233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0979 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_0979  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  100 
 
 
370 aa  754    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0897  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  76.15 
 
 
365 aa  566  1e-160  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.159363  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0400  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  76.15 
 
 
369 aa  560  1e-158  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0534457  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1792  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  73.51 
 
 
368 aa  544  1e-153  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.344281  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0937  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  72.4 
 
 
372 aa  535  1e-151  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1423  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  73.91 
 
 
366 aa  527  1e-148  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1535  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  69.84 
 
 
365 aa  508  1e-143  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.292172  normal  0.0217876 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3127  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  50.68 
 
 
411 aa  303  2.0000000000000002e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3260  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  47.06 
 
 
392 aa  298  8e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0257772 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3746  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  45.15 
 
 
392 aa  295  7e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0605815  hitchhiker  0.0000012212 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0262  chlorophyllide reductase, BchX subunit  45.34 
 
 
333 aa  238  2e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1906  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  45.34 
 
 
333 aa  238  2e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.195312  normal  0.342059 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4001  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  43.81 
 
 
332 aa  233  3e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.18225  hitchhiker  0.00239808 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0179  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  45.45 
 
 
332 aa  233  3e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6437  bacteriochlorophyllide reductase subunit  43.65 
 
 
332 aa  231  1e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.967786  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2036  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  46.62 
 
 
333 aa  229  4e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.128879  normal  0.148477 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2052  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  42.5 
 
 
329 aa  229  8e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0401365 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1710  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  43.18 
 
 
332 aa  228  2e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1293  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  49.19 
 
 
331 aa  228  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.579367  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3517  bacteriachlorophyllide reductase iron protein subunit X  44.03 
 
 
335 aa  227  3e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.326677 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2980  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  44.48 
 
 
322 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.551452  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1610  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  45.39 
 
 
308 aa  226  6e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3756  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  42.6 
 
 
332 aa  225  8e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00499393 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2852  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  45.83 
 
 
334 aa  223  3e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.467181 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2957  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  45.58 
 
 
334 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.562644  normal  0.106043 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2818  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  42.73 
 
 
334 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.292291  normal  0.370983 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2730  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  46.6 
 
 
334 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.44114  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3697  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  50.65 
 
 
334 aa  210  3e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.326081  hitchhiker  0.00364932 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0506  nitrogenase reductase-like protein  42.41 
 
 
290 aa  171  2e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0237  Nitrogenase  44.5 
 
 
272 aa  169  6e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.848648  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1152  nitrogenase reductase-like protein  43.11 
 
 
292 aa  169  1e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1616  NifH/frxC-family protein  46.88 
 
 
276 aa  165  1.0000000000000001e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0803  nitrogenase reductase-like protein  37.69 
 
 
292 aa  162  6e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.186385  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0793  nitrogenase  38.55 
 
 
280 aa  162  8.000000000000001e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00476725  normal  0.0446468 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1815  Nitrogenase  43.58 
 
 
251 aa  160  2e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1528  nitrogenase reductase-like protein  37.79 
 
 
313 aa  160  2e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1147  nitrogenase reductase-like protein  36.68 
 
 
292 aa  160  4e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0774  nitrogenase  38.35 
 
 
290 aa  159  7e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1201  nitrogenase iron protein  36.76 
 
 
273 aa  159  9e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0404  NifH/frxC-family protein  40.08 
 
 
731 aa  159  1e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.394931 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0171  nitrogenase reductase  40.55 
 
 
273 aa  157  2e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.217628  normal  0.670038 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2083  nitrogenase  46.07 
 
 
270 aa  157  2e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0165  nitrogenase iron protein subunit NifH  41.07 
 
 
268 aa  157  2e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1908  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  41.52 
 
 
273 aa  157  4e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00331132 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1813  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  40.45 
 
 
276 aa  157  4e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1538  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  41.07 
 
 
273 aa  156  6e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000698797 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0217  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  40 
 
 
276 aa  155  8e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4043  nitrogenase iron protein  35.57 
 
 
273 aa  155  8e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0162942 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2192  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  40 
 
 
275 aa  154  2e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1353  nitrogenase iron protein  42.42 
 
