165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_2019 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_2019  hypothetical protein  100 
 
 
127 aa  253  5e-67  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.604048  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0723  divalent-cation tolerance protein CutA  35.58 
 
 
110 aa  67  0.00000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0584  CutA1 divalent ion tolerance protein  35.24 
 
 
107 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.759939  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0078  CutA1 divalent ion tolerance protein  33.66 
 
 
116 aa  65.9  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000144851 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3040  periplasmic divalent cation tolerance protein  37.76 
 
 
108 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.994008  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3135  CutA1 divalent ion tolerance protein  31.62 
 
 
129 aa  63.9  0.0000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00931834  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0504  divalent-cation tolerance protein CutA  34.62 
 
 
110 aa  63.2  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2603  periplasmic divalent cation tolerance protein  36.73 
 
 
108 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3152  CutA1 divalent ion tolerance protein  35.42 
 
 
126 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.857846  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3748  periplasmic divalent cation tolerance protein  36.73 
 
 
108 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.620325  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3141  periplasmic divalent cation tolerance protein  36.73 
 
 
116 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1952  periplasmic divalent cation tolerance protein  36.73 
 
 
116 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3718  divalent cation tolerance family protein  36.73 
 
 
116 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3776  divalent cation tolerance family protein  36.73 
 
 
116 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.930326  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3506  periplasmic divalent cation tolerance protein  36.73 
 
 
116 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2175  CutA1 divalent ion tolerance protein  36 
 
 
102 aa  61.2  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0107322  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0080  CutA1 divalent ion tolerance protein  30.69 
 
 
116 aa  61.6  0.000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1180  CutA1 divalent ion tolerance protein  38 
 
 
105 aa  60.8  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.412957 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3265  CutA1 divalent ion tolerance protein  34.02 
 
 
107 aa  60.8  0.000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.189693  hitchhiker  0.00423146 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0304  CutA1 divalent ion tolerance protein  33.67 
 
 
108 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0432895 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1797  CutA1 divalent ion tolerance protein  31.09 
 
 
132 aa  60.5  0.000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.425659 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3475  CutA1 divalent ion tolerance protein  32.65 
 
 
108 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.66243 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0633  CutA1 divalent ion tolerance protein  33.33 
 
 
110 aa  58.9  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03922  periplasmic divalent cation tolerance protein  33.01 
 
 
104 aa  59.3  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3246  CutA1 divalent ion tolerance protein  33.04 
 
 
107 aa  58.5  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1598  CutA1 divalent ion tolerance protein  30.39 
 
 
105 aa  58.5  0.00000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4057  CutA1 divalent ion tolerance protein  39.08 
 
 
106 aa  58.5  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306386  normal  0.18472 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1230  CutA1 divalent ion tolerance protein  30.93 
 
 
102 aa  58.2  0.00000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5137  CutA1 divalent ion tolerance protein  30.21 
 
 
109 aa  58.2  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.504404  normal  0.028749 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3007  hypothetical protein  30.91 
 
 
131 aa  57.8  0.00000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0342  periplasmic cytochrome biogenesis protein  36.71 
 
 
106 aa  57  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0235103 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3199  CutA1 divalent ion tolerance protein  34.04 
 
 
108 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00581534 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1899  CutA1 divalent ion tolerance protein  32.97 
 
 
106 aa  56.6  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4630  CutA1 divalent ion tolerance protein  35.71 
 
 
113 aa  56.2  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.292633  normal  0.456703 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1040  periplasmic divalent cation tolerance protein, putative  31.63 
 
 
107 aa  55.8  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0660  CutA1 divalent ion tolerance protein  34.74 
 
 
107 aa  56.2  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.970126  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1056  CutA1 divalent ion tolerance protein  34.04 
 
 
113 aa  55.8  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00140547  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2811  CutA1 divalent ion tolerance protein  31.91 
 
 
110 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0694531  normal  0.434183 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2684  CutA1 divalent ion tolerance protein  31.91 
 
 
121 aa  55.8  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3616  CutA1 divalent ion tolerance protein  36.11 
 
 
110 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00421644  hitchhiker  0.000000032142 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3725  CutA1 divalent ion tolerance protein  34.74 
 
 
107 aa  56.2  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.414398  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0637  CutA1 divalent ion tolerance protein  34.74 
 
 
107 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.887126  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0664  CutA1 divalent ion tolerance protein  34.74 
 
 
107 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0277  CutA1 divalent ion tolerance protein  37.5 
 
 
108 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0727054 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1750  CutA1 divalent ion tolerance protein  34 
 
 
105 aa  55.5  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1193  CutA1 divalent ion tolerance protein  36 
 
 
105 aa  55.5  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0316727  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1262  CutA1 divalent ion tolerance protein  36 
 
 
105 aa  55.5  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.112671  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0417  CutA1 divalent ion tolerance protein  30.93 
 
 
107 aa  54.7  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000143312  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3665  CutA1 divalent ion tolerance protein  29.79 
 
 
108 aa  54.3  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0560029  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3575  CutA1 divalent ion tolerance protein  32.08 
 
 
107 aa  54.3  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.229751  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2261  periplasmic divalent cation tolerance protein  32.32 
 
