45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0050 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_0050  hypothetical protein  100 
 
 		 245 aa  482  1e-135  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.113555 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0160  hypothetical protein  34.93 
 
 		 250 aa  108  6e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1485  hypothetical protein  27.92 
 
 		 255 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4756  hypothetical protein  30.64 
 
 		 251 aa  82.4  0.000000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0211  hypothetical protein  30.24 
 
 		 258 aa  80.5  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.963682  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3833  protein of unknown function DUF81  28.88 
 
 		 267 aa  77.4  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0115  protein of unknown function DUF81  27.48 
 
 		 262 aa  73.2  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.117057  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1317  protein of unknown function DUF81  29.74 
 
 		 263 aa  71.6  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0136  hypothetical protein  27.86 
 
 		 262 aa  71.2  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4254  hypothetical protein  28.19 
 
 		 245 aa  70.1  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.600925 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3677  hypothetical protein  27.05 
 
 		 255 aa  63.2  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2668  hypothetical protein  25.76 
 
 		 260 aa  62.8  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.161838 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3270  protein of unknown function DUF81  27.84 
 
 		 254 aa  62.4  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.726998 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1229  protein of unknown function DUF81  29.35 
 
 		 263 aa  61.6  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.559154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4163  hypothetical protein  26.45 
 
 		 246 aa  60.5  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3569  protein of unknown function DUF81  27.39 
 
 		 254 aa  59.7  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0451006 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3342  hypothetical protein  25.29 
 
 		 255 aa  59.7  0.00000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.321446  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2748  hypothetical protein  25 
 
 		 272 aa  57  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0695  hypothetical protein  28.91 
 
 		 252 aa  55.1  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2398  hypothetical protein  27.31 
 
 		 252 aa  53.9  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.253445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3181  hypothetical protein  27.06 
 
 		 257 aa  53.9  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.721835  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1086  hypothetical protein  26.98 
 
 		 250 aa  50.4  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0866441 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0354  protein of unknown function DUF81  27.38 
 
 		 239 aa  50.1  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3658  hypothetical protein  24.58 
 
 		 241 aa  49.3  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1716  hypothetical protein  25 
 
 		 241 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1495  membrane protein  25.42 
 
 		 241 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1504  membrane protein  25.42 
 
 		 241 aa  49.3  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000123127  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1530  hypothetical protein  25.1 
 
 		 241 aa  48.5  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1649  hypothetical protein  25.1 
 
 		 241 aa  48.5  0.00009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0831  protein of unknown function DUF81  26.05 
 
 		 253 aa  48.1  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.708999  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1687  hypothetical protein  27.71 
 
 		 241 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1940  hypothetical protein  30.52 
 
 		 284 aa  47  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000335524  normal  0.789392 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1794  hypothetical protein  24.58 
 
 		 241 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0203  hypothetical protein  26.37 
 
 		 216 aa  46.2  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7709  hypothetical protein  26.89 
 
 		 260 aa  45.8  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.858783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0205  protein of unknown function DUF81  26.32 
 
 		 254 aa  45.4  0.0009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.670843 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3856  hypothetical protein  29.28 
 
 		 241 aa  45.4  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.497532  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2202  hypothetical protein  27.61 
 
 		 251 aa  45.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0392424  normal  0.159254 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1737  hypothetical protein  23.33 
 
 		 241 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.593381  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2327  hypothetical protein  23.72 
 
 		 247 aa  44.3  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.042109  normal  0.153019 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2380  hypothetical protein  29.34 
 
 		 240 aa  44.7  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.333988 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1099  putative integral membrane protein  29.28 
 
 		 255 aa  43.9  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0506  hypothetical protein  23.75 
 
 		 244 aa  43.5  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0953317  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0300  hypothetical protein  28.78 
 
 		 248 aa  42.4  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000467082 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1535  hypothetical protein  28.66 
 
 		 241 aa  42  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.671723  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>