193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_0078 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010531  Pnec_0078  CutA1 divalent ion tolerance protein  100 
 
 
116 aa  235  1e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000144851 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0080  CutA1 divalent ion tolerance protein  65.14 
 
 
116 aa  152  2e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1741  CutA1 divalent ion tolerance protein  41.9 
 
 
107 aa  93.6  9e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.894466 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0246  CutA1 divalent ion tolerance protein  41.84 
 
 
118 aa  85.9  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.299344  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4624  CutA1 divalent ion tolerance protein  43.27 
 
 
136 aa  84  7e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0299279 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0584  CutA1 divalent ion tolerance protein  38.38 
 
 
107 aa  83.6  7e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.759939  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1180  CutA1 divalent ion tolerance protein  39.6 
 
 
105 aa  83.6  8e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.412957 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3405  CutA1 divalent ion tolerance protein  40.59 
 
 
107 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.467432  normal  0.0160634 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0547  CutA1 divalent ion tolerance protein  40.59 
 
 
107 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.118163  normal  0.108424 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3265  CutA1 divalent ion tolerance protein  38.38 
 
 
107 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.189693  hitchhiker  0.00423146 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3575  CutA1 divalent ion tolerance protein  39.6 
 
 
107 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.229751  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0664  CutA1 divalent ion tolerance protein  40 
 
 
107 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3725  CutA1 divalent ion tolerance protein  40 
 
 
107 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.414398  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0660  CutA1 divalent ion tolerance protein  40 
 
 
107 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.970126  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3246  CutA1 divalent ion tolerance protein  38.61 
 
 
107 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0637  CutA1 divalent ion tolerance protein  40 
 
 
107 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.887126  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0428  CutA1 divalent ion tolerance protein  35.42 
 
 
103 aa  79  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.832839 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1539  CutA1 divalent ion tolerance protein  40.2 
 
 
103 aa  77.4  0.00000000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.234612 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1739  hypothetical protein  37.11 
 
 
125 aa  77  0.00000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2482  CutA1 divalent ion tolerance protein  37.5 
 
 
105 aa  77  0.00000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.634613  normal  0.126784 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0697  periplasmic divalent cation tolerance protein CutA  38 
 
 
107 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3152  CutA1 divalent ion tolerance protein  39.6 
 
 
126 aa  76.3  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.857846  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0040  CutA1 divalent ion tolerance protein  38.78 
 
 
107 aa  76.3  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.214285  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4014  CutA1 divalent ion tolerance protein  36 
 
 
112 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000995556 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1262  CutA1 divalent ion tolerance protein  37 
 
 
105 aa  75.9  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.112671  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1193  CutA1 divalent ion tolerance protein  37 
 
 
105 aa  75.9  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0316727  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1044  CutA1 divalent ion tolerance protein  39.22 
 
 
122 aa  75.5  0.0000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.402781  hitchhiker  0.00376288 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5137  CutA1 divalent ion tolerance protein  37 
 
 
109 aa  75.1  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.504404  normal  0.028749 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1040  periplasmic divalent cation tolerance protein, putative  37.14 
 
 
107 aa  74.7  0.0000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0633  CutA1 divalent ion tolerance protein  42.5 
 
 
110 aa  74.7  0.0000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0029  CutA1 divalent ion tolerance protein  32.41 
 
 
115 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4157  CutA1 divalent ion tolerance protein  36.63 
 
 
107 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.496256 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0417  CutA1 divalent ion tolerance protein  36.79 
 
 
107 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000143312  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0539  periplasmic divalent cation tolerance protein CutA  34.31 
 
 
110 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00953533  decreased coverage  0.00314697 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4166  CutA1 divalent ion tolerance protein  36.36 
 
 
105 aa  73.2  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2175  CutA1 divalent ion tolerance protein  37.5 
 
 
102 aa  72.8  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0107322  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0605  CutA1 divalent ion tolerance protein  43.75 
 
 
112 aa  72.8  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0259524  decreased coverage  0.0027095 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2339  CutA1 divalent ion tolerance protein  34.29 
 
 
106 aa  73.2  0.000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.119887  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03011  periplasmic divalent cation tolerance protein  33.64 
 
 
110 aa  73.6  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1473  CutA1 divalent ion tolerance protein  36.27 
 
 
103 aa  72.8  0.000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.168159  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4630  CutA1 divalent ion tolerance protein  31.19 
 
 
113 aa  72.4  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.292633  normal  0.456703 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2560  divalent cation tolerance protein  39.39 
 
 
107 aa  72  0.000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1598  CutA1 divalent ion tolerance protein  35.24 
 
 
105 aa  71.6  0.000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3665  CutA1 divalent ion tolerance protein  37.8 
 
 
108 aa  72  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0560029  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0373  CutA1 divalent ion tolerance protein  34.95 
 
 
109 aa  71.2  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.135716  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1056  CutA1 divalent ion tolerance protein  33.03 
 
 
113 aa  71.2  0.000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00140547  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0586  CutA1 divalent ion tolerance protein  35.51 
 
 
124 aa  71.2  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2261  periplasmic divalent cation tolerance protein  34.58 
 
 
113 aa  70.5  0.000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.155745  normal  0.159586 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2619  putative divalent-cation tolerance protein  35.87 
 
 
111 aa  70.5  0.000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0176718 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0199  CutA1 divalent ion tolerance protein  38.14 
 
 
107 aa  70.1  0.000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2684  CutA1 divalent ion tolerance protein  35.29 
 
