More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2405 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_2405  transposase IS200-family protein  100 
 
 
147 aa  305  1.0000000000000001e-82  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.585077  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1416  transposase IS200-family protein  95.24 
 
 
147 aa  295  1e-79  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0553663  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1291  transposase IS200-family protein  95.24 
 
 
147 aa  295  1e-79  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.254589  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1776  hypothetical protein  66.67 
 
 
135 aa  206  1e-52  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.208218 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1732  hypothetical protein  65.93 
 
 
135 aa  203  7e-52  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1731  hypothetical protein  65.93 
 
 
135 aa  203  7e-52  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1768  hypothetical protein  66.92 
 
 
130 aa  197  3.9999999999999996e-50  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.3207 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1829  hypothetical protein  66.15 
 
 
130 aa  195  2.0000000000000003e-49  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.615719 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1907  hypothetical protein  66.15 
 
 
130 aa  195  2.0000000000000003e-49  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1740  hypothetical protein  66.15 
 
 
130 aa  195  2.0000000000000003e-49  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.431395 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0866  hypothetical protein  62.9 
 
 
128 aa  176  1e-43  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.291609 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1248  hypothetical protein  43.38 
 
 
149 aa  123  8.000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2521  hypothetical protein  43.38 
 
 
149 aa  123  8.000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.167581  normal  0.919891 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3734  hypothetical protein  43.38 
 
 
149 aa  123  9e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.231376  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3107  hypothetical protein  42.65 
 
 
149 aa  121  4e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.563963  normal  0.438029 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0471  ISCpe2, transposase orfA  34.75 
 
 
123 aa  94.7  4e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0546  ISCpe2, transposase orfA  34.71 
 
 
187 aa  94.7  4e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1566  ISCpe2, transposase orfA  34.75 
 
 
123 aa  94.4  5e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.414707  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1392  transposase IS200-family protein  35.71 
 
 
138 aa  92  2e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000879011  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4295  transposase IS200-family protein  36.36 
 
 
134 aa  91.3  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000924983  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1584  ISCpe2, transposase orfA  33.88 
 
 
187 aa  90.5  7e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00754423  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2662  transposase IS200-family protein  32.79 
 
 
136 aa  90.5  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0805746 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0722  ISCpe2, transposase orfA  33.88 
 
 
133 aa  89.7  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1050  ISCpe2, transposase orfA  33.88 
 
 
133 aa  89.7  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00601796  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2480  transposase IS200-family protein  30.53 
 
 
134 aa  89.4  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3671  transposase IS200-family protein  36 
 
 
148 aa  89.4  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0900  transposase IS200-family protein  34.85 
 
 
134 aa  88.2  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000129244  hitchhiker  0.000000040473 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3803  transposase IS200-family protein  34.85 
 
 
134 aa  88.6  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2706  transposase IS200-family protein  33.87 
 
 
135 aa  86.3  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000307222  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0456  transposase IS200-family protein  34.09 
 
 
134 aa  85.5  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.176435 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0416  transposase IS200-family protein  34.09 
 
 
134 aa  85.5  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.179707  normal  0.0295664 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3851  transposase IS200-family protein  34.09 
 
 
134 aa  85.5  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0764343  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3555  transposase IS200-family protein  34.09 
 
 
134 aa  85.5  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1192  transposase IS200-family protein  34.09 
 
 
134 aa  85.1  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.541746  normal  0.0271846 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0189  transposase IS200-family protein  33.86 
 
 
132 aa  84  6e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3001  transposase IS200-family protein  33.86 
 
 
132 aa  84  6e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000296892  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2847  transposase IS200-family protein  33.86 
 
 
132 aa  84  6e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2179  transposase IS200-family protein  33.86 
 
 
132 aa  84  6e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.258783  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2038  transposase IS200-family protein  33.86 
 
 
132 aa  84  6e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2592  transposase  33.59 
 
 
134 aa  83.6  9e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.319874  normal  0.0632269 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1655  transposase  32.82 
 
 
134 aa  83.2  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0406  ISCpe2, transposase orfA  33 
 
 
105 aa  81.6  0.000000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0678  ISCpe2, transposase orfA  33 
 
 
105 aa  81.6  0.000000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3700  transposase  32.03 
 
 
134 aa  80.9  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00073433  normal  0.118807 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0876  transposase IS200-family protein  35.2 
 
 
133 aa  80.9  0.000000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000039435  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2667  transposase IS200-family protein  33.06 
 
 
137 aa  80.9  0.000000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.370645  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0625  ISCpe2, transposase orfA  33 
 
 
105 aa  79.7  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.274622  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2011  transposase IS200-family protein  30.3 
 
