More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3278 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3278  dihydrodipicolinate reductase  100 
 
 		 267 aa  541  1e-153  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.421535  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1854  dihydrodipicolinate reductase  44.07 
 
 		 269 aa  227  2e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.480596  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2809  dihydrodipicolinate reductase  42.11 
 
 		 271 aa  219  3e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000126202  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62940  dihydrodipicolinate reductase  44.78 
 
 		 268 aa  218  7.999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5479  dihydrodipicolinate reductase  44.4 
 
 		 268 aa  218  1e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0777  dihydrodipicolinate reductase  44.94 
 
 		 267 aa  217  1e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.486297  hitchhiker  0.000134832 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0974  Dihydrodipicolinate reductase  42.96 
 
 		 267 aa  217  1e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.795296  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1970  dihydrodipicolinate reductase  42.7 
 
 		 269 aa  217  2e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.150485  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3579  dihydrodipicolinate reductase  42.32 
 
 		 271 aa  216  2e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0145714  normal  0.121498 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3042  dihydrodipicolinate reductase  42.44 
 
 		 266 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4193  dihydrodipicolinate reductase  43.07 
 
 		 267 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2505  dihydrodipicolinate reductase  43.45 
 
 		 270 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.146607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3622  dihydrodipicolinate reductase  43.45 
 
 		 267 aa  216  4e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42950  dihydrodipicolinate reductase  43.82 
 
 		 267 aa  215  5e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0160  dihydrodipicolinate reductase  41.48 
 
 		 266 aa  214  9e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4725  dihydrodipicolinate reductase  42.7 
 
 		 267 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.111929  hitchhiker  0.00253408 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4503  dihydrodipicolinate reductase  42.32 
 
 		 267 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4053  dihydrodipicolinate reductase  40.89 
 
 		 267 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0872  dihydrodipicolinate reductase  41.73 
 
 		 266 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.11432  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3405  dihydrodipicolinate reductase  41.95 
 
 		 271 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.408916  hitchhiker  0.000220651 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0707  dihydrodipicolinate reductase  42.86 
 
 		 267 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.165217  hitchhiker  0.00943126 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4726  dihydrodipicolinate reductase  42.86 
 
 		 267 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.699966  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4143  dihydrodipicolinate reductase  40.89 
 
 		 267 aa  212  4.9999999999999996e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1150  dihydrodipicolinate reductase  41.2 
 
 		 266 aa  212  4.9999999999999996e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0360461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3360  dihydrodipicolinate reductase  41.95 
 
 		 267 aa  212  4.9999999999999996e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0188921  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004481  dihydrodipicolinate reductase  40.82 
 
 		 269 aa  211  7.999999999999999e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4553  dihydrodipicolinate reductase  44.98 
 
 		 284 aa  211  9e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0936  dihydrodipicolinate reductase  42.28 
 
 		 268 aa  211  1e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0477  dihydrodipicolinate reductase  41.7 
 
 		 269 aa  211  1e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4591  dihydrodipicolinate reductase  42.48 
 
 		 267 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.639045  normal  0.509503 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00911  dihydrodipicolinate reductase  40.82 
 
 		 269 aa  211  1e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0235  dihydrodipicolinate reductase  41.48 
 
 		 267 aa  211  1e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0212  dihydrodipicolinate reductase  41.26 
 
 		 266 aa  210  2e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.17732  hitchhiker  0.000000000618178 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0476  dihydrodipicolinate reductase  43.33 
 
 		 269 aa  209  3e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0974  dihydrodipicolinate reductase  44.19 
 
 		 270 aa  209  3e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000335304  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1140  dihydrodipicolinate reductase  41.57 
 
 		 270 aa  208  6e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1582  dihydrodipicolinate reductase  41.48 
 
 		 268 aa  208  6e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00032716  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0755  dihydrodipicolinate reductase  42.91 
 
 		 271 aa  208  8e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0966  dihydrodipicolinate reductase  41.57 
 
 		 270 aa  207  2e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000239889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0835  dihydrodipicolinate reductase  39.7 
 
 		 270 aa  206  3e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0761651  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0964  dihydrodipicolinate reductase  41.95 
 
 		 270 aa  206  3e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000624592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1002  dihydrodipicolinate reductase  41.95 
 
 		 270 aa  206  3e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00177557  normal  0.985837 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4608  dihydrodipicolinate reductase  45.69 
 
 		 270 aa  206  4e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.745671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2735  dihydrodipicolinate reductase  43.61 
 
 		 265 aa  206  5e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.932865 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3076  dihydrodipicolinate reductase  41.57 
 
 		 274 aa  205  7e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00138759  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0221  dihydrodipicolinate reductase  43.28 
 
 		 276 aa  204  1e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3460  dihydrodipicolinate reductase  40.23 
 
 		 268 aa  203  2e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.734477  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0765  dihydrodipicolinate reductase  42.91 
 
 		 268 aa  203  2e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0122187  normal  0.374891 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0994  dihydrodipicolinate reductase  41.57 
 