 
292 aa  154  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000220216  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0326  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  40.45 
 
 
275 aa  154  2e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0117283  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2027  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  40.18 
 
 
275 aa  154  2.9999999999999998e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0592137 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1007  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  40 
 
 
297 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.474133 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2907  nitrogenase iron protein  41.55 
 
 
289 aa  153  4e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1224  nitrogenase reductase-like protein  41.36 
 
 
278 aa  153  4e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2886  Nitrogenase  38.91 
 
 
290 aa  153  5e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.781168  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1751  nitrogenase reductase  43.88 
 
 
274 aa  153  5.9999999999999996e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.555016  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1949  nitrogenase reductase  41.18 
 
 
274 aa  152  7e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00645764  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3978  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  40.72 
 
 
312 aa  152  8.999999999999999e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.475922  normal  0.178633 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1627  nitrogenase reductase  40.81 
 
 
274 aa  152  1e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000481616  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2258  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  39.27 
 
 
275 aa  151  1e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00421326  normal  0.488321 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0795  nitrogenase iron protein  43.16 
 
 
291 aa  151  1e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.835028  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0408  nitrogenase  37.89 
 
 
254 aa  152  1e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1019  nitrogenase reductase  42.47 
 
 
274 aa  152  1e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.855562  normal  0.490785 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2597  nitrogenase iron protein  43.68 
 
 
289 aa  151  2e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.036256  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1621  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  36.27 
 
 
299 aa  150  2e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.534029  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0741  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  36.46 
 
 
296 aa  151  2e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3537  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  39.09 
 
 
299 aa  151  2e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2386  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  40 
 
 
275 aa  151  2e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1733  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  40 
 
 
312 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4813  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  36.46 
 
 
297 aa  150  3e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.124271  normal  0.0880049 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0095  Nitrogenase  42.49 
 
 
299 aa  150  3e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0288  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  38.6 
 
 
297 aa  150  5e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0685  nitrogenase reductase  41.1 
 
 
274 aa  149  5e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1931  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  38.6 
 
 
297 aa  150  5e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.47686 
 
 
-
 
NC_002936  DET1158  nitrogenase reductase  39.11 
 
 
274 aa  149  7e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1528  nitrogenase reductase  41.1 
 
 
274 aa  149  8e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1395  nitrogenase reductase  39.45 
 
 
275 aa  149  8e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1041  nitrogenase iron protein subunit NifH  43.75 
 
 
248 aa  149  8e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.343788  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1845  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  35.74 
 
 
297 aa  149  9e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0704164 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5280  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  36.1 
 
 
297 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.174082  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5358  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  36.82 
 
 
297 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.142804  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1937  nitrogenase  41.74 
 
 
272 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.894359  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1872  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  36.43 
 
 
296 aa  147  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1244  nitrogenase reductase  41.1 
 
 
274 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000240583  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05971  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  36.43 
 
 
296 aa  147  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.848004  normal  0.641306 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0620  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  40.45 
 
 
295 aa  147  3e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.0000136812  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0744  nitrogenase reductase  40.64 
 
 
274 aa  147  3e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3478  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  40.64 
 
 
273 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1023  nitrogenase iron protein  38.71 
 
 
275 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0561  nitrogenase iron protein  35 
 
 
276 aa  146  6e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.0000368653  normal  0.199489 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2703  nitrogen fixation protein NifH/NifE  42.56 
 
 
746 aa  146  7.0000000000000006e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.15509 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1142  nitrogenase iron protein  37.79 
 
 
276 aa  146  7.0000000000000006e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.442855  normal  0.809863 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0280  NifH/frxC  38.6 
 
 
728 aa  146  7.0000000000000006e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.359044  normal  0.513981 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0158  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  38.91 
 
 
319 aa  146  7.0000000000000006e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07931  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  36.65 
 
 
296 aa  145  9e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2821  nitrogenase iron protein  36.19 
 
 
272 aa  145  9e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.436411  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2008  nitrogenase iron protein  37.61 
 
 
324 aa  144  2e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.221735  normal  0.365396 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1634  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  39.09 
 
 
301 aa  145  2e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.948044  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05451  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  35.71 
 
 
296 aa  145  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.240538  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>