More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1139 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1139  DNA repair protein RecN  100 
 
 		 555 aa  1125    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3012  DNA repair protein  44.63 
 
 		 551 aa  463  1e-129  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.398213 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1303  DNA repair protein RecN  42.44 
 
 		 557 aa  453  1.0000000000000001e-126  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.523963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6893  DNA repair protein RecN  44.26 
 
 		 549 aa  444  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.23585  normal  0.532581 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5209  DNA repair protein RecN  44.26 
 
 		 551 aa  443  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3465  DNA repair protein RecN  42.26 
 
 		 550 aa  436  1e-121  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.393637  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1845  Sigma 54 interacting domain protein  41.17 
 
 		 552 aa  420  1e-116  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.34764  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1849  DNA repair protein RecN  40.56 
 
 		 551 aa  406  1.0000000000000001e-112  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09463  DNA repair protein RecN  43.35 
 
 		 550 aa  405  1e-111  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.070219  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3626  DNA repair protein RecN  37.43 
 
 		 558 aa  332  9e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63010  DNA repair protein RecN  38.29 
 
 		 558 aa  330  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5483  DNA repair protein RecN  38.1 
 
 		 558 aa  329  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.582199  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0594  DNA repair protein RecN  37.05 
 
 		 569 aa  324  2e-87  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0859323 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0814  DNA repair protein RecN  34.64 
 
 		 570 aa  325  2e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1763  DNA repair protein RecN  35.38 
 
 		 560 aa  322  9.999999999999999e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137867  normal  0.0495571 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42990  DNA repair protein RecN  37 
 
 		 557 aa  319  9e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0370  DNA repair protein RecN  36.2 
 
 		 578 aa  319  1e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.431573  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1026  recombination and repair protein  35.51 
 
 		 554 aa  317  4e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1896  DNA repair protein RecN  35.36 
 
 		 567 aa  316  7e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000247727  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4507  DNA repair protein RecN  36.53 
 
 		 557 aa  316  8e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0761  DNA repair protein RecN  38.29 
 
 		 557 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.345087  normal  0.395212 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4197  DNA repair protein RecN  36.8 
 
 		 557 aa  314  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.312426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4595  DNA repair protein RecN  37.3 
 
 		 557 aa  314  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.202375 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0703  DNA repair protein RecN  37.84 
 
 		 557 aa  314  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.926549  hitchhiker  0.000359109 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0378  recombination and repair protein  36.41 
 
 		 554 aa  314  2.9999999999999996e-84  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.116911  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1196  recombination and repair protein  35.87 
 
 		 553 aa  313  6.999999999999999e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4730  DNA repair protein RecN  36.94 
 
 		 557 aa  312  9e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.46357  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4729  DNA repair protein RecN  37.12 
 
 		 557 aa  312  1e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00366375 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1281  recombination and repair protein  35.69 
 
 		 553 aa  311  2e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000117137 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2771  recombination and repair protein  35.33 
 
 		 552 aa  310  5e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.170925  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3364  DNA repair protein RecN  33.7 
 
 		 559 aa  309  6.999999999999999e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.276138  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2064  DNA repair protein RecN  33.64 
 
 		 558 aa  309  1.0000000000000001e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.488529  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1104  recombination and repair protein  35.33 
 
 		 552 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.239344  normal  0.154382 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3462  recombination and repair protein  35.33 
 
 		 552 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3296  recombination and repair protein  35.33 
 
 		 552 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.182341  decreased coverage  0.000158665 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3153  recombination and repair protein  35.33 
 
 		 552 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000145597  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3151  recombination and repair protein  35.33 
 
 		 552 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0961248  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1170  recombination and repair protein  35.33 
 
 		 552 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0260908 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1218  recombination and repair protein  35.33 
 
 		 552 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.187963  normal  0.0934404 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1104  recombination and repair protein  35.14 
 
 		 552 aa  306  7e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.562592 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2475  recombination and repair protein  35.32 
 
 		 565 aa  306  7e-82  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1169  recombination and repair protein  35.68 
 
 		 553 aa  306  8.000000000000001e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1749  DNA repair protein RecN  35.06 
 
 		 574 aa  304  2.0000000000000002e-81  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3298  recombination and repair protein  35.2 
 
 		 553 aa  304  3.0000000000000004e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.121559  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0596  DNA repair protein RecN  35.4 
 
 		 572 aa  301  2e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3011  recombination and repair protein  35.2 
 
 		 553 aa  297  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2829  recombination and repair protein  35.2 
 
 		 553 aa  296  4e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00407233  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2879  recombination and repair protein  35.2 
 
 		 553 aa  296  5e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.158329 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2899  recombination and repair protein  35.2 
 
 		 553 aa  296  5e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2897  recombination and repair protein  35.2 
 
 		 553 aa  296  5e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0651  DNA repair protein  33.03 
 
