More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2265 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_2265  histidine triad (HIT) protein  100 
 
 
116 aa  236  8e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.208356  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1487  histidine triad family protein  73.68 
 
 
116 aa  189  1e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.194182  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01519  hypothetical protein  71.93 
 
 
116 aa  188  2e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004003  HIT family hydrolase  74.56 
 
 
116 aa  188  2.9999999999999997e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1522  histidine triad (HIT) protein  73.04 
 
 
117 aa  182  1.0000000000000001e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1295  HIT family protein  70.18 
 
 
116 aa  181  2.0000000000000003e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2325  histidine triad (HIT) protein  68.97 
 
 
117 aa  178  2e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1883  histidine triad (HIT) protein  67.24 
 
 
118 aa  177  4.999999999999999e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.601656  normal  0.179498 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1134  HIT-like protein  68.7 
 
 
116 aa  177  5.999999999999999e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.26746  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1448  HIT family protein  66.96 
 
 
117 aa  177  5.999999999999999e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1798  histidine triad (HIT) protein  68.7 
 
 
118 aa  176  8e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1834  histidine triad (HIT) protein  68.7 
 
 
118 aa  176  8e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.250405  normal  0.909294 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2488  histidine triad (HIT) protein  68.7 
 
 
118 aa  176  8e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0461779  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1790  histidine triad (HIT) protein  68.7 
 
 
118 aa  176  8e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.305934  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2276  HIT family protein  67.24 
 
 
116 aa  175  2e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.264441  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2723  HIT family protein  67.83 
 
 
118 aa  174  4e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2314  histidine triad (HIT) protein  67.83 
 
 
118 aa  174  4e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.409498  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2384  histidine triad (HIT) protein  67.83 
 
 
118 aa  174  4e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2507  histidine triad (HIT) protein  67.83 
 
 
118 aa  174  4e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000542969 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1654  histidine triad (HIT) protein  67.83 
 
 
118 aa  174  5e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0399957  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1824  histidine triad (HIT) protein  66.96 
 
 
118 aa  173  6e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000876715  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1920  histidine triad (HIT) protein  65.22 
 
 
116 aa  171  1.9999999999999998e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000438261 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2755  histidine triad (HIT) protein  66.96 
 
 
118 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.431838  normal  0.0942813 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1731  histidine triad (HIT) protein  68.7 
 
 
116 aa  171  3.9999999999999995e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.193386  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1633  purine nucleoside phosphoramidase  65.22 
 
 
116 aa  167  3e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00090924  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2492  purine nucleoside phosphoramidase  66.96 
 
 
116 aa  167  5e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.244551  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1696  purine nucleoside phosphoramidase  67.54 
 
 
117 aa  166  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2814  purine nucleoside phosphoramidase  67.54 
 
 
117 aa  166  1e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.522982 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1588  purine nucleoside phosphoramidase  67.54 
 
 
117 aa  166  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.029862  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2798  purine nucleoside phosphoramidase  65.22 
 
 
116 aa  164  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.773322  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1618  purine nucleoside phosphoramidase  68.7 
 
 
119 aa  161  3e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0104528  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1602  purine nucleoside phosphoramidase  61.74 
 
 
116 aa  160  6e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1980  purine nucleoside phosphoramidase  69.57 
 
 
119 aa  158  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.40336  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0428  Hit family protein  58.77 
 
 
121 aa  157  4e-38  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01099  purine nucleoside phosphoramidase  68.7 
 
 
119 aa  157  5e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.557405  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2544  histidine triad (HIT) protein  68.7 
 
 
119 aa  157  5e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00193524  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1225  purine nucleoside phosphoramidase  68.7 
 
 
119 aa  157  5e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000303033  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2220  purine nucleoside phosphoramidase  68.7 
 
 
119 aa  157  5e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0273576  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2498  purine nucleoside phosphoramidase  68.7 
 
 
119 aa  157  5e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.809063  hitchhiker  0.000000239034 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01107  hypothetical protein  68.7 
 
 
119 aa  157  5e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.60599  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2023  purine nucleoside phosphoramidase  68.7 
 
 
119 aa  157  5e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.11289  hitchhiker  0.00000582659 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1483  purine nucleoside phosphoramidase  68.7 
 
 
119 aa  157  5e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.517462  hitchhiker  0.0000582139 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1226  purine nucleoside phosphoramidase  68.7 
 
 
119 aa  157  5e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0205658  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1304  purine nucleoside phosphoramidase  68.7 
 
 
125 aa  156  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0779682  hitchhiker  0.00000000733928 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2164  purine nucleoside phosphoramidase  68.7 
 
 
125 aa  156  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000113916 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1281  purine nucleoside phosphoramidase  68.7 
 
 
125 aa  156  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.293416  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1319  purine nucleoside phosphoramidase  68.7 
 
 
125 aa  156  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.862019  hitchhiker  0.00000332537 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03447  Diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase  64.81 
 
