64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2543 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_2543  metallophosphoesterase  100 
 
 
271 aa  549  1e-155  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.496359 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1721  putative DNA repair exonuclease  57.36 
 
 
265 aa  288  5.0000000000000004e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0737624 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4746  metallophosphoesterase  57.09 
 
 
274 aa  287  2e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2182  putative DNA repair exonuclease  57.47 
 
 
274 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.16009  normal  0.125121 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2868  metallophosphoesterase  54.96 
 
 
277 aa  269  4e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.236712  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1362  metallophosphoesterase  52.38 
 
 
266 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.7574e-16 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2851  metallophosphoesterase  51.59 
 
 
266 aa  256  4e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0131922  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2358  metallophosphoesterase  60.92 
 
 
272 aa  254  8e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44430  Metallophosphoesterase protein  50 
 
 
291 aa  228  8e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.112836  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3826  metallophosphoesterase  40.74 
 
 
271 aa  172  6.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.703659  normal  0.184738 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3489  metallophosphoesterase  38.13 
 
 
256 aa  159  5e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.841286  normal  0.462378 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3290  metallophosphoesterase  35.09 
 
 
289 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0337  phospodiesterase  37.93 
 
 
273 aa  124  1e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.669687  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0959  metallophosphoesterase  38.08 
 
 
270 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0590877 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4425  metallophosphoesterase  35.29 
 
 
292 aa  122  5e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.124915  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4889  metallophosphoesterase  35.29 
 
 
294 aa  122  5e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.402966  normal  0.967769 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1981  metallophosphoesterase  37.07 
 
 
273 aa  121  9e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.400129 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0083  metallophosphoesterase  32.23 
 
 
286 aa  120  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0874822 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0680  metallophosphoesterase  31.4 
 
 
274 aa  119  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00534787  normal  0.0339025 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4935  metallophosphoesterase  34.12 
 
 
294 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.13002  normal  0.147867 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1395  metallophosphoesterase  32.6 
 
 
273 aa  115  5e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.540293  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3901  metallophosphoesterase  34.8 
 
 
267 aa  114  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.574186  normal  0.329867 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2949  metallophosphoesterase  32.64 
 
 
276 aa  108  9.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.158602  hitchhiker  0.00186022 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1260  metallophosphoesterase  33.19 
 
 
296 aa  108  1e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2380  metallophosphoesterase  36.49 
 
 
262 aa  106  5e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0169412  normal  0.809272 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0221  metallophosphoesterase  31.09 
 
 
278 aa  106  5e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.510985 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1186  metallophosphoesterase  31.38 
 
 
288 aa  104  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00040715  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2244  metallophosphoesterase  30.63 
 
 
282 aa  103  3e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1921  hypothetical protein  24.77 
 
 
269 aa  94.7  1e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1934  hypothetical protein  24.77 
 
 
270 aa  92  1e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2336  metallophosphoesterase  33.04 
 
 
278 aa  87.8  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.243152 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3321  metallophosphoesterase  30.54 
 
 
282 aa  82  0.000000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0980  metallophosphoesterase  27.35 
 
 
271 aa  77.8  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.608254  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1378  metallophosphoesterase  26.38 
 
 
252 aa  70.1  0.00000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.831102 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0134  metallophosphoesterase  29.66 
 
 
311 aa  67.4  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5676  metallophosphoesterase  28.94 
 
 
326 aa  61.2  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0494432 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1012  Ser/Thr protein phosphatase family protein  21.64 
 
 
294 aa  59.3  0.00000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.329286  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1658  metallophosphoesterase  23.32 
 
 
274 aa  58.9  0.00000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.11586  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1233  3,5-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  20.83 
 
 
230 aa  56.6  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0341  metallophosphoesterase  23.65 
 
 
335 aa  53.9  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0479119 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2634  metallophosphoesterase  21.68 
 
 
301 aa  51.2  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.614521 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4691  metallophosphoesterase  30.86 
 
 
277 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3243  hypothetical protein  22.43 
 
 
302 aa  50.1  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0490  Ser/Thr protein phosphatase family protein  31.48 
 
 
277 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3174  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  21.76 
 
 
222 aa  49.3  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0822292  hitchhiker  0.000980029 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3261  metallophosphoesterase  23.5 
 
 
318 aa  48.1  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4196  metallophosphoesterase  25.39 
 
 
292 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.600971 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6827  metallophosphoesterase  27.92 
 
 
298 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1601  metallophosphoesterase  26.67 
 
 
303 aa  47  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2349  protein of unknown function DUF323  21.99 
 
 
1186 aa  47  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.719002  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2745  metallophosphoesterase  26.2 
 
 
332 aa  46.6  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.384672  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0392  metallophosphoesterase  24.75 
 
 
313 aa  46.6  0.0005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.775359 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4791  metallophosphoesterase  25.87 
 
 
319 aa  46.2  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.444638  normal  0.138362 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1382  metallophosphoesterase  26.63 
 
 
298 aa  46.2  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.555745 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1810  metallophosphoesterase  25.32 
 
 
706 aa  46.2  0.0006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.24784  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2187  metallophosphoesterase  26.49 
 
 
307 aa  46.2  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2257  putative metallo-phosphoesterase  25.27 
 
 
297 aa  45.8  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.118894  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0746  hypothetical protein  23.88 
 
 
329 aa  45.4  0.001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.522504  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0974  metallophosphoesterase  30 
 
 
318 aa  44.3  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0534  putative ICC protein  27.44 
 
 
279 aa  43.1  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3418  metallophosphoesterase  25.27 
 
 
307 aa  42.7  0.006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0071  metallophosphoesterase  28.25 
 
 
274 aa  42.7  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.762323  normal  0.510417 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2821  nuclease SbcCD, D subunit  41.67 
 
 
383 aa  42.7  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0118  metallophosphoesterase  23.83 
 
 
312 aa  42.4  0.009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.267876  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>