122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3653 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3653  metal-dependent hydrolase-like protein  100 
 
 		 284 aa  578  1e-164  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53530  hypothetical protein  77.49 
 
 		 277 aa  441  1e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000569349 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4691  hypothetical protein  77.49 
 
 		 277 aa  442  1e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.566925  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3654  metal-dependent hydrolase-like protein  70.85 
 
 		 281 aa  407  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2091  metal-dependent hydrolase  49.62 
 
 		 272 aa  268  7e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0083  metal-dependent hydrolase-like protein  48.35 
 
 		 282 aa  254  9e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2960  hypothetical protein  41.76 
 
 		 291 aa  224  1e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1930  metal-dependent hydrolase-like protein  43.06 
 
 		 293 aa  223  3e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.242298 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0165  hypothetical protein  40.66 
 
 		 297 aa  211  9e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44510  hypothetical protein  42.65 
 
 		 278 aa  207  1e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.319734 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2618  metal-dependent hydrolase-like protein  41.26 
 
 		 278 aa  203  3e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00276728  normal  0.902339 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3790  hypothetical protein  40.96 
 
 		 278 aa  202  5e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.422247  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2259  metal-dependent hydrolase-like  41.32 
 
 		 307 aa  195  9e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0372522  normal  0.0165927 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4526  metal-dependent hydrolase-like  41.32 
 
 		 305 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3837  metal-dependent hydrolase-like protein  41.32 
 
 		 305 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0372117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3688  metal-dependent hydrolase-like protein  41.32 
 
 		 305 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.676526  normal  0.405297 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4103  FF domain-containing protein  39.93 
 
 		 285 aa  191  1e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.852892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3737  metal-dependent hydrolase-like protein  40.89 
 
 		 307 aa  189  5e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.356192 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4513  metal-dependent hydrolase  41.11 
 
 		 285 aa  189  5e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2822  hypothetical protein  42.21 
 
 		 267 aa  188  7e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000149451  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4904  metal-dependent hydrolase-like protein  42.86 
 
 		 303 aa  188  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.529576  hitchhiker  0.000304166 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4528  metal-dependent hydrolase  40.36 
 
 		 301 aa  186  3e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.136227 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5624  metal-dependent hydrolase  40 
 
 		 301 aa  185  6e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.381605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4877  membrane protein  42.97 
 
 		 293 aa  185  9e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000561399  normal  0.621694 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0906  hypothetical protein  38.89 
 
 		 302 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1143  metal-dependent hydrolase  40.82 
 
 		 301 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.316817  normal  0.181741 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1791  hypothetical protein  42.58 
 
 		 293 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000624384 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2610  hypothetical protein  38.89 
 
 		 302 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2472  hypothetical protein  38.89 
 
 		 302 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0555  hypothetical protein  38.89 
 
 		 302 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0628824  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3692  metal-dependent hydrolase  39.78 
 
 		 301 aa  183  3e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4676  metal-dependent hydrolase  39.78 
 
 		 301 aa  183  3e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.170108  normal  0.216516 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5561  metal-dependent hydrolase-like protein  40.55 
 
 		 307 aa  181  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4017  metal-dependent hydrolase  39.64 
 
 		 301 aa  179  4e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.279425  normal  0.558393 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3135  hypothetical protein  40.49 
 
 		 300 aa  179  4.999999999999999e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.529853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0738  metal-dependent hydrolase  39.26 
 
 		 297 aa  178  8e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0667904 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4070  metal-dependent hydrolase  38.93 
 
 		 301 aa  178  8e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.954367  normal  0.413684 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1473  hypothetical protein  39.7 
 
 		 304 aa  176  3e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2523  hypothetical protein  39.33 
 
 		 304 aa  176  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0560  hypothetical protein  39.33 
 
 		 304 aa  176  4e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0259074  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1345  hypothetical protein  39.33 
 
 		 304 aa  176  4e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.512593  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1007  metal-dependent hydrolase  39.33 
 
 		 304 aa  176  4e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.618942  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0169  hypothetical protein  39 
 
 		 296 aa  169  4e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1341  hypothetical protein  39 
 
 		 296 aa  169  4e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2739  hypothetical protein  39 
 
 		 296 aa  169  4e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.910549  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1268  hypothetical protein  38.91 
 
 		 298 aa  169  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2596  hypothetical protein  39 
 
 		 296 aa  169  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0196  hypothetical protein  39 
 
 		 296 aa  169  4e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2446  hypothetical protein  39.3 
 
