More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1942 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_1942  protein of unknown function DUF323  100 
 
 
517 aa  1075    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00637394  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2233  protein of unknown function DUF323  55.04 
 
 
398 aa  449  1e-125  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00201731  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2479  protein of unknown function DUF323  52.69 
 
 
398 aa  431  1e-119  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0900  hypothetical protein  65.37 
 
 
826 aa  414  1e-114  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0902  hypothetical protein  70.32 
 
 
586 aa  413  1e-114  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.530608  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1490  hypothetical protein  66.79 
 
 
742 aa  380  1e-104  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00271295  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1944  protein of unknown function DUF323  62.63 
 
 
829 aa  377  1e-103  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.550405  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2378  protein of unknown function DUF323  66.67 
 
 
433 aa  362  8e-99  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1696  hypothetical protein  66.67 
 
 
751 aa  359  7e-98  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0869805  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0037  hypothetical protein  60.55 
 
 
325 aa  347  3e-94  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1976  protein of unknown function DUF323  52.35 
 
 
319 aa  335  9e-91  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.300253  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1079  protein of unknown function DUF323  58.46 
 
 
267 aa  311  2e-83  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000235261  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1040  protein of unknown function DUF323  51.66 
 
 
517 aa  263  6e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0229948  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1939  glycoside hydrolase family 16  50.59 
 
 
566 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000600804  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3099  protein of unknown function DUF323  42.59 
 
 
269 aa  183  7e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2415  hypothetical protein  41.73 
 
 
603 aa  182  9.000000000000001e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2454  protein of unknown function DUF323  35.62 
 
 
1132 aa  179  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0264144 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1036  serine/threonine protein kinase  41.35 
 
 
617 aa  179  1e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.92194  normal  0.529135 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2136  hypothetical protein  39.35 
 
 
1911 aa  176  7e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3719  hypothetical protein  41.03 
 
 
527 aa  175  1.9999999999999998e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.680492 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1731  hypothetical protein  40.58 
 
 
877 aa  172  1e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3102  protein of unknown function DUF323  41.11 
 
 
740 aa  172  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0461  serine/threonine protein kinase  39.56 
 
 
621 aa  172  2e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0460  serine/threonine protein kinase  40.52 
 
 
620 aa  170  5e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4351  serine/threonine protein kinase  37.11 
 
 
882 aa  169  8e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2071  hypothetical protein  41.26 
 
 
892 aa  168  2e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.481243 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  41.11 
 
 
820 aa  168  2.9999999999999998e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4101  protein of unknown function DUF323  38.96 
 
 
358 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.664344  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0462  serine/threonine protein kinase  35.85 
 
 
625 aa  167  5e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2689  hypothetical protein  40 
 
 
781 aa  167  5e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.36496  decreased coverage  0.00230732 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2077  hypothetical protein  39.71 
 
 
636 aa  167  5.9999999999999996e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.189777  normal  0.779158 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2829  serine/threonine protein kinase  40.66 
 
 
593 aa  165  2.0000000000000002e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.565868 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3524  hypothetical protein  35.69 
 
 
802 aa  165  2.0000000000000002e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.316986  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4304  hypothetical protein  39.04 
 
 
862 aa  163  7e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0966898  normal  0.160271 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2507  protein of unknown function DUF323  36.14 
 
 
538 aa  161  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3565  protein of unknown function DUF323  37.87 
 
 
925 aa  159  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233339 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3529  hypothetical protein  38.35 
 
 
929 aa  159  1e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2998  protein of unknown function DUF323  32.26 
 
 
351 aa  158  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.012467  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0463  serine/threonine protein kinase  38.35 
 
 
637 aa  158  2e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3065  protein of unknown function DUF323  35.48 
 
 
1104 aa  157  4e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.34453 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2006  hypothetical protein  39.84 
 
 
522 aa  155  1e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.6079 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1912  protein of unknown function DUF323  32.83 
 
 
346 aa  155  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0442791 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2017  hypothetical protein  36.72 
 
 
287 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000795883  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2831  serine/threonine protein kinase  36.9 
 
 
618 aa  154  4e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.314695 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3760  serine/threonine protein kinase  37.82 
 
 
637 aa  154  5e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.272912  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5054  Serine/threonine protein kinase  34.74 
 
 
616 aa  153  5.9999999999999996e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.688753 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3128  protein of unknown function DUF323  36.81 
 
 
348 aa  153  8.999999999999999e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2158  hypothetical protein  35.81 
 
 
664 aa  152  1e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.653369  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4459  hypothetical protein  35.88 
 
