, ATP-binding protein  33.48 
 
 		 339 aa  135  9e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0284  ABC transporter, ATP-binding protein  33.04 
 
 		 339 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1439  ABC transporter, ATP-binding protein  36.44 
 
 		 361 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1867  ABC transporter, ATP-binding protein  36.44 
 
 		 380 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0621935  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4962  ABC transporter, ATP-binding protein  33.48 
 
 		 339 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1974  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  36.77 
 
 		 335 aa  134  9.999999999999999e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00627012  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3862  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  34.75 
 
 		 360 aa  134  9.999999999999999e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.000929662  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2174  methionine ABC transporter ATP-binding protein  36.44 
 
 		 404 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0546  methionine ABC transporter ATP-binding protein  35.92 
 
 		 405 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0448  methionine ABC transporter ATP-binding protein  36.44 
 
 		 404 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0858  methionine ABC transporter ATP-binding protein  36.44 
 
 		 404 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2373  ABC transporter related  41.09 
 
 		 225 aa  133  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6988  ABC transporter related  36.03 
 
 		 265 aa  133  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.741907  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0931  ABC transporter related protein  35.9 
 
 		 265 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5881  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.5 
 
 		 502 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.901977  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3993  ABC transporter related  36.14 
 
 		 253 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.564938  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2019  ABC transporter related  37.5 
 
 		 257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000471026 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0902  ABC transporter, ATP-binding protein  38.39 
 
 		 352 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.693076  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0292  ABC transporter related  32.61 
 
 		 339 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3652  ABC transporter related  33.47 
 
 		 339 aa  134  1.9999999999999998e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0494  glutamate/aspartate ABC transporter, ATP-binding protein  33.47 
 
 		 242 aa  133  3e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3791  ABC transporter related  36.03 
 
 		 377 aa  133  3e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.407755  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>