35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_0667 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008701  Pisl_0667  proliferating-cell nuclear antigen-like protein  100 
 
 		 256 aa  506  9.999999999999999e-143  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.355101  normal  0.237552 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1995  proliferating cell nuclear antigen  79.3 
 
 		 256 aa  430  1e-119  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2131  proliferating cell nuclear antigen  73.33 
 
 		 257 aa  399  9.999999999999999e-111  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2362  proliferating cell nuclear antigen  74.22 
 
 		 256 aa  396  1e-109  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0042  proliferating cell nuclear antigen  36.95 
 
 		 293 aa  181  1e-44  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.512471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0624  proliferating cell nuclear antigen PcnA  27.34 
 
 		 247 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0438  proliferating cell nuclear antigen PcnA  30.65 
 
 		 249 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1682  proliferating cell nuclear antigen PcnA  28.63 
 
 		 249 aa  107  2e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.950147  normal  0.718796 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1377  proliferating cell nuclear antigen PcnA  25 
 
 		 255 aa  101  9e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.163855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1788  proliferating cell nuclear antigen PcnA  27.82 
 
 		 249 aa  100  2e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0525119 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0990  monomeric DNA polymerase sliding clamp  30.12 
 
 		 265 aa  96.3  4e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1755  proliferating cell nuclear antigen PcnA  25 
 
 		 248 aa  83.2  0.000000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2018  proliferating cell nuclear antigen PcnA  24.7 
 
 		 246 aa  75.5  0.0000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.169268  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1383  proliferating cell nuclear antigen PcnA  26.67 
 
 		 259 aa  73.2  0.000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0929046  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0699  proliferating cell nuclear antigen PcnA  25.56 
 
 		 247 aa  66.6  0.0000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.695059  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1792  proliferating cell nuclear antigen  23.65 
 
 		 244 aa  65.1  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2250  DNA polymerase sliding clamp subunit A  25.59 
 
 		 245 aa  63.5  0.000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.151772 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1013  proliferating cell nuclear antigen PcnA  24.78 
 
 		 249 aa  63.5  0.000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0986  proliferating cell nuclear antigen PcnA  25.42 
 
 		 250 aa  63.9  0.000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1015  Proliferating cell nuclear antigen, PCNA  25.53 
 
 		 261 aa  63.2  0.000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.510505 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0051  DNA polymerase sliding clamp subunit B  25.68 
 
 		 247 aa  62.4  0.000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.574423  normal  0.466331 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1695  monomeric DNA polymerase sliding clamp  23.25 
 
 		 250 aa  60.8  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0960  proliferating cell nuclear antigen PcnA  23.35 
 
 		 250 aa  61.2  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.520524  n/a   
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4211  Proliferating cell nuclear antigen, PCNA  24.37 
 
 		 247 aa  54.7  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.379548  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1375  proliferating cell nuclear antigen-like protein protein  24.12 
 
 		 249 aa  53.5  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.148042  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2193  DNA polymerase sliding clamp  22.76 
 
 		 245 aa  53.1  0.000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2653  DNA polymerase sliding clamp  23.95 
 
 		 247 aa  51.6  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1648  DNA polymerase sliding clamp  23.89 
 
 		 247 aa  51.6  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41357  predicted protein  21.93 
 
 		 261 aa  50.1  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0563637  normal  0.130673 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1027  DNA polymerase sliding clamp  21.95 
 
 		 244 aa  49.3  0.00005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.209457  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1253  DNA polymerase sliding clamp  21.7 
 
 		 247 aa  48.1  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0162  Proliferating cell nuclear antigen, PCNA  22.54 
 
 		 247 aa  47.4  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2041  Proliferating cell nuclear antigen, PCNA  23.83 
 
 		 247 aa  47  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.710485  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0521  proliferating cell nuclear antigen PcnA  23.65 
 
 		 242 aa  44.3  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0879  DNA polymerase sliding clamp  21.65 
 
 		 245 aa  43.5  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>