36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0329 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0329  phosphoribosyltransferase-like protein  100 
 
 		 205 aa  419  1e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1674  phosphoribosyltransferase  34.31 
 
 		 220 aa  69.3  0.00000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.132511  normal  0.892675 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1796  phosphoribosyltransferase  33.58 
 
 		 220 aa  65.1  0.0000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.129569 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0982  phosphoribosyltransferase  32.12 
 
 		 220 aa  64.3  0.000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.417621 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0446  phosphoribosyltransferase  32.12 
 
 		 238 aa  64.3  0.000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0365147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0620  phosphoribosyltransferase  26.32 
 
 		 256 aa  55.8  0.0000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0383  phosphoribosyltransferase  26.62 
 
 		 186 aa  55.1  0.0000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0167235  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1964  phosphoribosyltransferase  27.41 
 
 		 180 aa  54.7  0.0000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0577675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1680  phosphoribosyltransferase  27.74 
 
 		 238 aa  54.3  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.299794  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0154  phosphoribosyltransferase  27.74 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0637  phosphoribosyltransferase  28.68 
 
 		 179 aa  52.8  0.000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.31901  normal  0.258665 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0750  phosphoribosyltransferase  29.79 
 
 		 207 aa  52.8  0.000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.167668  normal  0.0224381 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0836  phosphoribosyltransferase  23.94 
 
 		 218 aa  52.4  0.000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1738  phosphoribosyltransferase  32.26 
 
 		 169 aa  50.8  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0877  phosphoribosyltransferase  24.14 
 
 		 208 aa  50.4  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.267757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2740  phosphoribosyltransferase  24.82 
 
 		 233 aa  50.4  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.306639  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0913  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  24.82 
 
 		 224 aa  50.4  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.108987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10220  predicted phosphoribosyltransferase  31.85 
 
 		 170 aa  49.7  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0228  phosphoribosyltransferase  28.19 
 
 		 179 aa  50.1  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2827  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  24.26 
 
 		 206 aa  49.3  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0798  phosphoribosyltransferase  25.58 
 
 		 181 aa  48.9  0.00005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000521483 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1334  phosphoribosyltransferase  23.53 
 
 		 232 aa  48.9  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2592  phosphoribosyltransferase  26.09 
 
 		 236 aa  48.5  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.987222  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3178  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  27.78 
 
 		 206 aa  48.9  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00229089 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1451  phosphoribosyltransferase  31.2 
 
 		 170 aa  48.5  0.00007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.930666  normal  0.536266 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1686  phosphoribosyltransferase  28 
 
 		 207 aa  46.6  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.820077  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22270  predicted phosphoribosyltransferase  27.33 
 
 		 170 aa  45.8  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1412  phosphoribosyltransferase  33.88 
 
 		 206 aa  45.8  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.734426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0850  phosphoribosyltransferase  25.77 
 
 		 230 aa  44.7  0.0009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0709042  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1163  phosphoribosyltransferase  28.37 
 
 		 190 aa  43.5  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.433004  normal  0.806121 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1986  phosphoribosyltransferase  24.03 
 
 		 186 aa  43.9  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1728  putative hypoxanthine phosphoribosyltransferase  27.46 
 
 		 185 aa  42.7  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1071  phosphoribosyltransferase  29.32 
 
 		 190 aa  42.4  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.162671  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1227  putative nucleotide phosphoribosyltransferase protein  29.32 
 
 		 193 aa  42.4  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000789245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2095  phosphoribosyltransferase  27.27 
 
 		 202 aa  42  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.606064  normal  0.330855 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3834  putative hypoxanthine phosphoribosyltransferase  29.41 
 
 		 185 aa  42  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.6949  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>