More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1181 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1181  Methyltransferase type 11  100 
 
 		 397 aa  809    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.694662  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4679  Methyltransferase type 11  40.11 
 
 		 251 aa  126  6e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2226  hypothetical protein  32.42 
 
 		 251 aa  113  5e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.18592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3469  Methyltransferase type 11  46.15 
 
 		 243 aa  110  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.508961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2150  methyltransferase type 11  35.71 
 
 		 255 aa  110  4.0000000000000004e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.301161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0768  Methyltransferase type 11  35.16 
 
 		 276 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.990555 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4188  Methyltransferase type 11  39.5 
 
 		 278 aa  102  1e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0656  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 280 aa  97.4  4e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.656223  normal  0.351614 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0667  Methyltransferase type 11  28.81 
 
 		 243 aa  92.8  9e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.536233  normal  0.0338996 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0635  Methyltransferase type 11  30.29 
 
 		 244 aa  90.9  4e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.188997 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3622  methyltransferase type 11  32.56 
 
 		 243 aa  87.8  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.932817  normal  0.0502026 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1386  hypothetical protein  37.5 
 
 		 165 aa  86.3  9e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.876473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1436  Methyltransferase type 11  29.53 
 
 		 231 aa  84.3  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00774998  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1338  Methyltransferase type 11  29.53 
 
 		 244 aa  84.3  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.482498  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2392  hypothetical protein  34.85 
 
 		 181 aa  83.2  0.000000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2515  methyltransferase type 11  29.53 
 
 		 222 aa  83.2  0.000000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.245025  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6718  Methyltransferase type 11  29.21 
 
 		 252 aa  82  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2707  Methyltransferase type 11  32.2 
 
 		 199 aa  81.6  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3178  methyltransferase type 11  34.88 
 
 		 239 aa  80.9  0.00000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.184817 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1251  Methyltransferase type 11  27.98 
 
 		 216 aa  80.1  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.000000494899  normal  0.377886 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1599  hypothetical protein  32.54 
 
 		 190 aa  79.7  0.00000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.163605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0406  hypothetical protein  34.38 
 
 		 180 aa  79  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.612402  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1145  Methyltransferase type 11  28.39 
 
 		 208 aa  79.3  0.0000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0931  hypothetical protein  34.34 
 
 		 195 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.48 
 
 		 201 aa  73.9  0.000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1351  methyltransferase type 11  28.67 
 
 		 217 aa  73.9  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.884704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2313  generic methyltransferase  37.6 
 
 		 252 aa  72.4  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0714275  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1265  hypothetical protein  32.24 
 
 		 188 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000222188 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3111  hypothetical protein  32.24 
 
 		 188 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2998  hypothetical protein  32.67 
 
 		 188 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.695774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4278  Methyltransferase type 11  39.37 
 
 		 186 aa  71.2  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.867588  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4328  Methyltransferase type 11  39.37 
 
 		 188 aa  71.2  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2818  hypothetical protein  32.67 
 
 		 188 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3101  hypothetical protein  32.24 
 
 		 188 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2622  Methyltransferase type 11  24.86 
 
 		 191 aa  70.9  0.00000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.179692  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3254  hypothetical protein  32.67 
 
 		 188 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2901  hypothetical protein  33.11 
 
 		 188 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0294  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methlytransferase UbiE  34.4 
 
 		 271 aa  68.6  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00915266  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0330  methyltransferase type 11  31.5 
 
 		 199 aa  67.8  0.0000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3707  Methyltransferase type 11  34.31 
 
 		 184 aa  67  0.0000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.52514  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1067  transcriptional regulator, ArsR family  35.14 
 
 		 305 aa  65.9  0.000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.420275 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3456  hypothetical protein  26.42 
 
 		 251 aa  65.9  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0402  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.77 
 
 		 254 aa  65.1  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.866144  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3051  hypothetical protein  29.9 
 
 		 267 aa  64.7  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.195507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3945  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.21 
 
 		 251 aa  64.3  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2464  Methyltransferase type 11  33.12 
 
 		 187 aa  64.3  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.788915  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00562  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.96 
 