 		 270 aa  202  3e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000395261  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3062  dihydrodipicolinate reductase  39.55 
 
 		 267 aa  203  3e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.304579  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3270  dihydrodipicolinate reductase  41.95 
 
 		 273 aa  202  4e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2422  dihydrodipicolinate reductase  41.95 
 
 		 267 aa  202  5e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000419858  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0355  dihydrodipicolinate reductase  43.61 
 
 		 268 aa  202  5e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.278702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6007  dihydrodipicolinate reductase  42.86 
 
 		 278 aa  202  5e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.850549 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2591  dihydrodipicolinate reductase  42.86 
 
 		 265 aa  202  6e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000325383 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2840  dihydrodipicolinate reductase  41.35 
 
 		 271 aa  202  6e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000040359  normal  0.0597866 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1564  dihydrodipicolinate reductase  41.2 
 
 		 268 aa  201  7e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.525131  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0035  dihydrodipicolinate reductase  39.93 
 
 		 276 aa  201  8e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2745  dihydrodipicolinate reductase  43.61 
 
 		 263 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0028  dihydrodipicolinate reductase  39.63 
 
 		 278 aa  201  9.999999999999999e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3922  dihydrodipicolinate reductase  41.57 
 
 		 273 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2574  dihydrodipicolinate reductase  42.86 
 
 		 263 aa  199  3e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0584  dihydrodipicolinate reductase  41.2 
 
 		 269 aa  200  3e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0724522  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2984  dihydrodipicolinate reductase  42.86 
 
 		 263 aa  199  3e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1070  dihydrodipicolinate reductase  41.95 
 
 		 282 aa  199  3.9999999999999996e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3306  dihydrodipicolinate reductase  40.82 
 
 		 270 aa  199  5e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000173903  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3402  dihydrodipicolinate reductase  40.82 
 
 		 270 aa  199  5e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000810417  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3527  dihydrodipicolinate reductase  40.82 
 
 		 270 aa  199  5e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0063333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0573  dihydrodipicolinate reductase  41.73 
 
 		 265 aa  199  5e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1050  dihydrodipicolinate reductase  40.82 
 
 		 270 aa  199  5e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000677539  hitchhiker  0.00000153005 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1208  dihydrodipicolinate reductase  42.28 
 
 		 268 aa  198  6e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.290649  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0546  dihydrodipicolinate reductase  42.32 
 
 		 265 aa  198  7e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0735119  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3418  dihydrodipicolinate reductase  42.28 
 
 		 268 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.550053  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3455  dihydrodipicolinate reductase  42.28 
 
 		 268 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3737  dihydrodipicolinate reductase  42.86 
 
 		 265 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.221404 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2941  dihydrodipicolinate reductase  40.45 
 
 		 270 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00113779  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0572  dihydrodipicolinate reductase  42.32 
 
 		 265 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.260909 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0408  dihydrodipicolinate reductase  43.41 
 
 		 254 aa  197  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0231  dihydrodipicolinate reductase  39.85 
 
 		 267 aa  196  3e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2835  dihydrodipicolinate reductase  41.79 
 
 		 265 aa  196  3e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1844  dihydrodipicolinate reductase  43.94 
 
 		 264 aa  196  3e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00698201 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3453  dihydrodipicolinate reductase  42.7 
 
 		 265 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492888  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0618  dihydrodipicolinate reductase  42.11 
 
 		 265 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.227402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4216  dihydrodipicolinate reductase  43.7 
 
 		 270 aa  195  6e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0940051  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1474  dihydrodipicolinate reductase  41.86 
 
 		 267 aa  195  6e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4191  dihydrodipicolinate reductase  43.7 
 
 		 270 aa  195  8.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0373  dihydrodipicolinate reductase  41.91 
 
 		 268 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.935631  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2456  dihydrodipicolinate reductase  41.91 
 
 		 268 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.660622  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2643  dihydrodipicolinate reductase  41.91 
 
 		 268 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1232  dihydrodipicolinate reductase  41.91 
 
 		 268 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0168  dihydrodipicolinate reductase  41.73 
 
 		 265 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.757429  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1729  dihydrodipicolinate reductase  42.28 
 
 		 268 aa  194  1e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0651  dihydrodipicolinate reductase  41.73 
 
 		 265 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.387515  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3087  dihydrodipicolinate reductase  39.26 
 
 		 269 aa  192  5e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.682276  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2216  dihydrodipicolinate reductase  37.92 
 
 		 267 aa  191  1e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0282245  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0070  dihydrodipicolinate reductase  38.95 
 
 		 273 aa  190  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4068  dihydrodipicolinate reductase  42.59 
 
 		 270 aa  190  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02245  dihydrodipicolinate reductase  40.07 
 
 		 267 aa  191  2e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0695174  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0712  dihydrodipicolinate reductase  39.33 
 
 		 273 aa  190  2e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.128624 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2974  dihydrodipicolinate reductase  38.95 
 
 		 265 aa  189  4e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>