17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_2998 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008577  Shewana3_2998  hypothetical protein  100 
 
 
188 aa  381  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.695774  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2818  hypothetical protein  97.87 
 
 
188 aa  374  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2901  hypothetical protein  95.21 
 
 
188 aa  369  1e-101  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3111  hypothetical protein  76.06 
 
 
188 aa  295  3e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3254  hypothetical protein  75.53 
 
 
188 aa  294  6e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1265  hypothetical protein  75.53 
 
 
188 aa  293  1e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000222188 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3101  hypothetical protein  75 
 
 
188 aa  291  6e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0931  hypothetical protein  55.49 
 
 
195 aa  209  2e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1599  hypothetical protein  48.91 
 
 
190 aa  169  2e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.163605  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0406  hypothetical protein  46.47 
 
 
180 aa  153  1e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.612402  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2942  hypothetical protein  43.2 
 
 
181 aa  132  3e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2392  hypothetical protein  33.85 
 
 
181 aa  74.3  0.0000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1181  Methyltransferase type 11  32.67 
 
 
397 aa  71.6  0.000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.694662  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1386  hypothetical protein  32.56 
 
 
165 aa  66.6  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.876473  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00941  hypothetical protein  57.14 
 
 
51 aa  60.1  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.479751  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2591  hypothetical protein  32.69 
 
 
173 aa  51.6  0.000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0874  hypothetical protein  27.61 
 
 
171 aa  48.9  0.00005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.100983  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>