 		 294 aa  169  5e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1556  hypothetical protein  39.92 
 
 		 294 aa  169  6e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1703  hypothetical protein  39.3 
 
 		 294 aa  169  6e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1177  hypothetical protein  39.3 
 
 		 306 aa  168  7e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0723  hypothetical protein  39.3 
 
 		 306 aa  168  8e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.292888  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0738  hypothetical protein  39.3 
 
 		 306 aa  168  8e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2354  hypothetical protein  40.8 
 
 		 278 aa  168  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.19546  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0932  FF domain-containing protein  36.4 
 
 		 294 aa  167  2e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.438166  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1250  metal-dependent hydrolase  38.91 
 
 		 306 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1012  hypothetical protein  39.67 
 
 		 284 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2084  FF domain-containing protein  37.09 
 
 		 296 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.831461 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0463  hypothetical protein  38.19 
 
 		 301 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1350  FF domain-containing protein  36.96 
 
 		 287 aa  163  3e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.354335  normal  0.0894985 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3601  FF domain-containing protein  38.59 
 
 		 290 aa  160  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3362  FF domain protein  34.34 
 
 		 298 aa  146  3e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.270556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5371  hypothetical protein  35.66 
 
 		 311 aa  144  2e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.971328 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3015  FF domain protein  33.99 
 
 		 298 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4593  metal-dependent hydrolase  32.13 
 
 		 289 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.537917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0314  metal-dependent hydrolase  31.77 
 
 		 289 aa  136  5e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4629  metal-dependent hydrolase  32.61 
 
 		 289 aa  135  8e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3199  metal-dependent hydrolase  36.68 
 
 		 289 aa  132  7.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3261  metal-dependent hydrolase  36.68 
 
 		 289 aa  132  7.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.604698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3208  metal-dependent hydrolase  36.68 
 
 		 289 aa  132  7.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0453  hypothetical protein  36.45 
 
 		 302 aa  125  8.000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.113345  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0464  hypothetical protein  36.45 
 
 		 302 aa  125  8.000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.416793  normal  0.804555 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0440  hypothetical protein  36.45 
 
 		 302 aa  125  8.000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.820737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2251  putative metal-dependent hydrolase  32.88 
 
 		 311 aa  116  5e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000117397  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12790  hypothetical protein  30.58 
 
 		 356 aa  115  8.999999999999998e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.89049  normal  0.675408 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8730  hypothetical protein  31.31 
 
 		 301 aa  107  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.342187  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3084  hypothetical protein  31.63 
 
 		 296 aa  106  5e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.531586  normal  0.157485 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3425  hypothetical protein  32.56 
 
 		 300 aa  105  7e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.197255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3179  hypothetical protein  30.25 
 
 		 300 aa  103  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.17273  normal  0.100339 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2874  hypothetical protein  32.43 
 
 		 299 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.448592  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2918  hypothetical protein  32.43 
 
 		 299 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2904  hypothetical protein  32.43 
 
 		 299 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.486218 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4340  hypothetical protein  29.52 
 
 		 306 aa  95.5  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4392  metal-dependent hydrolase  29 
 
 		 301 aa  94.7  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.106904 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0478  Uncharacterized conserved protein UCP07580  29.85 
 
 		 298 aa  94.4  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0708  metal-dependent hydrolase  29.01 
 
 		 301 aa  92.4  7e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.180547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4911  metal-dependent hydrolase  30.67 
 
 		 301 aa  92.4  8e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.562642  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02367  hypothetical protein  31.9 
 
 		 250 aa  92  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.117709 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5316  metal-dependent hydrolase  28.62 
 
 		 301 aa  91.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283867  normal  0.14239 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1795  hypothetical protein  29.96 
 
 		 295 aa  92  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3397  metal-dependent hydrolase  28.62 
 
 		 312 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4970  metal-dependent hydrolase  28.62 
 
 		 301 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.189788 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3648  metal-dependent hydrolase  29.74 
 
 		 301 aa  90.9  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.434464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21040  hypothetical protein  30.51 
 
 		 295 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1757  hypothetical protein  27.7 
 
 		 290 aa  87.8  2e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0430  hypothetical protein  27.7 
 
 		 290 aa  87.8  2e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1093  Uncharacterized conserved protein UCP07580  31.86 
 
 		 293 aa  85.9  8e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1296  FF domain protein  29.49 
 
 		 298 aa  84.7  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0684567  normal  0.753503 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1360  metal-dependent hydrolase  29.95 
 
 		 298 aa  84  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>