 
134 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.206349  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2487  transposase IS200-family protein  35 
 
 
133 aa  76.3  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0571  transposase IS200-family protein  36.28 
 
 
149 aa  75.5  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0483  transposase IS200-family protein  32.82 
 
 
143 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000534402  hitchhiker  0.000799973 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3010  transposase IS200-family protein  33.56 
 
 
145 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00254942  normal  0.0411213 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1391  transposase  28.24 
 
 
138 aa  73.6  0.000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.01496  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2336  transposase IS200-family protein  33.56 
 
 
145 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00527221  hitchhiker  0.00384725 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2998  transposase IS200-family protein  30.16 
 
 
142 aa  73.2  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0718  transposase IS200-family protein  31.97 
 
 
145 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000304427  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2359  transposase IS200-family protein  31.97 
 
 
145 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00152656  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2843  transposase IS200-family protein  33.56 
 
 
145 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.654156  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0666  transposase  29.03 
 
 
146 aa  71.6  0.000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00248601  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1527  transposase IS200-family protein  32.88 
 
 
145 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.538316  hitchhiker  0.000748783 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1279  transposase IS200-family protein  30.36 
 
 
138 aa  72  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.319746  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2203  transposase IS200-family protein  30.4 
 
 
140 aa  71.2  0.000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5481  transposase IS200-family protein  31.48 
 
 
142 aa  71.2  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675618  normal  0.728721 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2322  transposase IS200-family protein  33 
 
 
111 aa  71.2  0.000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0751  IS1004 transposase  32.06 
 
 
145 aa  70.9  0.000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.627984  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0956  IS1004 transposase  32.06 
 
 
145 aa  70.9  0.000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0130063  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1025  IS1004 transposase  32.06 
 
 
145 aa  70.9  0.000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0396  IS1004 transposase  32.06 
 
 
145 aa  70.9  0.000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1777  IS1004 transposase  32.06 
 
 
145 aa  70.9  0.000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000140938  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2638  transposase  33.08 
 
 
155 aa  70.5  0.000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00248173  normal  0.153291 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0596  IS1004 transposase  30.37 
 
 
148 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0667135  normal  0.0252158 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0918  IS1004 transposase  30.37 
 
 
148 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000517602  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1318  IS1004 transposase  30.37 
 
 
148 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.878127  normal  0.306742 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2412  IS1004 transposase  30.37 
 
 
148 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.891566 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2602  transposase IS200-family protein  30.37 
 
 
148 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000886257  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2942  IS1004 transposase  30.37 
 
 
148 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0661505 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3464  IS1004 transposase  30.37 
 
 
148 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0226  transposase IS200-family protein  31.82 
 
 
114 aa  69.7  0.00000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.262027  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2645  transposase IS200-family protein  32.26 
 
 
130 aa  69.3  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.329226  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1624  transposase IS200-family protein  31.82 
 
 
114 aa  68.9  0.00000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0445  transposase  32.33 
 
 
155 aa  68.2  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.713424  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0631  transposase  32.33 
 
 
155 aa  68.2  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1189  transposase  32.33 
 
 
155 aa  68.2  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2595  transposase  32.33 
 
 
155 aa  68.2  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0602972  normal  0.532476 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1220  IS1004 transposase  31.3 
 
 
145 aa  68.2  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1061  transposase IS200-family protein  31.82 
 
 
114 aa  68.6  0.00000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000187009  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0653  transposase  32.28 
 
 
160 aa  67.8  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1129  transposase IS200-family protein  29.03 
 
 
130 aa  67.8  0.00000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3227  transposase IS200-family protein  29.03 
 
 
130 aa  67.8  0.00000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4236  transposase IS200-family protein  25 
 
 
142 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00495198 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1083  transposase IS200-family protein  33.05 
 
 
133 aa  67.4  0.00000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.417666  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2841  transposase IS200-family protein  27.2 
 
 
134 aa  67.4  0.00000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110014  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2146  IS1004 transposase  31.3 
 
 
145 aa  67  0.00000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000124664  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1928  transposase IS200-family protein  29.46 
 
 
136 aa  67  0.00000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1561  IS1004 transposase  29.63 
 
 
148 aa  67  0.00000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.70736  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1021  transposase IS200-family protein  29.46 
 
 
121 aa  66.2  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2570  transposase IS200-family protein  27.2 
 
 
133 aa  66.6  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0574  transposase IS200-family protein  28.45 
 
 
129 aa  66.6  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0990  transposase IS200-family protein  28.45 
 
 
129 aa  66.6  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0881  transposase  31.97 
 
 
133 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0017451  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>