 		 559 aa  296  7e-79  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0701  DNA repair protein RecN  35.58 
 
 		 567 aa  296  9e-79  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3856  recombination and repair protein  35.56 
 
 		 553 aa  293  4e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00344363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004296  DNA repair protein RecN  34.42 
 
 		 554 aa  292  9e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.782069  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2900  recombination and repair protein  35.38 
 
 		 553 aa  292  9e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.004413  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1059  DNA repair protein RecN  35.38 
 
 		 553 aa  292  1e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0987529  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1068  recombination and repair protein  35.38 
 
 		 553 aa  292  1e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0569436  normal  0.137036 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2774  recombination and repair protein  35.38 
 
 		 553 aa  292  1e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000103072  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4026  DNA repair protein RecN  31.92 
 
 		 579 aa  292  1e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0028037  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2768  recombination and repair protein  35.38 
 
 		 553 aa  292  1e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00054696  normal  0.107417 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01130  recombination and repair protein  34.24 
 
 		 554 aa  292  1e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1544  DNA repair protein RecN  33.51 
 
 		 566 aa  291  2e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2735  alkylhydroperoxidase AhpD core  33.94 
 
 		 557 aa  291  2e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0271976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4304  DNA repair protein RecN  32.28 
 
 		 579 aa  290  3e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000470862  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4284  DNA repair protein RecN  32.1 
 
 		 579 aa  290  3e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0425411  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1480  DNA repair protein RecN  34.26 
 
 		 556 aa  291  3e-77  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.269893  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1179  DNA repair and genetic recombination protein  33.03 
 
 		 556 aa  291  3e-77  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02504  recombination and repair protein  35.2 
 
 		 553 aa  290  4e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0788874  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3359  recombination and repair protein  35.14 
 
 		 553 aa  290  4e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0341558 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1151  recombination and repair protein  35.62 
 
 		 554 aa  290  4e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.901201  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02468  hypothetical protein  35.2 
 
 		 553 aa  290  4e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.116899  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2579  DNA repair protein RecN  33.39 
 
 		 562 aa  290  5.0000000000000004e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.183283 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3096  DNA repair protein RecN  33.33 
 
 		 557 aa  290  5.0000000000000004e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4194  DNA repair protein RecN  32.45 
 
 		 579 aa  290  6e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.9666000000000002e-33 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0623  DNA repair protein RecN  34.99 
 
 		 568 aa  289  7e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.72171  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3927  DNA repair protein  32.28 
 
 		 583 aa  289  8e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0317713  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0576  DNA repair protein RecN  34.56 
 
 		 568 aa  289  8e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1043  recombination and repair protein  32.97 
 
 		 552 aa  289  9e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3005  recombination and repair protein  35.2 
 
 		 553 aa  288  1e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000658292  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4246  DNA repair protein RecN  32.1 
 
 		 583 aa  289  1e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00786878  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4078  DNA repair protein RecN  32.28 
 
 		 579 aa  288  1e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4397  DNA repair protein RecN  32.28 
 
 		 579 aa  288  1e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000441756  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0950  DNA repair protein RecN  31.92 
 
 		 579 aa  288  1e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0157368  hitchhiker  0.0000335441 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3916  DNA repair protein  32.28 
 
 		 579 aa  288  2e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000027559  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3218  recombination and repair protein  33.75 
 
 		 553 aa  287  2.9999999999999996e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1714  DNA repair protein RecN  32.73 
 
 		 557 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1376  recombination and repair protein  33.82 
 
 		 553 aa  287  4e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000000100313  normal  0.0248594 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3966  DNA repair protein RecN  34.23 
 
 		 556 aa  287  4e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.284551 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2976  recombination and repair protein  33.82 
 
 		 553 aa  287  4e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0819489  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2889  recombination and repair protein  33.63 
 
 		 553 aa  285  1.0000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000988342  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0942  DNA repair protein RecN  31.41 
 
 		 554 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1446  DNA repair protein RecN  32.55 
 
 		 556 aa  284  2.0000000000000002e-75  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000211173  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0968  DNA repair protein RecN  34.54 
 
 		 567 aa  285  2.0000000000000002e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.858596  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0866  DNA repair protein RecN  32.55 
 
 		 555 aa  285  2.0000000000000002e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0914  DNA repair protein RecN  34.83 
 
 		 558 aa  283  8.000000000000001e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.473015  normal  0.408005 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1385  DNA repair protein  32.37 
 
 		 608 aa  282  1e-74  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0276871  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2867  DNA repair protein RecN  32.1 
 
 		 579 aa  281  2e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0728  recombination and repair protein  33.03 
 
 		 553 aa  279  1e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.118324  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0537  DNA repair protein RecN  33.69 
 
 		 568 aa  278  1e-73  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.674533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0930  ATPase for DNA repair  33.21 
 
 		 555 aa  278  1e-73  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>