 
123 aa  152  2e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1047  histidine triad (HIT) protein  64.81 
 
 
121 aa  152  2e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.439434  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3623  histidine triad (HIT) protein  61.47 
 
 
121 aa  149  1e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1569  histidine triad (HIT) protein  62.26 
 
 
114 aa  146  7e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4293  histidine triad (HIT) protein  56.88 
 
 
114 aa  140  5e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000283015  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2210  histidine triad (HIT) protein  58.56 
 
 
115 aa  139  9e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.544525  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0911  histidine triad (HIT) protein  57.14 
 
 
113 aa  135  1e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1076  histidine triad (HIT) protein  54.29 
 
 
114 aa  135  2e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1507  histidine triad (HIT) protein  54.63 
 
 
114 aa  135  2e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00785087  normal  0.647378 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1334  histidine triad (HIT) protein  56.6 
 
 
114 aa  134  4e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1852  histidine triad (HIT) protein  53.27 
 
 
114 aa  134  5e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.279518 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0190  histidine triad (HIT) protein  55.96 
 
 
114 aa  134  5e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.246686  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12750  histidine triad (HIT) protein  56.07 
 
 
114 aa  133  8e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.28931  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0201  histidine triad (HIT) protein  54.13 
 
 
114 aa  132  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.556865  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0191  histidine triad (HIT) protein  52.78 
 
 
115 aa  131  3e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2991  histidine triad (HIT) protein  51.4 
 
 
113 aa  130  5e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.337185  normal  0.959668 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1214  histidine triad-like protein  51.79 
 
 
117 aa  129  1.0000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.574759  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1120  histidine triad (HIT) protein  51.79 
 
 
117 aa  129  1.0000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.66019  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0180  histidine triad (HIT) protein  51.89 
 
 
114 aa  127  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0740  histidine triad (HIT) protein  50.45 
 
 
126 aa  127  5.0000000000000004e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.66623  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2813  hypothetical protein  55.24 
 
 
113 aa  125  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2682  hypothetical protein  55.24 
 
 
113 aa  125  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0229  histidine triad (HIT) protein  51.43 
 
 
114 aa  125  2.0000000000000002e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.280449  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0860  histidine triad (HIT) protein  49.12 
 
 
119 aa  125  2.0000000000000002e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1332  histidine triad (HIT) protein  52.78 
 
 
114 aa  124  5e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0589  histidine triad (HIT) protein  53.64 
 
 
114 aa  123  7e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.107105  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5451  histidine triad (HIT) protein  46.02 
 
 
115 aa  123  7e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0197  histidine triad (HIT) protein  46.79 
 
 
114 aa  123  1e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.54784  normal  0.0954658 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1499  histidine triad (HIT) protein  50 
 
 
116 aa  122  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00000936763  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3159  histidine triad (HIT) protein  45.22 
 
 
117 aa  121  3e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000807551 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4764  histidine triad (HIT) protein  49.07 
 
 
115 aa  120  5e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.11637 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1390  protein kinase C inhibitor  50.45 
 
 
114 aa  120  6e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000527818  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1190  histidine triad (HIT) protein  50.47 
 
 
114 aa  120  6e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.225426  normal  0.102712 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2491  histidine triad (HIT) protein  52.78 
 
 
113 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443276  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0390  histidine triad (HIT) protein  51.85 
 
 
113 aa  119  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3113  histidine triad (HIT) protein  50.94 
 
 
113 aa  118  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0817  histidine triad (HIT) protein  48.57 
 
 
122 aa  118  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00411687  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3007  histidine triad (HIT) protein  50.94 
 
 
113 aa  118  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1572  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolase  49.54 
 
 
116 aa  119  1.9999999999999998e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000353691  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1941  histidine triad (HIT) protein  46.3 
 
 
114 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00748387  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3533  histidine triad (HIT) protein  51.43 
 
 
116 aa  119  1.9999999999999998e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5107  histidine triad (HIT) protein  49.53 
 
 
126 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.484505  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46060  histidine triad (HIT) family protein  49.52 
 
 
112 aa  117  3.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4775  histidine triad (HIT) protein  50.47 
 
 
112 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.675455 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0600  HIT family protein  52.38 
 
 
112 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2095  histidine triad (HIT) protein  48.65 
 
 
114 aa  117  4.9999999999999996e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.200511  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3216  histidine triad (HIT) protein  46.3 
 
 
114 aa  117  6e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000109851  hitchhiker  0.0000000041955 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1062  HIT family hydrolase  46.36 
 
 
115 aa  117  7e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102876  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02440  HIT domain, putative  48.65 
 
 
116 aa  117  7e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1152  histidine triad domain-containing protein  52.38 
 
 
113 aa  116  9e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0864  adenosine 5'-monophosphoramidase  52.38 
 
 
113 aa  116  9e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4573  histidine triad (HIT) protein  51.43 
 
 
112 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2052  histidine triad (HIT) protein  46.3 
 
 
114 aa  116  9.999999999999999e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>