More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0696 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0696  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  100 
 
 		 248 aa  505  9.999999999999999e-143  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1616  RNA methyltransferase TrmH, group 3  83.06 
 
 		 248 aa  434  1e-121  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.439996 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0572  RNA methyltransferase  79.76 
 
 		 252 aa  422  1e-117  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1731  RNA methyltransferase TrmH, group 3  87.04 
 
 		 248 aa  400  9.999999999999999e-111  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0619  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  76.61 
 
 		 248 aa  391  1e-108  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0590  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  70.95 
 
 		 247 aa  343  2e-93  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0629521 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0533  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  71.67 
 
 		 243 aa  330  9e-90  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2420  RNA methyltransferase  36.63 
 
 		 289 aa  172  3.9999999999999995e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00228978  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2734  RNA methyltransferase  36.21 
 
 		 289 aa  171  9e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0609  RNA methyltransferase TrmH  38.71 
 
 		 254 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0802048 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0848  RNA methyltransferase  36.36 
 
 		 247 aa  165  5e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000264025  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2730  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  39.27 
 
 		 255 aa  164  2.0000000000000002e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.751116  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2280  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  39.26 
 
 		 256 aa  161  7e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1270  RNA methyltransferase  38.06 
 
 		 251 aa  160  2e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.907902  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2230  RNA methyltransferase  38.93 
 
 		 245 aa  160  2e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.329348  normal  0.0204347 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1583  RNA methyltransferase TrmH, group 3  38.43 
 
 		 256 aa  158  6e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.780301  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1003  RNA methyltransferase TrmH, group 3  36.36 
 
 		 261 aa  158  6e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.60779  normal  0.0289199 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2368  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  38.43 
 
 		 256 aa  158  8e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.900248  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1073  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  39.67 
 
 		 250 aa  157  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.5513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2352  putative tRNA/rRNA methyltransferase YacO  38.11 
 
 		 248 aa  155  4e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.177652  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1165  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  39.26 
 
 		 250 aa  155  7e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0693312  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1229  putative tRNA/rRNA methyltransferase protein  38.91 
 
 		 249 aa  152  7e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00902362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2060  RNA methyltransferase  33.47 
 
 		 277 aa  151  8.999999999999999e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0401  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  36.44 
 
 		 246 aa  150  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000436094  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2091  RNA methyltransferase TrmH, group 3  38.08 
 
 		 247 aa  151  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.254713  normal  0.346719 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0580  RNA methyltransferase TrmH, group 3  37.45 
 
 		 251 aa  150  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.912866  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4934  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  37.45 
 
 		 250 aa  149  3e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2172  RNA methyltransferase TrmH, group 3  37.6 
 
 		 237 aa  149  4e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0146478  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07630  RNA methyltransferase TrmH, group 3  35.83 
 
 		 247 aa  149  4e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0683  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  35.08 
 
 		 255 aa  149  4e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.427045 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0267  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  35.83 
 
 		 246 aa  148  8e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000223613  normal  0.011395 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1336  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  35.8 
 
 		 249 aa  148  9e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000822091 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2929  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  33.47 
 
 		 263 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3320  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  32.91 
 
 		 315 aa  148  1.0000000000000001e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000334493  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1822  rRNA methylase  33.87 
 
 		 249 aa  147  1.0000000000000001e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00990  RNA methyltransferase  34.31 
 
 		 244 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000314375  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4759  RNA methyltransferase  36.36 
 
 		 248 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0810768 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0533  RNA methyltransferase TrmH, group 3  36.1 
 
 		 255 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0666066 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2022  RNA methyltransferase TrmH, group 3  36.67 
 
 		 246 aa  147  2.0000000000000003e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0644  RNA methyltransferase  36.36 
 
 		 250 aa  146  3e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000634261 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4935  RNA methyltransferase  36.36 
 
 		 248 aa  146  3e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000134443 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4879  RNA methyltransferase  36.25 
 
 		 248 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2889  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  34.98 
 
 		 248 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4669  RNA methyltransferase  35.95 
 
 		 248 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0289755 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2387  RNA methyltransferase  34.14 
 
 		 245 aa  144  1e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.939992  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3018  RNA methyltransferase  35.92 
 
 		 250 aa  144  1e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.231678 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4032  RNA methyltransferase  34.69 
 
 		 263 aa  143  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.104893  normal  0.17996 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3414  RNA methyltransferase  35.92 
 
 		 248 aa  143  3e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.377337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1517  RNA methyltransferase  39.33 
 
 		 238 aa  143  3e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.826104  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1580  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  41.87 
 
