76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0653 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0653  hypothetical protein  100 
 
 		 431 aa  892    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.379776  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2717  hypothetical protein  35.78 
 
 		 457 aa  251  2e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2649  hypothetical protein  35.88 
 
 		 457 aa  236  5.0000000000000005e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2392  hypothetical protein  33.72 
 
 		 413 aa  222  9.999999999999999e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.385122 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6090  hypothetical protein  32.13 
 
 		 398 aa  187  2e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0355  hypothetical protein  31.52 
 
 		 415 aa  181  2.9999999999999997e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.864294  normal  0.837477 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2038  hypothetical protein  29.12 
 
 		 418 aa  169  9e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0333853  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2392  hypothetical protein  31.16 
 
 		 416 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.114533  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10013  hypothetical protein  30.79 
 
 		 390 aa  166  8e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0410796  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0393  hypothetical protein  31.15 
 
 		 418 aa  166  9e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0299  hypothetical protein  30.97 
 
 		 415 aa  165  2.0000000000000002e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.184137  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3271  sugar phosphate nucleotydyl transferase  31.63 
 
 		 397 aa  164  3e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0635  hypothetical protein  29 
 
 		 409 aa  163  7e-39  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2049  hypothetical protein  29.52 
 
 		 417 aa  162  9e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0404776  normal  0.28039 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2374  hypothetical protein  31.44 
 
 		 420 aa  160  5e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.41454  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0490  hexapeptide repeat-containing protein  28.54 
 
 		 389 aa  159  1e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0108  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase/translation initiation factor 2B gamma/epsilon subunits-like protein  28.37 
 
 		 391 aa  159  1e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.587569  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1851  hypothetical protein  29.68 
 
 		 417 aa  149  1.0000000000000001e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1567  hypothetical protein  27.32 
 
 		 391 aa  143  6e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.405342  normal  0.475535 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6210  hypothetical protein  26.85 
 
 		 389 aa  124  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1548  sugar phospate transferase  38.1 
 
 		 377 aa  86.3  0.000000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.492099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0619  sugar phospate transferase  32.65 
 
 		 334 aa  85.5  0.000000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.496353  hitchhiker  0.0000000866776 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1692  sugar phospate transferase  34.44 
 
 		 334 aa  84.3  0.000000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000413116 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1083  Nucleotidyl transferase  32 
 
 		 402 aa  80.1  0.00000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.39401 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1502  sugar phospate transferase  31.93 
 
 		 334 aa  80.1  0.00000000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1564  sugar phospate transferase  29.87 
 
 		 334 aa  79.3  0.0000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000011841 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0666  hypothetical protein  34.97 
 
 		 399 aa  78.2  0.0000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0314  Nucleotidyl transferase  31.21 
 
 		 400 aa  76.6  0.0000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.42611 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2917  Nucleotidyl transferase  31.63 
 
 		 439 aa  76.6  0.0000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.118183  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2874  Nucleotidyl transferase  28.95 
 
 		 402 aa  75.1  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2853  nucleotidyl transferase  33.57 
 
 		 401 aa  73.2  0.000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.218905 
 
 
-
 
NC_002620  TC0918  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase GlmU-related enzyme  33.33 
 
 		 218 aa  72.8  0.00000000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1633  transferase hexapeptide repeat containing protein  32.64 
 
 		 224 aa  72.8  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1801  Nucleotidyl transferase  28.14 
 
 		 403 aa  70.1  0.00000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0230412  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0280  Nucleotidyl transferase  27.89 
 
 		 400 aa  69.3  0.0000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0901  nucleotidyl transferase  29.75 
 
 		 403 aa  68.2  0.0000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_470  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  31.52 
 
 		 400 aa  67.4  0.0000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0254  nucleotidyl transferase  29.37 
 
 		 399 aa  67  0.0000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0529  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  31.25 
 
 		 400 aa  65.9  0.000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1202  Nucleotidyl transferase  27.92 
 
 		 393 aa  66.2  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2020  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  29.41 
 
 		 397 aa  66.2  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0068  nucleotidyl transferase  25.2 
 
 		 404 aa  66.2  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0170821  normal  0.011821 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2341  nucleotidyl transferase  29.71 
 
 		 396 aa  65.5  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00221584  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2229  nucleotidyl transferase  31.91 
 
 		 399 aa  65.1  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0505  nucleotidyl transferase  31.25 
 
 		 400 aa  64.3  0.000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3271  putative UDP-N-acetylglucosamine diphosphorylase  26.55 
 
 		 224 aa  64.3  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000643318  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5109  Nucleotidyl transferase  28.67 
 
 		 393 aa  62.8  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.000303329  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3048  Nucleotidyl transferase  28.79 
 
 		 393 aa  60.8  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.916197  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2065  Nucleotidyl transferase  28.8 
 
 		 393 aa  59.3  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1583  nucleotidyl transferase  23.77 
 
 		 411 aa  56.6  0.0000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.605878  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0329  nucleotidyl transferase  23.77 
 
 		 411 aa  56.2  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.175272  hitchhiker  0.000673657 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0513  nucleotidyl transferase  27.33 
 
 		 411 aa  54.3  0.000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3644  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  31.06 
 
 		 454 aa  53.9  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0399  nucleotidyl transferase  23.91 
 
 		 414 aa  53.1  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0814  transferase hexapeptide repeat containing protein  30.65 
 
 		 269 aa  53.1  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.190345 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4080  transferase; LpxA family  26.11 
 
 		 212 aa  50.4  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0557  glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase / UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  32.62 
 
 		 460 aa  48.9  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1370  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  34.58 
 
 		 455 aa  48.1  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.329837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0642  nucleotidyl transferase  24.49 
 
 		 411 aa  47.8  0.0004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.163683  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0275  putative acyltransferase  26.42 
 
 		 236 aa  47.4  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51490  LpxA family transferase  27.33 
 
 		 209 aa  47  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0220  glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase / UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  30.77 
 
 		 452 aa  47  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.600609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3606  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  32.05 
 
 		 453 aa  47  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.311729  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2448  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  29.05 
 
 		 453 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.420996  hitchhiker  0.000000146766 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0754  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  27.75 
 
 		 449 aa  46.2  0.001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.17813  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4359  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  28.89 
 
 		 453 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4421  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  28.89 
 
 		 453 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0508871  normal  0.0915045 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3546  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  27.89 
 
 		 469 aa  43.9  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.837233  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1909  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  32.23 
 
 		 453 aa  43.9  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.23479  normal  0.818944 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5279  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  26.95 
 
 		 451 aa  43.5  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.307917 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0728  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  33.01 
 
 		 449 aa  43.5  0.007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2170  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  29.91 
 
 		 452 aa  43.5  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.922541  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0098  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  31.11 
 
 		 469 aa  43.5  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00133426 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2016  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  32.17 
 
 		 454 aa  43.1  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.6824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0091  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  30.14 
 
 		 453 aa  43.1  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1725  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  32.23 
 
 		 453 aa  43.1  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.353505  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>