43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0629 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_0629  chlorosome envelope protein X  100 
 
 		 198 aa  402  1e-111  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0769  ferredoxin  63.53 
 
 		 221 aa  231  6e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0877  ferredoxin  55.5 
 
 		 236 aa  221  4.9999999999999996e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2148  ferredoxin  55.98 
 
 		 205 aa  206  3e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0765  ferredoxin  56.38 
 
 		 277 aa  183  1.0000000000000001e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1879  chlorosome envelope protein X  57.25 
 
 		 162 aa  169  2e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0893  chlorosome envelope protein I  44.24 
 
 		 218 aa  128  5.0000000000000004e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1154  ferredoxin  42.5 
 
 		 356 aa  124  1e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.548936 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1728  ferredoxin  52.99 
 
 		 349 aa  123  2e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1698  ferredoxin  40.91 
 
 		 226 aa  122  3e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000684927 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1374  ferredoxin  41.14 
 
 		 355 aa  120  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000222813  normal  0.259595 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2149  ferredoxin  38.69 
 
 		 226 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1733  ferredoxin  43.67 
 
 		 355 aa  118  6e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0101582  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0876  ferredoxin  43.36 
 
 		 222 aa  117  9e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.931688  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1580  ferredoxin  43.31 
 
 		 360 aa  115  3.9999999999999997e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0768  ferredoxin  44.06 
 
 		 226 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0628  chlorosome envelope protein J  40.36 
 
 		 226 aa  109  2.0000000000000002e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1172  chlorosome envelope protein I  41.84 
 
 		 145 aa  108  4.0000000000000004e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.14427  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1296  ferredoxin  45.83 
 
 		 205 aa  91.7  6e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.543762 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0763  ferredoxin  38.55 
 
 		 228 aa  89.4  4e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0479  ferredoxin  40.23 
 
 		 137 aa  55.8  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3636  ferredoxin  37.65 
 
 		 98 aa  48.1  0.00009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.337263 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2293  adenylate/guanylate cyclase  37.04 
 
 		 578 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0853444 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0315  adenylate/guanylate cyclase  36.47 
 
 		 580 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0665679  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1091  ferredoxin  28.83 
 
 		 160 aa  45.1  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.661061 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0269  ferredoxin  38.57 
 
 		 94 aa  45.1  0.0006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0730  ferredoxin  28.7 
 
 		 570 aa  44.7  0.0009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.281306  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15350  ferredoxin  32.38 
 
 		 598 aa  44.3  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1298  ferredoxin, 2Fe-2S  36.11 
 
 		 111 aa  44.3  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.579463  normal  0.0110849 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0286  ferredoxin  33.33 
 
 		 113 aa  44.3  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2678  ferredoxin  33.33 
 
 		 104 aa  43.5  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0350247  normal  0.431777 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1438  vitamin B12 dependent methionine synthase, activation region  26.73 
 
 		 821 aa  43.1  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0698  ferredoxin  30.77 
 
 		 144 aa  43.1  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000117119  normal  0.26661 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4418  adenylate/guanylate cyclase  38.46 
 
 		 547 aa  42.4  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.9724  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1905  ferredoxin  35.82 
 
 		 100 aa  42.4  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1329  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  24.77 
 
 		 112 aa  42  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4417  adenylate/guanylate cyclase  29.69 
 
 		 574 aa  42  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0760  ferredoxin, 2Fe-2S  35.82 
 
 		 95 aa  41.6  0.007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1450  ferredoxin  38.81 
 
 		 95 aa  42  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3169  ferredoxin  30.91 
 
 		 160 aa  41.6  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.404663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0642  ferredoxin  31.94 
 
 		 101 aa  41.2  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.022084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5604  adenylate cyclase  35.38 
 
 		 571 aa  41.2  0.01  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1463  ferredoxin, 2Fe-2S type  34.72 
 
 		 111 aa  41.2  0.01  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0113872  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>