17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0406 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0406  hypothetical protein  100 
 
 		 180 aa  373  1e-102  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.612402  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0931  hypothetical protein  50 
 
 		 195 aa  166  2e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1599  hypothetical protein  45.98 
 
 		 190 aa  154  8e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.163605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2818  hypothetical protein  45.51 
 
 		 188 aa  153  1e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2998  hypothetical protein  46.47 
 
 		 188 aa  153  1e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.695774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2901  hypothetical protein  45.88 
 
 		 188 aa  151  5e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3101  hypothetical protein  45.4 
 
 		 188 aa  142  2e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1265  hypothetical protein  43.65 
 
 		 188 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000222188 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3111  hypothetical protein  44.83 
 
 		 188 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3254  hypothetical protein  44.25 
 
 		 188 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2942  hypothetical protein  41.52 
 
 		 181 aa  122  2e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2392  hypothetical protein  35.8 
 
 		 181 aa  98.6  4e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1181  Methyltransferase type 11  34.38 
 
 		 397 aa  79  0.00000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.694662  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1386  hypothetical protein  29.8 
 
 		 165 aa  71.2  0.000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.876473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0874  hypothetical protein  29.1 
 
 		 171 aa  68.6  0.00000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.100983  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00941  hypothetical protein  59.18 
 
 		 51 aa  63.9  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.479751  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2591  hypothetical protein  30.47 
 
 		 173 aa  62  0.000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>