 		 252 aa  142  4e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0906  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  33.74 
 
 		 248 aa  142  5e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2208  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  36.14 
 
 		 248 aa  142  5e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.531626  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0092  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  32.64 
 
 		 245 aa  142  6e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000607271  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0340  rRNA methylase  31.98 
 
 		 251 aa  142  6e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000065422  hitchhiker  0.000000457527 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1625  RNA methyltransferase TrmH, group 3  33.88 
 
 		 251 aa  142  7e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.117052  hitchhiker  0.00235214 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2661  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  36.36 
 
 		 256 aa  140  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0406  RNA methyltransferase  32.26 
 
 		 244 aa  141  9.999999999999999e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0940631  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0306  TrmH family tRNA methyltransferase  33.88 
 
 		 268 aa  141  9.999999999999999e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1696  RNA methyltransferase  36.25 
 
 		 247 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3377  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  35.56 
 
 		 251 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2796  RNA methyltransferase  34.17 
 
 		 242 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.125421  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0088  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  33.61 
 
 		 246 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1817  putative tRNA/rRNA methyltransferase protein  36.03 
 
 		 247 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.392601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1606  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  35.92 
 
 		 248 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3322  RNA methyltransferase  33.2 
 
 		 248 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.752431  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5663  putative rRNA methylase  35.83 
 
 		 248 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3859  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  35.94 
 
 		 267 aa  140  1.9999999999999998e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119823  normal  0.0729978 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2268  RNA methyltransferase  35.92 
 
 		 248 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.144304  normal  0.908224 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0107  hypothetical protein  34.98 
 
 		 249 aa  139  3e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0092  hypothetical protein  34.98 
 
 		 249 aa  139  3e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0596  RNA methyltransferase  35.56 
 
 		 240 aa  139  3e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3029  RNA methyltransferase TrmH, group 3  35.1 
 
 		 264 aa  139  3e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.068461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2071  RNA methyltransferase TrmH, group 3  35.27 
 
 		 256 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0988  tRNA/rRNA methyltransferase  34.31 
 
 		 249 aa  139  4.999999999999999e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4413  RNA methyltransferase TrmH, group 3  32.24 
 
 		 327 aa  139  4.999999999999999e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1356  RNA methyltransferase TrmH, group 3  32.38 
 
 		 250 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000394989  hitchhiker  8.416419999999999e-20 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0174  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  33.88 
 
 		 247 aa  139  4.999999999999999e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000034032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0869  RNA methyltransferase  34.31 
 
 		 249 aa  138  7.999999999999999e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1408  RNA methyltransferase  35.51 
 
 		 255 aa  138  7.999999999999999e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0243869  normal  0.695011 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1462  RNA methyltransferase  33.88 
 
 		 245 aa  138  1e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0405731  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0091  RNA methyltransferase  31.97 
 
 		 247 aa  137  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00797863  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1084  RNA methyltransferase  37.39 
 
 		 242 aa  137  1e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0091  RNA methyltransferase  31.97 
 
 		 247 aa  137  1e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.678867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0088  tRNA/rRNA methyltransferase SpoU  31.97 
 
 		 247 aa  137  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000158072  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0087  TrmH family tRNA methyltransferase  31.97 
 
 		 247 aa  137  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.528227  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0003  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  33.89 
 
 		 250 aa  138  1e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0102  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  31.97 
 
 		 247 aa  137  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.238e-61 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0091  RNA methyltransferase  31.97 
 
 		 247 aa  137  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000227809  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0116  RNA methyltransferase TrmH family, group 3  37.29 
 
 		 238 aa  137  1e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.328344  normal  0.298059 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3354  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  33.06 
 
 		 246 aa  138  1e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0824924  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65190  TrmH family RNA methyltransferase , group 3  35 
 
 		 248 aa  138  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0086  RNA methyltransferase  32.79 
 
 		 247 aa  137  1e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000284808  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1425  rRNA methylase  30.43 
 
 		 233 aa  138  1e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000022514  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0122  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  31.97 
 
 		 247 aa  137  1e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000258465  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1036  RNA methyltransferase  37.39 
 
 		 242 aa  137  1e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3934  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  32.79 
 
 		 246 aa  136  2e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0196  RNA methyltransferase  35.25 
 
 		 243 aa  137  2e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000588208  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1489  RNA methyltransferase TrmH, group 3  35.25 
 
 		 244 aa  137  2e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0575  RNA methyltransferase  32.79 
 
 		 248 aa  137  2e-31  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.221662  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2285  TrmA family RNA methyltransferase  32.37 
 
 		 323 aa  137  2e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.240402  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>