189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0157 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_0157  dehydratase  100 
 
 
137 aa  278  1e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5027  putative acyl dehydratase  54.69 
 
 
138 aa  149  8.999999999999999e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000226168  normal  0.281597 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3724  MaoC domain protein dehydratase  54.74 
 
 
141 aa  149  1e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.420067  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4755  MaoC-like dehydratase  56.92 
 
 
138 aa  147  4e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4076  MaoC-like dehydratase  52.59 
 
 
137 aa  146  8e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.354915 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4169  MaoC-like dehydratase  54.1 
 
 
138 aa  145  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.116288  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3812  MaoC-like dehydratase  57.26 
 
 
140 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0106778  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2527  MaoC-like dehydratase  54.69 
 
 
139 aa  144  4.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.367433 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1539  MaoC-like dehydratase  53.68 
 
 
138 aa  144  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.645367  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1562  dehydratase  53.68 
 
 
138 aa  144  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1510  dehydratase  53.68 
 
 
138 aa  144  6e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.301803  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2727  putative MaoC-like dehydratase  50.78 
 
 
138 aa  142  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1608  dehydratase  53.91 
 
 
141 aa  140  5e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5770  MaoC domain protein dehydratase  50.37 
 
 
149 aa  139  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2940  dehydratase  52.76 
 
 
139 aa  134  5e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.156748  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0664  MaoC domain-containing protein  51.94 
 
 
137 aa  133  9e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4069  dehydratase  53.68 
 
 
141 aa  131  3.9999999999999996e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3988  dehydratase  50 
 
 
136 aa  130  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0447  dehydratase  50 
 
 
141 aa  123  9e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.271007  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0161  MaoC domain protein dehydratase  39.02 
 
 
140 aa  85.5  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.49242  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0391  dehydratase  35.04 
 
 
322 aa  82.8  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000128192 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3211  MaoC-like dehydratase  36.72 
 
 
141 aa  80.1  0.000000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.582437  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3273  dehydratase  36.72 
 
 
141 aa  80.1  0.000000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3222  dehydratase  36.72 
 
 
141 aa  80.1  0.000000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.986163  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4180  MaoC domain protein dehydratase  38.46 
 
 
332 aa  79.3  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00128585  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4037  MaoC-like dehydratase  38.66 
 
 
326 aa  80.1  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.257252  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4153  MaoC domain protein dehydratase  38.46 
 
 
332 aa  79.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4038  dehydratase  34.85 
 
 
151 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.850178 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0742  MaoC-like dehydratase  36.67 
 
 
142 aa  76.3  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0921523  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2497  MaoC domain protein dehydratase  33.59 
 
 
134 aa  72.4  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4362  MaoC domain protein dehydratase  35.07 
 
 
141 aa  72.4  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0358  MaoC domain-containing protein dehydratase  33.87 
 
 
142 aa  70.1  0.000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.717661  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2841  MaoC domain protein dehydratase  34.85 
 
 
137 aa  68.9  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1777  MaoC domain protein dehydratase  29.85 
 
 
133 aa  68.9  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03560  acyl dehydratase  39.02 
 
 
133 aa  68.2  0.00000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.210712  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2338  MaoC domain protein dehydratase  33.33 
 
 
335 aa  66.6  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6646  MaoC domain protein dehydratase  38.3 
 
 
139 aa  66.6  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0671  dehydratase  36.54 
 
 
127 aa  65.9  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0318034  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5103  MaoC domain protein dehydratase  41.84 
 
 
142 aa  65.9  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.300678  normal  0.830614 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6065  dehydratase  41.51 
 
 
142 aa  65.9  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.801232 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2738  MaoC domain protein dehydratase  36.62 
 
 
145 aa  65.5  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00396042 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21390  acyl dehydratase  37.82 
 
 
157 aa  64.3  0.0000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.0000515647  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1059  dehydratase  33.87 
 
 
141 aa  64.3  0.0000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.621453  normal  0.0175933 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0289  dehydratase  34.68 
 
 
155 aa  63.5  0.0000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1010  MaoC domain protein dehydratase  37.12 
 
 
143 aa  62.4  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3940  dehydratase  41.57 
 
 
130 aa  62.8  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4529  MaoC domain protein dehydratase  37.6 
 
 
142 aa  61.6  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3026  dehydratase  34.51 
 
 
150 aa  61.2  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0899  MaoC domain protein dehydratase  36.54 
 