 
113 aa  54.3  0.0000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.155745  normal  0.159586 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3289  CutA1 divalent ion tolerance protein  32.98 
 
 
126 aa  54.3  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0697  periplasmic divalent cation tolerance protein CutA  30.48 
 
 
107 aa  53.9  0.0000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0037  CutA1 divalent ion tolerance protein  33.33 
 
 
108 aa  53.5  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1673  CutA1 divalent ion tolerance protein  29.9 
 
 
121 aa  52.8  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.478718  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0324  divalent-cation tolerance protein CutA  31.37 
 
 
107 aa  53.1  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000315224 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1741  CutA1 divalent ion tolerance protein  28.43 
 
 
107 aa  53.1  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.894466 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2702  CutA1 divalent ion tolerance protein  35.35 
 
 
113 aa  52.8  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0785  CutA1 divalent ion tolerance protein  26.67 
 
 
104 aa  52.8  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3405  CutA1 divalent ion tolerance protein  31.58 
 
 
107 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.467432  normal  0.0160634 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0547  CutA1 divalent ion tolerance protein  31.58 
 
 
107 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.118163  normal  0.108424 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0295  CutA1 divalent ion tolerance protein  35.14 
 
 
108 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0376  CutA1 divalent ion tolerance protein  33.78 
 
 
107 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2339  CutA1 divalent ion tolerance protein  29.79 
 
 
106 aa  52.8  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.119887  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1230  CutA1 divalent ion tolerance protein  36.61 
 
 
114 aa  52.4  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3409  divalent-cation tolerance protein CutA  30.39 
 
 
110 aa  51.6  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3680  divalent-cation tolerance protein CutA  30.39 
 
 
119 aa  52  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0727  divalent-cation tolerance protein CutA  30.39 
 
 
119 aa  52  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3827  divalent-cation tolerance protein CutA  30.39 
 
 
119 aa  52  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.625721  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1621  CutA1 divalent ion tolerance protein  29.36 
 
 
112 aa  51.6  0.000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.178296  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3534  divalent-cation tolerance protein CutA  29.41 
 
 
126 aa  51.6  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0645  CutA1 divalent ion tolerance protein  33.01 
 
 
109 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.23326  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3629  CutA1 divalent ion tolerance protein  30.85 
 
 
112 aa  51.6  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.302661  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0373  CutA1 divalent ion tolerance protein  32.04 
 
 
109 aa  51.6  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.135716  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1690  periplasmic divalent cation tolerance protein  29.36 
 
 
112 aa  51.6  0.000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0635803  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0581  CutA1 divalent ion tolerance protein  28.44 
 
 
122 aa  51.6  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.200726  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4157  CutA1 divalent ion tolerance protein  28.72 
 
 
107 aa  51.6  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.496256 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2936  CutA1 divalent ion tolerance protein  32.99 
 
 
106 aa  51.2  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.157087 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2731  CutA1 divalent ion tolerance protein  32.43 
 
 
107 aa  50.8  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0355  CutA1 divalent ion tolerance protein  33.78 
 
 
108 aa  50.8  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.342416 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0539  periplasmic divalent cation tolerance protein CutA  28 
 
 
110 aa  50.8  0.000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00953533  decreased coverage  0.00314697 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2000  CutA1 divalent ion tolerance protein  31.91 
 
 
127 aa  50.8  0.000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.314038  normal  0.502944 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4624  CutA1 divalent ion tolerance protein  29.29 
 
 
136 aa  50.8  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0299279 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0404  divalent-cation tolerance protein CutA  31.37 
 
 
107 aa  50.8  0.000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0607998  hitchhiker  0.00180508 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4014  CutA1 divalent ion tolerance protein  27.84 
 
 
112 aa  50.4  0.000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000995556 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0011  CutA1 divalent ion tolerance protein  31.91 
 
 
105 aa  50.4  0.000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0954  periplasmic divalent cation tolerance protein CutA  29 
 
 
103 aa  49.7  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0029  CutA1 divalent ion tolerance protein  28.57 
 
 
115 aa  49.7  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4166  CutA1 divalent ion tolerance protein  30.3 
 
 
105 aa  48.9  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1739  hypothetical protein  25.44 
 
 
125 aa  49.3  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0428  CutA1 divalent ion tolerance protein  28.72 
 
 
103 aa  48.9  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.832839 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0244  CutA1 divalent ion tolerance protein  30.53 
 
 
117 aa  48.9  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00963425  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4742  divalent-cation tolerance protein CutA  29.41 
 
 
115 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.742886 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4685  divalent-cation tolerance protein CutA  29.41 
 
 
115 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0199  CutA1 divalent ion tolerance protein  29.63 
 
 
107 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0756  divalent ion tolerance protein CutA1  26.6 
 
 
106 aa  48.5  0.00003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.123364  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4602  divalent-cation tolerance protein CutA  29.41 
 
 
115 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.811506  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1044  CutA1 divalent ion tolerance protein  29.13 
 
 
122 aa  48.5  0.00003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.402781  hitchhiker  0.00376288 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1539  CutA1 divalent ion tolerance protein  29.17 
 
 
103 aa  48.5  0.00003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.234612 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4594  divalent-cation tolerance protein CutA  29.41 
 
 
115 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.925297 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>