17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1599 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_1599  hypothetical protein  100 
 
 		 190 aa  392  1e-108  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.163605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3101  hypothetical protein  49.74 
 
 		 188 aa  180  1e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3254  hypothetical protein  49.74 
 
 		 188 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3111  hypothetical protein  49.74 
 
 		 188 aa  178  4e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1265  hypothetical protein  52.27 
 
 		 188 aa  176  2e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000222188 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2998  hypothetical protein  48.91 
 
 		 188 aa  169  2e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.695774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0931  hypothetical protein  46.84 
 
 		 195 aa  167  7e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2818  hypothetical protein  49.72 
 
 		 188 aa  163  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2901  hypothetical protein  48.17 
 
 		 188 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0406  hypothetical protein  45.98 
 
 		 180 aa  154  9e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.612402  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2942  hypothetical protein  47.47 
 
 		 181 aa  126  2.0000000000000002e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1181  Methyltransferase type 11  32.54 
 
 		 397 aa  79.7  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.694662  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1386  hypothetical protein  30.92 
 
 		 165 aa  69.3  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.876473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00941  hypothetical protein  62.75 
 
 		 51 aa  68.9  0.00000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.479751  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2392  hypothetical protein  29.61 
 
 		 181 aa  68.6  0.00000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0874  hypothetical protein  27.74 
 
 		 171 aa  56.2  0.0000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.100983  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1843  hypothetical protein  27.17 
 
 		 169 aa  42.4  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>