37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2566 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_2566  hypothetical protein  100 
 
 		 89 aa  185  1e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.133361  hitchhiker  0.000771324 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4095  IS605 family transposase OrfB  89.47 
 
 		 385 aa  109  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.646881 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3402  IS891/IS1136/IS1341 family transposase  85.96 
 
 		 255 aa  105  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.585947 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2857  hypothetical protein  86.05 
 
 		 100 aa  82  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0368984 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0195  IS605 family transposase OrfB  39.44 
 
 		 368 aa  49.7  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000522338  hitchhiker  0.00591521 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0141  IS605 family transposase OrfB  34.18 
 
 		 368 aa  47.4  0.00006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0117  IS605 family transposase OrfB  37.14 
 
 		 368 aa  47  0.00008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1392  IS605 family transposase OrfB  37.14 
 
 		 368 aa  47  0.00008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000454462 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0603  IS605 family transposase OrfB  34.67 
 
 		 367 aa  47  0.00009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000602686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1669  IS605 family transposase OrfB  37.14 
 
 		 368 aa  46.6  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000382916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1710  IS605 family transposase OrfB  37.14 
 
 		 368 aa  46.6  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1777  IS605 family transposase OrfB  36.62 
 
 		 382 aa  47  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.872149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1078  IS605 family transposase OrfB  36.62 
 
 		 368 aa  47  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491952 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2014  IS605 family transposase OrfB  34.67 
 
 		 368 aa  46.6  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0197  IS605 family transposase OrfB  36.62 
 
 		 368 aa  46.6  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00374604  normal  0.012481 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0206  IS605 family transposase OrfB  37.14 
 
 		 368 aa  46.6  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00107304  normal  0.275881 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2274  IS605 family transposase OrfB  35.71 
 
 		 368 aa  45.4  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.683357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1918  IS605 family transposase OrfB  32.91 
 
 		 368 aa  45.4  0.0003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.794577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0626  IS605 family transposase OrfB  37.14 
 
 		 368 aa  45.1  0.0003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511455 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2229  IS605 family transposase OrfB  31.65 
 
 		 368 aa  44.7  0.0004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.626337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0367  IS605 family transposase OrfB  31.65 
 
 		 368 aa  44.7  0.0005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292171  hitchhiker  0.000610629 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1070  IS605 family transposase OrfB  35.21 
 
 		 368 aa  44.3  0.0006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0178  IS605 family transposase OrfB  33.8 
 
 		 368 aa  41.6  0.004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.116307  normal  0.116518 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5405  IS605 family transposase OrfB  37.74 
 
 		 350 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.606639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5061  IS605 family transposase OrfB  37.74 
 
 		 350 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.149443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1598  IS605 family transposase OrfB  37.74 
 
 		 350 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.301162 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1613  IS605 family transposase OrfB  37.74 
 
 		 350 aa  40.4  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.311037 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3834  IS605 family transposase OrfB  37.74 
 
 		 350 aa  40.8  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.885241 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4147  IS605 family transposase OrfB  37.74 
 
 		 350 aa  40.4  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0972237  normal  0.0676956 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6095  IS605 family transposase OrfB  37.74 
 
 		 350 aa  40.8  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4247  IS605 family transposase OrfB  37.74 
 
 		 350 aa  40.4  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.866566  normal  0.0328861 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3911  IS605 family transposase OrfB  37.74 
 
 		 350 aa  40.4  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1547  IS605 family transposase OrfB  37.74 
 
 		 350 aa  40.8  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.582452  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5305  IS605 family transposase OrfB  37.74 
 
 		 350 aa  40.4  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0621738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3151  IS605 family transposase OrfB  41.51 
 
 		 355 aa  40  0.01  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1058  IS605 family transposase OrfB  41.51 
 
 		 355 aa  40  0.01  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.14172 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1587  transposase  44.44 
 
 		 363 aa  40  0.01  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>