 
121 aa  69.7  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3629  CutA1 divalent ion tolerance protein  31.9 
 
 
112 aa  69.7  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.302661  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05051  CutA1 divalent ion tolerance protein  33.01 
 
 
128 aa  69.3  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0443874  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0021  CutA1 divalent ion tolerance protein  33.98 
 
 
124 aa  68.9  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.722189  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1082  threonine synthase  32.99 
 
 
580 aa  68.6  0.00000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.000183977  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0727  divalent-cation tolerance protein CutA  31.25 
 
 
119 aa  68.9  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2811  CutA1 divalent ion tolerance protein  36.73 
 
 
110 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0694531  normal  0.434183 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3827  divalent-cation tolerance protein CutA  31.25 
 
 
119 aa  68.9  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.625721  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3680  divalent-cation tolerance protein CutA  31.25 
 
 
119 aa  68.9  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3194  CutA1 divalent ion tolerance protein  34.91 
 
 
111 aa  68.6  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3914  CutA1 divalent ion tolerance protein  36.7 
 
 
115 aa  68.6  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1490  periplasmic divalent cation tolerance protein cutA, putative  31 
 
 
106 aa  67.8  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000000459087  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1359  CutA1 divalent ion tolerance protein  38.24 
 
 
103 aa  68.2  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.458665  normal  0.151703 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4155  CutA1 divalent ion tolerance protein  34.34 
 
 
111 aa  67.4  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000487398  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0749  dephospho-CoA kinase  34.02 
 
 
294 aa  67.4  0.00000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0299889  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2188  CutA1 divalent ion tolerance protein  33.64 
 
 
107 aa  67  0.00000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3409  divalent-cation tolerance protein CutA  29.7 
 
 
110 aa  67  0.00000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2991  periplasmic divalent cation tolerance protein  31.78 
 
 
112 aa  66.2  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0954  periplasmic divalent cation tolerance protein CutA  34.34 
 
 
103 aa  66.6  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3269  CutA1 divalent ion tolerance protein  32.71 
 
 
112 aa  66.2  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.011597 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3289  CutA1 divalent ion tolerance protein  32.38 
 
 
126 aa  66.2  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2603  periplasmic divalent cation tolerance protein  31.37 
 
 
108 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3748  periplasmic divalent cation tolerance protein  31.37 
 
 
108 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.620325  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1669  putative divalent cation tolerance protein  34.58 
 
 
110 aa  65.9  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03922  periplasmic divalent cation tolerance protein  34.02 
 
 
104 aa  65.9  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3534  divalent-cation tolerance protein CutA  27.68 
 
 
126 aa  65.9  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2019  hypothetical protein  33.66 
 
 
127 aa  65.9  0.0000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.604048  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0716  CutA1 divalent ion tolerance protein  32.69 
 
 
109 aa  65.5  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.737655  normal  0.575155 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3141  periplasmic divalent cation tolerance protein  31.37 
 
 
116 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1952  periplasmic divalent cation tolerance protein  31.37 
 
 
116 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1667  CutA1 divalent ion tolerance protein  36 
 
 
102 aa  65.5  0.0000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.024619 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3718  divalent cation tolerance family protein  31.37 
 
 
116 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3776  divalent cation tolerance family protein  31.37 
 
 
116 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.930326  n/a   
 
 
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NC_009080  BMA10247_3506  periplasmic divalent cation tolerance protein  31.37 
 
 
116 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009832  Spro_0404  divalent-cation tolerance protein CutA  30.69 
 
 
107 aa  65.9  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0607998  hitchhiker  0.00180508 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0581  CutA1 divalent ion tolerance protein  28.16 
 
 
122 aa  65.1  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.200726  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0342  periplasmic cytochrome biogenesis protein  30.39 
 
 
106 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0235103 
 
 
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NC_012917  PC1_0504  divalent-cation tolerance protein CutA  29.7 
 
 
110 aa  65.1  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_013421  Pecwa_0723  divalent-cation tolerance protein CutA  29 
 
 
110 aa  64.3  0.0000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_010002  Daci_1797  CutA1 divalent ion tolerance protein  34.91 
 
 
132 aa  64.3  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.425659 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0689  putative divalent cation tolerance protein  33.98 
 
 
106 aa  64.3  0.0000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_007955  Mbur_1306  CutA1 divalent ion tolerance protein  35.35 
 
 
103 aa  63.9  0.0000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
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NC_013385  Adeg_0037  CutA1 divalent ion tolerance protein  32.71 
 
 
108 aa  63.9  0.0000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_007510  Bcep18194_A3475  CutA1 divalent ion tolerance protein  32.35 
 
 
108 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.66243 
 
 
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CP001637  EcDH1_3855  CutA1 divalent ion tolerance protein  30.69 
 
 
112 aa  62.8  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_011769  DvMF_2936  CutA1 divalent ion tolerance protein  38.46 
 
 
106 aa  62.8  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.157087 
 
 
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NC_012892  B21_03969  hypothetical protein  30.69 
 
 
112 aa  62.8  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_007643  Rru_A1673  CutA1 divalent ion tolerance protein  28.43 
 
 
121 aa  63.2  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.478718  n/a   
 
 
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NC_007651  BTH_I3040  periplasmic divalent cation tolerance protein  31.37 
 
 
108 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.994008  n/a   
 
 
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NC_010498  EcSMS35_4606  divalent-cation tolerance protein CutA  30.69 
 
 
112 aa  62.8  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00265756  normal  0.599029 
 
 
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