191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3670 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3670  hypothetical protein  100 
 
 		 205 aa  412  1e-114  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1143  hypothetical protein  71.01 
 
 		 209 aa  293  2e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.284928  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0983  hypothetical protein  70.05 
 
 		 209 aa  288  4e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.015485  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41280  hypothetical protein  70.73 
 
 		 205 aa  287  7e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4716  hypothetical protein  68.6 
 
 		 207 aa  274  6e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.752414  normal  0.48129 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61320  hypothetical protein  65.85 
 
 		 204 aa  271  3e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.681363 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5280  hypothetical protein  66.34 
 
 		 204 aa  271  3e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.191722  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0800  hypothetical protein  64.56 
 
 		 206 aa  264  7e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.72478 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0758  hypothetical protein  64.56 
 
 		 206 aa  264  8e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4430  hypothetical protein  65.05 
 
 		 206 aa  264  8e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0786  hypothetical protein  64.08 
 
 		 206 aa  263  2e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2559  protein of unknown function DUF159  39.55 
 
 		 221 aa  125  3e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0049  hypothetical protein  39.27 
 
 		 232 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.435898  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3892  hypothetical protein  36.2 
 
 		 233 aa  116  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1328  protein of unknown function DUF159  37.84 
 
 		 224 aa  116  3e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1737  hypothetical protein  36.49 
 
 		 222 aa  108  4.0000000000000004e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0489  hypothetical protein  36.44 
 
 		 222 aa  108  8.000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0040  hypothetical protein  37.44 
 
 		 223 aa  107  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0189  hypothetical protein  31.25 
 
 		 238 aa  105  6e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2344  protein of unknown function DUF159  35.68 
 
 		 226 aa  103  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.670421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3273  protein of unknown function DUF159  35.86 
 
 		 248 aa  103  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.219423 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1080  protein of unknown function DUF159  33.94 
 
 		 222 aa  103  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000409345  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0767  hypothetical protein  35.84 
 
 		 244 aa  102  3e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.573199 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3538  hypothetical protein  35.29 
 
 		 236 aa  101  7e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0057  hypothetical protein  34.2 
 
 		 222 aa  99.4  3e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1971  protein of unknown function DUF159  33.05 
 
 		 233 aa  99.8  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.442457 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2616  protein of unknown function DUF159  37.02 
 
 		 220 aa  98.6  5e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.163016 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3891  hypothetical protein  33.63 
 
 		 235 aa  98.6  6e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.356516  normal  0.457869 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1864  hypothetical protein  32.13 
 
 		 232 aa  97.4  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00030061 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2361  protein of unknown function DUF159  32.88 
 
 		 226 aa  97.1  2e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1866  hypothetical protein  32.11 
 
 		 222 aa  95.9  4e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0971626  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1957  protein of unknown function DUF159  32.42 
 
 		 224 aa  95.5  5e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5191  hypothetical protein  32.13 
 
 		 239 aa  95.1  7e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.786619  normal  0.272593 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2330  protein of unknown function DUF159  35.38 
 
 		 227 aa  93.6  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3028  protein of unknown function DUF159  32.1 
 
 		 237 aa  94  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1038  hypothetical protein  33.16 
 
 		 222 aa  93.2  3e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1003  hypothetical protein  33.16 
 
 		 222 aa  93.2  3e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1923  protein of unknown function DUF159  34.74 
 
 		 226 aa  93.2  3e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.630522 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1054  hypothetical protein  32.59 
 
 		 231 aa  92  5e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2394  protein of unknown function DUF159  33.33 
 
 		 221 aa  91.7  6e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.19161e-31 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2685  hypothetical protein  35.03 
 
 		 221 aa  91.7  7e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.378433  hitchhiker  0.0016423 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2698  hypothetical protein  35.57 
 
 		 255 aa  90.9  1e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.107504  normal  0.966546 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2360  protein of unknown function DUF159  36.32 
 
 		 222 aa  91.3  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.680503  hitchhiker  0.0000951308 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0601  protein of unknown function DUF159  28.51 
 
 		 234 aa  90.1  2e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0208739  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1024  protein of unknown function DUF159  30.83 
 
 		 253 aa  88.2  8e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.458547  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1531  hypothetical protein  29.86 
 
 		 225 aa  88.2  8e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0567  protein of unknown function DUF159  29.07 
 
 		 223 aa  87.4  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1782  protein of unknown function DUF159  32.94 
 
 		 247 aa  87.4  1e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.178705 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3948  hypothetical protein  32.83 
 
 		 231 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4325  hypothetical protein  31.25 
 
 		 257 aa  87  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.250305 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3022  hypothetical protein  33.9 
 