 
142 aa  60.8  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.344654  normal  0.108371 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4332  dehydratase  41.57 
 
 
130 aa  61.2  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3182  MaoC domain protein dehydratase  34.96 
 
 
143 aa  60.8  0.000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0456076 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0665  MaoC domain protein dehydratase  37.63 
 
 
138 aa  60.8  0.000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0187656  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10649  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadB  28.8 
 
 
142 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0228319 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1221  MaoC domain protein dehydratase  35.16 
 
 
148 aa  60.1  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0229542 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0565  MaoC-like dehydratase  39.36 
 
 
142 aa  59.7  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3411  MaoC domain protein dehydratase  35.63 
 
 
337 aa  60.1  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17510  acyl dehydratase  42.25 
 
 
163 aa  58.9  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.736026  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0464  MaoC domain protein dehydratase  32.79 
 
 
339 aa  58.2  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.919633  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0498  dehydratase  33.63 
 
 
137 aa  58.2  0.00000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.14206  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2665  hypothetical protein  34.41 
 
 
141 aa  57  0.00000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.26639  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07690  acyl dehydratase  46.67 
 
 
144 aa  54.7  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.961228  normal  0.0437858 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0231  Enoyl-CoA hydratase  33.98 
 
 
156 aa  54.7  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.460096  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5844  dehydratase  30.89 
 
 
343 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.513315 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1474  Enoyl-CoA hydratase  28.8 
 
 
150 aa  54.3  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.118864  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4827  MaoC domain protein dehydratase  38.03 
 
 
279 aa  53.9  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5324  MaoC-like dehydratase  54.55 
 
 
343 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5413  dehydratase  54.55 
 
 
343 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5703  dehydratase  54.55 
 
 
343 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_463  acyl dehydratase  31.96 
 
 
137 aa  52.4  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000121955  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1106  MaoC domain protein dehydratase  27.73 
 
 
352 aa  52.4  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.212723  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1998  MaoC-like dehydratase  30.77 
 
 
184 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0739  MaoC domain protein dehydratase  27.73 
 
 
141 aa  52.4  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21180  acyl dehydratase  39.71 
 
 
154 aa  52.4  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0994  dehydratase  52.27 
 
 
343 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0522  hypothetical protein  31.96 
 
 
137 aa  51.6  0.000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000722837  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0563  MaoC domain protein dehydratase  33.06 
 
 
144 aa  51.2  0.000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.127994  normal  0.0650042 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2677  dehydratase  35 
 
 
135 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0345161 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6364  MaoC domain-containing protein dehydratase  40.3 
 
 
131 aa  50.1  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.91527  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4135  dehydratase  31.36 
 
 
155 aa  50.1  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.5486  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0206  dehydratase  28.26 
 
 
133 aa  49.7  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10131  hypothetical protein  30.19 
 
 
151 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0846  dehydratase  27.01 
 
 
150 aa  50.1  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1231  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadB  31.4 
 
 
142 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.563539 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5120  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadB  31.4 
 
 
142 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2692  MaoC domain protein dehydratase  31.37 
 
 
142 aa  48.5  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0287  dehydratase  28.06 
 
 
159 aa  48.5  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03381  conserved hypothetical protein  32.74 
 
 
1872 aa  48.1  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.888019  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2340  dehydratase  36.99 
 
 
297 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.321088  decreased coverage  0.00219714 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0947  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadB  30.83 
 
 
142 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1676  MaoC-like dehydratase  28.71 
 
 
151 aa  47.4  0.00006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.633015  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1127  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  33.03 
 
 
472 aa  47.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.345508 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3812  putative dehydratase  28.35 
 
 
156 aa  47.8  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0600  MaoC domain protein dehydratase  39.13 
 
 
142 aa  47.4  0.00007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.552837  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2194  MaoC domain protein dehydratase  28.16 
 
 
159 aa  47.4  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.302832 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0919  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadB  35.63 
 
 
142 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0891029  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0936  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadB  35.63 
 
 
142 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0947  MaoC-like dehydratase  29.63 
 
 
157 aa  47  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1800  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  37.18 
 
 
282 aa  47  0.00008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.351849 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0296  Enoyl-CoA hydratase  31.53 
 
 
153 aa  46.2  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.697257  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0438  dehydratase  30.69 
 
 
164 aa  45.8  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.15838 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>