17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_2901 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_2901  hypothetical protein  100 
 
 		 188 aa  383  1e-106  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2818  hypothetical protein  96.28 
 
 		 188 aa  372  1e-102  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2998  hypothetical protein  95.21 
 
 		 188 aa  369  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.695774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3111  hypothetical protein  73.4 
 
 		 188 aa  288  5.0000000000000004e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3254  hypothetical protein  72.87 
 
 		 188 aa  286  9e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1265  hypothetical protein  72.87 
 
 		 188 aa  285  2e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000222188 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3101  hypothetical protein  72.34 
 
 		 188 aa  283  9e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0931  hypothetical protein  54.4 
 
 		 195 aa  204  5e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1599  hypothetical protein  48.17 
 
 		 190 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.163605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0406  hypothetical protein  45.88 
 
 		 180 aa  151  5.9999999999999996e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.612402  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2942  hypothetical protein  43.79 
 
 		 181 aa  133  9.999999999999999e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2392  hypothetical protein  32.31 
 
 		 181 aa  72.4  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1181  Methyltransferase type 11  33.11 
 
 		 397 aa  70.5  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.694662  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1386  hypothetical protein  33.33 
 
 		 165 aa  67.8  0.00000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.876473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00941  hypothetical protein  57.14 
 
 		 51 aa  59.7  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.479751  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2591  hypothetical protein  30 
 
 		 173 aa  52.4  0.000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0874  hypothetical protein  26.87 
 
 		 171 aa  47  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.100983  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>