More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2052 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2052  guanylate kinase  100 
 
 		 206 aa  425  1e-118  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0808  guanylate kinase  48.86 
 
 		 192 aa  160  1e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.116088  normal  0.89906 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2946  guanylate kinase  45.6 
 
 		 181 aa  160  1e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.641883  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2168  guanylate kinase  47.43 
 
 		 188 aa  154  8e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.822318  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0012  guanylate kinase  46.45 
 
 		 189 aa  153  2e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.897517  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3208  guanylate kinase  44.62 
 
 		 186 aa  151  7e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.703275  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0483  guanylate kinase  43.41 
 
 		 181 aa  149  2e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5548  guanylate kinase  42.93 
 
 		 199 aa  150  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1761  guanylate kinase  41.27 
 
 		 207 aa  149  4e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02200  guanylate kinase  43.01 
 
 		 198 aa  149  4e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1475  guanylate kinase  43.78 
 
 		 199 aa  148  5e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000468376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05311  guanylate kinase  41.21 
 
 		 184 aa  148  5e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4197  guanylate kinase  46.55 
 
 		 189 aa  148  6e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00373006  normal  0.574711 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4124  Guanylate kinase  43.23 
 
 		 233 aa  147  8e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1058  guanylate kinase  43.58 
 
 		 204 aa  147  9e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000145749  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2001  guanylate kinase  41.9 
 
 		 216 aa  147  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1719  guanylate kinase  41.9 
 
 		 216 aa  147  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0404  guanylate kinase  41.44 
 
 		 194 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0209165  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1948  guanylate kinase  41.34 
 
 		 205 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09810  Guanylate kinase  42.22 
 
 		 194 aa  146  2.0000000000000003e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1773  guanylate kinase  40.44 
 
 		 197 aa  144  7.0000000000000006e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.159684 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3894  guanylate kinase  43.41 
 
 		 200 aa  144  7.0000000000000006e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000112061  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1700  guanylate kinase  40.11 
 
 		 200 aa  144  7.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0742  guanylate kinase  43.17 
 
 		 190 aa  144  1e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0052  guanylate kinase  42.19 
 
 		 210 aa  143  2e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00408303  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04921  guanylate kinase  39.23 
 
 		 184 aa  142  3e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.032848  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1713  guanylate kinase  43.41 
 
 		 198 aa  142  4e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.463283  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0195  guanylate kinase  42.86 
 
 		 188 aa  141  5e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0190  guanylate kinase  42.86 
 
 		 184 aa  142  5e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.160767 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3827  guanylate kinase  41.76 
 
 		 189 aa  142  5e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.536013  normal  0.161762 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0091  guanylate kinase  40.88 
 
 		 207 aa  141  5e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3433  guanylate kinase  37.77 
 
 		 207 aa  142  5e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.21703  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2138  guanylate kinase  39.25 
 
 		 205 aa  141  6e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.585915  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0467  guanylate kinase  38.67 
 
 		 184 aa  141  6e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05231  guanylate kinase  39.23 
 
 		 184 aa  140  9e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1329  guanylate kinase  40.96 
 
 		 204 aa  139  1.9999999999999998e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000708025  normal  0.428768 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03505  guanylate kinase  39.89 
 
 		 207 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0057  Guanylate kinase  39.89 
 
 		 207 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0776  guanylate kinase  41.21 
 
 		 207 aa  140  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.753859  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4151  guanylate kinase  39.89 
 
 		 207 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4020  guanylate kinase  40.33 
 
 		 207 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0063  guanylate kinase  39.89 
 
 		 207 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000240109 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1638  guanylate kinase  41.71 
 
 		 208 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3983  guanylate kinase  39.89 
 
 		 207 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0360  guanylate kinase  37.23 
 
 		 210 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03457  hypothetical protein  39.89 
 
 		 207 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4066  guanylate kinase  40.33 
 
 		 207 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0785  guanylate kinase  42.22 
 
 		 201 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000101008  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3957  guanylate kinase  40.33 
 
 		 207 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0353  guanylate kinase  37.23 
 
 		 210 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3948  guanylate kinase  40.33 
 
 		 207 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00531185 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4581  guanylate kinase  40.44 
 
