41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0309 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0309  peptidase M14, carboxypeptidase A  100 
 
 		 874 aa  1786    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.440571  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3379  hypothetical protein  30.08 
 
 		 906 aa  370  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.520045  normal  0.777695 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0971  hypothetical protein  26.75 
 
 		 932 aa  262  3e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.358184  normal  0.0187365 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7038  peptidase M14 carboxypeptidase A  25.63 
 
 		 923 aa  261  4e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.268062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0915  hypothetical protein  27.62 
 
 		 923 aa  259  2e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2650  hypothetical protein  27.11 
 
 		 931 aa  255  2.0000000000000002e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.721631 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3990  peptidase M14 carboxypeptidase A  24.3 
 
 		 942 aa  228  3e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.030987 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3266  hypothetical protein  24.97 
 
 		 983 aa  226  2e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.348309  normal  0.462264 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7040  peptidase M14, carboxypeptidase A  29.61 
 
 		 910 aa  162  3e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.213605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1110  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.02 
 
 		 862 aa  123  1.9999999999999998e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.284775  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0478  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.43 
 
 		 863 aa  118  5e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.145999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1827  peptidase M14, carboxypeptidase A  23.22 
 
 		 911 aa  111  6e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000101368  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2633  peptidase M14, carboxypeptidase A  26.2 
 
 		 887 aa  110  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.181298  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0219  hypothetical protein  28.21 
 
 		 858 aa  107  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03995  Peptidase M14, carboxypeptidase A  24.38 
 
 		 885 aa  105  4e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0158  peptidase M14 carboxypeptidase A  24.28 
 
 		 848 aa  103  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0074  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.82 
 
 		 834 aa  101  7e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.169396  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4011  peptidase M14 carboxypeptidase A  24.44 
 
 		 850 aa  101  7e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0178  peptidase M14, carboxypeptidase A  24.25 
 
 		 848 aa  100  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0105  peptidase M14, carboxypeptidase A  27.83 
 
 		 845 aa  98.6  5e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0079  hypothetical protein  22.31 
 
 		 816 aa  95.5  4e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5924  peptidase M14 carboxypeptidase A  30.92 
 
 		 837 aa  94.7  7e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.163745  normal  0.580965 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2078  hypothetical protein  28.37 
 
 		 840 aa  92.8  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.548714 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2795  peptidase M14 carboxypeptidase A  23.65 
 
 		 829 aa  92.8  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0357907  normal  0.190508 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2535  peptidase M14 carboxypeptidase A  32.3 
 
 		 860 aa  92.8  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.135366 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4232  peptidase M14, carboxypeptidase A  23.6 
 
 		 852 aa  90.5  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3503  peptidase M14, carboxypeptidase A  24.57 
 
 		 831 aa  89.7  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.212063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5203  hypothetical protein  24.15 
 
 		 1057 aa  90.1  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12943  Secreted protein containing N-terminal Zinc-dependentcarboxypeptidase related domain  22.55 
 
 		 836 aa  88.6  4e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1327  zinc-dependent carboxypeptidase domain-containing protein  23.77 
 
 		 871 aa  81.6  0.00000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.282096  normal  0.571741 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01020  Conserved secreted Zn-dependent enzyme from deacylase/carboxypeptidase superfamily protein  29.43 
 
 		 823 aa  78.2  0.0000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.150102  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2389  peptidase M14, carboxypeptidase A  29.45 
 
 		 599 aa  56.2  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.979451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0666  peptidase M14 carboxypeptidase A  23.16 
 
 		 361 aa  53.5  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2152  peptidase M14, carboxypeptidase A  31.2 
 
 		 615 aa  53.5  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1797  peptidase M14, carboxypeptidase A  29.23 
 
 		 618 aa  48.1  0.0007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.158 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1198  peptidase M14 carboxypeptidase A  33.59 
 
 		 606 aa  47.8  0.0008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2610  peptidase M14, carboxypeptidase A  33.59 
 
 		 606 aa  47.8  0.0008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.163339 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4756  peptidase M14, carboxypeptidase A  27.34 
 
 		 506 aa  45.4  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1498  hypothetical protein  34.55 
 
 		 464 aa  45.1  0.006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.965637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6842  peptidase M14 carboxypeptidase A  25.25 
 
 		 577 aa  45.1  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.922108  normal  0.679276 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2112  peptidase M28  18.92 
 
 		 1247 aa  44.3  0.01  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0150866  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>