 
390 aa  152  2e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0669008 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4743  protein of unknown function DUF323  33.7 
 
 
426 aa  152  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3855  hypothetical protein  36.16 
 
 
348 aa  150  6e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2390  protein of unknown function DUF323  39.92 
 
 
293 aa  149  1.0000000000000001e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0264886  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4550  hypothetical protein  35.69 
 
 
287 aa  149  1.0000000000000001e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2193  protein of unknown function DUF323  27.5 
 
 
453 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1727  hypothetical protein  36.75 
 
 
305 aa  145  1e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.172162  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26230  hypothetical protein  36.33 
 
 
312 aa  145  2e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0447  protein of unknown function DUF323  32.53 
 
 
489 aa  144  4e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0670  protein of unknown function DUF323  33.92 
 
 
654 aa  144  5e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0247  serine/threonine protein kinase  34.92 
 
 
623 aa  141  1.9999999999999998e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.171781  decreased coverage  0.00306578 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2228  hypothetical protein  35.79 
 
 
1196 aa  142  1.9999999999999998e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.245656 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1004  protein of unknown function DUF323  36.98 
 
 
298 aa  140  3.9999999999999997e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.302602  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1893  hypothetical protein  33.76 
 
 
1581 aa  140  4.999999999999999e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3074  hypothetical protein  36.5 
 
 
620 aa  140  7.999999999999999e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2480  protein of unknown function DUF323  29.52 
 
 
584 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3574  protein of unknown function DUF323  37.36 
 
 
768 aa  139  1e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1837  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.91 
 
 
349 aa  139  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4811  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.55 
 
 
303 aa  139  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2069  hypothetical protein  36.9 
 
 
281 aa  138  2e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.425192  normal  0.19976 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1714  hypothetical protein  35.52 
 
 
301 aa  138  2e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4035  serine/threonine protein kinase  36.26 
 
 
639 aa  136  8e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4072  serine/threonine protein kinase  36.26 
 
 
639 aa  136  8e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.228125  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3768  hypothetical protein  35.32 
 
 
289 aa  135  1.9999999999999998e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3062  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.75 
 
 
308 aa  134  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.349109 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1921  serine/threonine protein kinase  31.17 
 
 
715 aa  133  9e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.12165  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0932  protein of unknown function DUF323  34.08 
 
 
338 aa  132  1.0000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1204  protein of unknown function DUF323  30.7 
 
 
330 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.578332 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2718  hypothetical protein  33.44 
 
 
292 aa  131  3e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4405  protein of unknown function DUF323  33.22 
 
 
334 aa  130  5.0000000000000004e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.629157  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3248  hypothetical protein  33.22 
 
 
416 aa  130  6e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000238215  normal  0.26381 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3987  RecF protein  34.55 
 
 
338 aa  127  6e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.462952 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2585  hypothetical protein  33.8 
 
 
692 aa  127  7e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0674734  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6095  protein of unknown function DUF323  34.47 
 
 
319 aa  126  8.000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0112  hypothetical protein  30.25 
 
 
331 aa  126  9e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.379229  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3179  protein of unknown function DUF323  33.66 
 
 
351 aa  125  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1864  protein of unknown function DUF323  34.83 
 
 
668 aa  124  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0907  protein of unknown function DUF323  33.94 
 
 
359 aa  124  3e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2087  hypothetical protein  33.81 
 
 
600 aa  124  4e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2008  hypothetical protein  30.29 
 
 
549 aa  124  5e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00418  hypothetical protein  32.63 
 
 
556 aa  124  5e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.56953  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1144  hypothetical protein  36.14 
 
 
300 aa  124  5e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.617976  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0228  protein of unknown function DUF323  32.21 
 
 
276 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1702  hypothetical protein  28.71 
 
 
510 aa  120  4.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4529  Sulfatase-modifying factor (C-alpha-formyglycine- generating enzyme) DUF323  29.23 
 
 
408 aa  120  7e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.126312  normal  0.048963 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0897  hypothetical protein  36.23 
 
 
291 aa  119  9e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000129772  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4067  protein of unknown function DUF323  31.76 
 
 
336 aa  119  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000050809  hitchhiker  0.0000128924 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0556  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  35.19 
 
 
554 aa  119  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0734765  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2895  hypothetical protein  29.75 
 
 
409 aa  117  5e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2134  hypothetical protein  30.88 
 
 
384 aa  117  6e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00361005 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2385  protein of unknown function DUF323  34.06 
 
 
263 aa  116  7.999999999999999e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0211254  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1433  protein of unknown function DUF323  33.44 
 
 
358 aa  116  8.999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.331628 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>