 		 207 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.877029  unclonable  0.0000000250462 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0355  guanylate kinase  37.23 
 
 		 210 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.398163  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3859  guanylate kinase  39.89 
 
 		 207 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4099  guanylate kinase  39.89 
 
 		 207 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4127  guanylate kinase  40.33 
 
 		 207 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.514606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3426  Guanylate kinase  41.67 
 
 		 194 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07800  guanylate kinase  40.98 
 
 		 189 aa  139  3e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.364153  normal  0.897368 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0632  guanylate kinase  42.78 
 
 		 185 aa  139  3e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11418  guanylate kinase  40.22 
 
 		 217 aa  139  3e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000747341  normal  0.348875 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0365  guanylate kinase  37.77 
 
 		 207 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0363  guanylate kinase  36.7 
 
 		 210 aa  138  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000053777 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3810  guanylate kinase  38.25 
 
 		 207 aa  138  4.999999999999999e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.18291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0207  guanylate kinase  40.54 
 
 		 190 aa  138  6e-32  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.931421  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4145  guanylate kinase  39.36 
 
 		 207 aa  137  1e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2411  guanylate kinase  39.89 
 
 		 198 aa  137  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5020  guanylate kinase  39.36 
 
 		 207 aa  137  1e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1597  guanylate kinase  43.41 
 
 		 197 aa  137  1e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00198885  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1457  guanylate kinase  40.86 
 
 		 212 aa  137  1e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3613  guanylate kinase  38.46 
 
 		 207 aa  137  1e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0330  guanylate kinase  38.25 
 
 		 224 aa  137  1e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0351596  normal  0.331396 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1398  guanylate kinase  40.11 
 
 		 209 aa  137  1e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00115166  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3630  guanylate kinase  42.33 
 
 		 209 aa  137  1e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.601224  normal  0.100424 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0361  guanylate kinase  38.25 
 
 		 207 aa  136  2e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1293  guanylate kinase  40.11 
 
 		 207 aa  136  2e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4981  guanylate kinase  41.11 
 
 		 198 aa  136  2e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.023832  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2692  guanylate kinase  41.05 
 
 		 225 aa  136  2e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1268  guanylate kinase  40.11 
 
 		 207 aa  136  2e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.33638  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0266  guanylate kinase  39.04 
 
 		 207 aa  136  2e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2787  guanylate kinase  41.49 
 
 		 225 aa  136  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3623  guanylate kinase  42.46 
 
 		 207 aa  136  3.0000000000000003e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2606  guanylate kinase  40.62 
 
 		 226 aa  135  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.100354  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1315  guanylate kinase  38.1 
 
 		 203 aa  135  3.0000000000000003e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.559001  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0336  guanylate kinase  39.01 
 
 		 207 aa  135  4e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.57704 
 
 
-
 
NC_002950  PG0512  guanylate kinase  42.37 
 
 		 188 aa  135  4e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.101295 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0313  guanylate kinase  39.56 
 
 		 209 aa  135  4e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0875391  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2370  guanylate kinase  39.36 
 
 		 198 aa  135  4e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0470056  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1473  guanylate kinase  39.56 
 
 		 191 aa  135  4e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.110392  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2834  guanylate kinase  39.67 
 
 		 186 aa  135  4e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.522471  normal  0.276726 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2401  guanylate kinase  37.77 
 
 		 202 aa  135  4e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0298091  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2417  guanylate kinase  39.36 
 
 		 198 aa  135  4e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.391978 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0634  guanylate kinase  39.56 
 
 		 210 aa  135  5e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1910  guanylate kinase  38.27 
 
 		 210 aa  134  7.000000000000001e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000116154  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3877  guanylate kinase  36.17 
 
 		 210 aa  134  7.000000000000001e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1456  guanylate kinase  39.25 
 
 		 190 aa  134  9e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000938556  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0099  guanylate kinase  40.34 
 
 		 204 aa  134  9e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.261524  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0177  guanylate kinase  40.32 
 
 		 206 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000695034 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3497  guanylate kinase  37.7 
 
 		 207 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3948  guanylate kinase  38.83 
 
 		 207 aa  133  1.9999999999999998e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.498976  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3630  guanylate kinase  37.16 
 
 		 224 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.09026  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>