 		 259 aa  64.7  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3641  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.21 
 
 		 251 aa  64.3  0.000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0881  hypothetical protein  25.79 
 
 		 183 aa  64.7  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.421379  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0271  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.21 
 
 		 251 aa  64.3  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1224  methyltransferase type 11  36.13 
 
 		 206 aa  63.9  0.000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03726  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.48 
 
 		 251 aa  63.9  0.000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4178  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.34 
 
 		 251 aa  63.9  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.962772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4201  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.34 
 
 		 251 aa  63.9  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4357  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.34 
 
 		 251 aa  63.9  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4297  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.34 
 
 		 251 aa  63.9  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4250  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.34 
 
 		 251 aa  63.9  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.81268  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03675  hypothetical protein  34.48 
 
 		 251 aa  63.9  0.000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2432  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.09 
 
 		 260 aa  63.5  0.000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1396  Methyltransferase type 11  34.96 
 
 		 190 aa  63.5  0.000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.482862  normal  0.887166 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0772  Methyltransferase type 11  35 
 
 		 209 aa  63.5  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0558  Methyltransferase type 11  25.81 
 
 		 188 aa  63.2  0.000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0166016  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2291  hypothetical protein  28.15 
 
 		 263 aa  63.2  0.000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.6 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1198  SAM-dependent methyltransferase  36.13 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4146  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.48 
 
 		 251 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3960  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.62 
 
 		 251 aa  62.4  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0746465 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5274  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.48 
 
 		 251 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.123369  normal  0.211011 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4354  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.48 
 
 		 251 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.556022  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4035  ArsR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 312 aa  62.4  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140406 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4216  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.48 
 
 		 251 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00227535 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4175  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.48 
 
 		 251 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0103348 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4057  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.48 
 
 		 251 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0164  UbiE/COQ5 family methlytransferase  26.51 
 
 		 207 aa  62.4  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4305  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.48 
 
 		 251 aa  62.8  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0746  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.17 
 
 		 251 aa  62.4  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001927  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase UbiE/COQ5  34.21 
 
 		 259 aa  62  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5813  Methyltransferase type 11  34.51 
 
 		 258 aa  62.4  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.288082  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2996  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.48 
 
 		 254 aa  62  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0757  Methyltransferase type 11  34.65 
 
 		 209 aa  61.6  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000851252  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4310  hypothetical protein  34.26 
 
 		 261 aa  62  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1507  hypothetical protein  33.63 
 
 		 184 aa  61.2  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3763  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.34 
 
 		 251 aa  60.8  0.00000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2226  methyltransferase type 11  28.12 
 
 		 285 aa  60.1  0.00000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0827676  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0861  putative methyltransferase  27.69 
 
 		 199 aa  60.1  0.00000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000766144  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4209  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  33.63 
 
 		 266 aa  60.1  0.00000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0248  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.62 
 
 		 251 aa  59.7  0.00000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.205211 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0017  Methyltransferase type 11  25.19 
 
 		 191 aa  58.9  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.677573  normal  0.0406571 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0006  hypothetical protein  23.86 
 
 		 271 aa  59.3  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.868865  normal  0.0557095 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1136  Methyltransferase type 11  23.91 
 
 		 273 aa  59.3  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.224282  normal  0.55506 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4185  hypothetical protein  23.12 
 
 		 265 aa  59.7  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0341246  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0542  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  33.62 
 
 		 261 aa  59.3  0.0000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03490  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.76 
 
 		 261 aa  59.3  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1654  methyltransferase type 11  29.46 
 
 		 173 aa  58.5  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.682174  hitchhiker  0.00196009 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3596  methyltransferase type 11  26.51 
 
 		 241 aa  58.2  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.288891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2996  methyltransferase type 11  32.46 
 
 		 273 aa  58.5  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2591  hypothetical protein  33.33 
 
 		 173 aa  58.5  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0168  UbiE/COQ5 family methlytransferase  29.6 
 
 		 207 aa  58.2  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2874  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  24.82 
 
 		 273 aa  57.8  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.522962 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2992  methyltransferase type 11  27.84 
 
 		 229 aa  58.2  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.547914  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>