40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2924 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_2924  TonB family protein  100 
 
 		 421 aa  795    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2892  TonB-like  50 
 
 		 296 aa  282  6.000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.141277 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2674  TonB-like  38.72 
 
 		 317 aa  178  1e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1159  TonB-like  40.86 
 
 		 337 aa  178  2e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.808431  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2956  putative tolA-related transport transmembrane protein  57.02 
 
 		 282 aa  138  2e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.15947  normal  0.706854 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2225  TonB family protein  40.75 
 
 		 351 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.109672  hitchhiker  0.000359894 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0727  protein TolA  50 
 
 		 342 aa  116  6.9999999999999995e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00429068  normal  0.0892562 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2461  protein TolA  60.24 
 
 		 380 aa  115  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.216675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0683  protein TolA  50 
 
 		 342 aa  114  3e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.907916  normal  0.730086 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3117  protein TolA  47.06 
 
 		 309 aa  109  9.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321745  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4796  TonB domain-containing protein  35.34 
 
 		 302 aa  107  3e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.389022  normal  0.0761518 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4425  TonB, C-terminal  42.59 
 
 		 253 aa  103  7e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.333696  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0734  TOLA-like transport transmembrane protein  44.58 
 
 		 345 aa  87  5e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.747648 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4255  TonB family protein  43.33 
 
 		 441 aa  77.8  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510243  normal  0.585691 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1374  TolA protein superfamily  40 
 
 		 334 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0276  TonB domain-containing protein  43.02 
 
 		 283 aa  62.4  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.131097  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1948  TolA protein  50.91 
 
 		 341 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3240  TolA protein  50.91 
 
 		 341 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.137391  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3202  TolA protein  50.91 
 
 		 341 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2662  TolA protein  50.91 
 
 		 341 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0828  TolA protein  50.91 
 
 		 341 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2080  hypothetical protein  50.91 
 
 		 341 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3255  TolA-related transport transmembrane protein  50.91 
 
 		 341 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2586  protein TolA  52.54 
 
 		 350 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.807612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0801  TonB family protein  49.18 
 
 		 351 aa  57  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0318  TonB-like  49.18 
 
 		 351 aa  57  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.782104  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0770  protein TolA  49.18 
 
 		 351 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0734059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0678  TolA family protein  50.98 
 
 		 355 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.805886  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3890  TonB/TolA-like protein  50.91 
 
 		 351 aa  55.8  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0760  protein TolA  24.83 
 
 		 344 aa  54.7  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.149249  normal  0.490523 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2207  putative TonB protein  33.54 
 
 		 290 aa  54.7  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00259099 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2263  protein TolA  57.38 
 
 		 323 aa  54.7  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.113233  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2773  TonB family protein  57.38 
 
 		 323 aa  54.7  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0695  protein TolA  53.06 
 
 		 355 aa  54.3  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0337402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2454  protein TolA  47.06 
 
 		 351 aa  53.1  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4054  TonB, C-terminal  36.11 
 
 		 278 aa  52  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3919  TonB protein  46.43 
 
 		 347 aa  50.4  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0920445 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2715  TonB-like  42.37 
 
 		 353 aa  47.4  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0316774  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0783  protein TolA  34.41 
 
 		 320 aa  47.4  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0122921  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3565  protein of unknown function DUF323  30.85 
 
 		 925 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233339 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>