 		 223 aa  86.3  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.310509  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4011  hypothetical protein  35.52 
 
 		 254 aa  86.3  3e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1100  protein of unknown function DUF159  33.74 
 
 		 254 aa  85.9  4e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2926  hypothetical protein  29.75 
 
 		 253 aa  85.9  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0284  protein of unknown function DUF159  34.36 
 
 		 243 aa  85.5  4e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.69379  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1130  hypothetical protein  34.81 
 
 		 259 aa  85.9  4e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0207355  normal  0.486659 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1339  protein of unknown function DUF159  31.9 
 
 		 234 aa  85.9  4e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.455204  normal  0.858262 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1122  protein of unknown function DUF159  30.57 
 
 		 226 aa  85.9  4e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1457  hypothetical protein  34.76 
 
 		 219 aa  85.5  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000398604  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1384  protein of unknown function DUF159  32.47 
 
 		 234 aa  85.5  5e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.243083  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2747  hypothetical protein  30.46 
 
 		 239 aa  85.5  6e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0536  hypothetical protein  32.22 
 
 		 250 aa  85.1  6e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.932733  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1044  protein of unknown function DUF159  31.97 
 
 		 251 aa  84.3  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1263  protein of unknown function DUF159  34.53 
 
 		 257 aa  83.2  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.805714  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0985  hypothetical protein  37.25 
 
 		 227 aa  84  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2375  hypothetical protein  34.18 
 
 		 241 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.22179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13255  hypothetical protein  32.39 
 
 		 252 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.837677  normal  0.703311 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4324  hypothetical protein  30.21 
 
 		 252 aa  82  0.000000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2836  protein of unknown function DUF159  33.03 
 
 		 243 aa  82  0.000000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195669  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2952  hypothetical protein  27.63 
 
 		 242 aa  82  0.000000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.916913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1245  hypothetical protein  31.98 
 
 		 259 aa  81.6  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4098  hypothetical protein  32.13 
 
 		 239 aa  81.6  0.000000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00942019 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1903  protein of unknown function DUF159  30.54 
 
 		 252 aa  81.6  0.000000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0386  hypothetical protein  34.19 
 
 		 207 aa  81.3  0.000000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.782275  normal  0.223625 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2323  hypothetical protein  30.24 
 
 		 248 aa  80.5  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.059756  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4684  protein of unknown function DUF159  33.18 
 
 		 243 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.945433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4193  protein of unknown function DUF159  34.09 
 
 		 248 aa  79.7  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.772557  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3713  hypothetical protein  36.67 
 
 		 224 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4832  protein of unknown function DUF159  33.18 
 
 		 254 aa  79.3  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.350202 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14680  hypothetical protein  30.84 
 
 		 281 aa  79.3  0.00000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.29654  normal  0.170747 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6295  protein of unknown function DUF159  32.89 
 
 		 253 aa  79.3  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8327  hypothetical protein  30.19 
 
 		 253 aa  79.3  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1423  hypothetical protein  27.84 
 
 		 230 aa  79  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.918741 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30760  hypothetical protein  30.24 
 
 		 268 aa  79  0.00000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0442356  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1019  protein of unknown function DUF159  33.82 
 
 		 254 aa  78.6  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100486  normal  0.338541 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4315  hypothetical protein  32.72 
 
 		 255 aa  78.6  0.00000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.182894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1994  hypothetical protein  30.49 
 
 		 224 aa  78.2  0.00000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2142  hypothetical protein  33.7 
 
 		 248 aa  77.8  0.00000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0312675 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18820  hypothetical protein  30.97 
 
 		 274 aa  78.2  0.00000000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1393  protein of unknown function DUF159  34.12 
 
 		 262 aa  77.4  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.12322  normal  0.0795799 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4181  protein of unknown function DUF159  32.35 
 
 		 231 aa  77.4  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16700  hypothetical protein  33.33 
 
 		 237 aa  77.4  0.0000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3527  protein of unknown function DUF159  32.08 
 
 		 255 aa  77.8  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0853  protein of unknown function DUF159  31.95 
 
 		 270 aa  77.8  0.0000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.000000182403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1704  hypothetical protein  29.63 
 
 		 253 aa  76.6  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0118518  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1305  hypothetical protein  29.36 
 
 		 217 aa  77  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3717  hypothetical protein  30.91 
 
 		 242 aa  77  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2471  hypothetical protein  30.05 
 
 		 252 aa  77  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00656423 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0851  protein of unknown function DUF159  33.33 
 
 		 221 aa  76.3  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00651427  normal  0.246274 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4694  hypothetical protein  28.64 
 
 		 268 aa  76.3  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.601869  normal  0.0756375 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>