16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1386 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_1386  hypothetical protein  100 
 
 
165 aa  333  7e-91  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.876473  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1181  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 
397 aa  96.3  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.694662  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2392  hypothetical protein  36.02 
 
 
181 aa  94.4  7e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1599  hypothetical protein  30.92 
 
 
190 aa  77.4  0.00000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.163605  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0406  hypothetical protein  29.8 
 
 
180 aa  77.4  0.00000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.612402  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2901  hypothetical protein  33.33 
 
 
188 aa  74.3  0.0000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2818  hypothetical protein  32.56 
 
 
188 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2998  hypothetical protein  32.56 
 
 
188 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.695774  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2591  hypothetical protein  38.35 
 
 
173 aa  71.2  0.000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3254  hypothetical protein  31.13 
 
 
188 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3101  hypothetical protein  31.58 
 
 
188 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3111  hypothetical protein  31.58 
 
 
188 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1265  hypothetical protein  31.58 
 
 
188 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000222188 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0931  hypothetical protein  31.13 
 
 
195 aa  65.1  0.0000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2602  hypothetical protein  29.23 
 
 
115 aa  47  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00587907  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0874  hypothetical protein  34 
 
 
171 aa  42.4  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.100983  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>