112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_5275 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_5275  hypothetical protein  100 
 
 		 277 aa  537  9.999999999999999e-153  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4973  hypothetical protein  81.88 
 
 		 277 aa  441  1e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.364055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4846  hypothetical protein  82.25 
 
 		 277 aa  443  1e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0252834  normal  0.350213 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5022  hypothetical protein  81.52 
 
 		 277 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.752327 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0492  hypothetical protein  82.97 
 
 		 277 aa  428  1e-119  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07010  hypothetical protein  72.2 
 
 		 276 aa  384  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0642  hypothetical protein  73.29 
 
 		 276 aa  385  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3717  hypothetical protein  37.32 
 
 		 283 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.657811  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0865  hypothetical protein  36.57 
 
 		 295 aa  146  4.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0566496  normal  0.513013 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2580  hypothetical protein  35.04 
 
 		 281 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.527852  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0706  hypothetical protein  34.55 
 
 		 281 aa  140  3e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.294779  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4689  hypothetical protein  38.27 
 
 		 285 aa  138  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.673663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0142  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.99 
 
 		 286 aa  137  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0944  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.19 
 
 		 281 aa  137  1e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.632965 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4620  hypothetical protein  34.18 
 
 		 278 aa  137  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.331328 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2841  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.85 
 
 		 306 aa  136  4e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0532  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.98 
 
 		 273 aa  135  5e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0613856  normal  0.397799 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3366  hypothetical protein  35.02 
 
 		 278 aa  135  9e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0836  hypothetical protein  34.46 
 
 		 278 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.217739 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4186  integral membrane protein  32.61 
 
 		 277 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0697  hypothetical protein  33.82 
 
 		 281 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4078  integral membrane protein  32.73 
 
 		 286 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4128  integral membrane protein  32.73 
 
 		 286 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4023  integral membrane protein  32.73 
 
 		 286 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4007  integral membrane protein  32.73 
 
 		 286 aa  133  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1949  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.06 
 
 		 277 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0296573  normal  0.100068 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1239  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.55 
 
 		 278 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.570084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4521  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.33 
 
 		 278 aa  130  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2272  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.06 
 
 		 277 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5358  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.71 
 
 		 279 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.961807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3089  hypothetical protein  35.63 
 
 		 280 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522035  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1326  putative permease protein  34.91 
 
 		 278 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.182128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0286  hypothetical protein  34.78 
 
 		 293 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1099  hypothetical protein  33.82 
 
 		 281 aa  127  2.0000000000000002e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.112723 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1930  putative integral membrane protein DUF6  33.21 
 
 		 279 aa  127  3e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.211906  hitchhiker  0.0000000927699 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4271  hypothetical protein  32 
 
 		 285 aa  124  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.564552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5892  hypothetical protein  35.38 
 
 		 280 aa  124  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4020  hypothetical protein  32.13 
 
 		 285 aa  122  5e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.799358  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4347  hypothetical protein  32.13 
 
 		 285 aa  122  5e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1474  hypothetical protein  36.19 
 
 		 277 aa  122  9e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0011  hypothetical protein  34.67 
 
 		 280 aa  122  9e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0501  hypothetical protein  36.19 
 
 		 277 aa  122  9e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.777031  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0404  hypothetical protein  36.19 
 
 		 327 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.92172  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2290  hypothetical protein  31.25 
 
 		 275 aa  120  1.9999999999999998e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.825928 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6007  hypothetical protein  33.82 
 
 		 287 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4193  putative 10 TMS drug/metabolite exporter, DME family, DMT superfamily  34.98 
 
 		 280 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0556115 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4709  hypothetical protein  34.66 
 
 		 278 aa  120  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.328299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2134  hypothetical protein  36.06 
 
 		 354 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0818  hypothetical protein  36.06 
 
 		 354 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0498  hypothetical protein  32 
 
 		 303 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.146008  normal  0.505926 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2218  hypothetical protein  32.97 
 
 		 278 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0823132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2117  hypothetical protein  36.96 
 
 		 292 aa  116  5e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.107207  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2940  hypothetical protein  34.36 
 
 		 280 aa  116  5e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0704111  hitchhiker  0.00163659 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0566  DMT family permease  32.97 
 
 		 278 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.7079  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3474  DMT family permease  33.96 
 
 		 280 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3007  hypothetical protein  34.53 
 
 		 278 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.558663  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5359  hypothetical protein  34.53 
 
 		 278 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3416  hypothetical protein  31.99 
 
 		 276 aa  114  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1673  hypothetical protein  32.36 
 
 		 303 aa  112  5e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0779725  normal  0.510796 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4911  hypothetical protein  33.81 
 
 		 278 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3756  hypothetical protein  32.97 
 
 		 285 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.83129  normal  0.119763 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3337  hypothetical protein  34.65 
 
 		 281 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2138  hypothetical protein  30.55 
 
 		 280 aa  109  4.0000000000000004e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.186321  normal  0.806194 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0071  integral membrane protein  35 
 
 		 278 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.13911  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1570  hypothetical protein  35 
 
 		 278 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.232738  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1482  hypothetical protein  35 
 
 		 278 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.133803  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5239  hypothetical protein  35.02 
 
 		 278 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3577  hypothetical protein  32.13 
 
 		 284 aa  106  5e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1927  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.46 
 
 		 277 aa  99  8e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.642083  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1831  hypothetical protein  39.66 
 
 		 356 aa  99  9e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29520  membrane protein  32.45 
 
 		 282 aa  93.2  4e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4230  hypothetical protein  32.92 
 
 		 251 aa  92.8  5e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.220159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1215  hypothetical protein  27.08 
 
 		 300 aa  89  9e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.935221 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0810  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.86 
 
 		 293 aa  88.6  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.617842  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0881  hypothetical protein  32.62 
 
 		 303 aa  87  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.443506  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4117  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.74 
 
 		 293 aa  85.9  7e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2854  hypothetical protein  29.2 
 
 		 282 aa  84.7  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5448  hypothetical protein  30.14 
 
 		 327 aa  84.3  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0997  hypothetical protein  28.2 
 
 		 286 aa  83.6  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1129  hypothetical protein  31.25 
 
 		 288 aa  81.6  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.475409 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3082  hypothetical protein  32.94 
 
 		 277 aa  80.9  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3034  hypothetical protein  29.58 
 
 		 299 aa  79.7  0.00000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0853  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.53 
 
 		 290 aa  79.7  0.00000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1842  drug/metabolite exporter (DME) family protein  26.71 
 
 		 301 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.129137  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0491  hypothetical protein  26.71 
 
 		 301 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.177704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3482  hypothetical protein  27.99 
 
 		 290 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.183799 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0806  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.18 
 
 		 290 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000304842  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1761  hypothetical protein  27.99 
 
 		 290 aa  77.4  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0150156  normal  0.485655 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3629  hypothetical protein  29.01 
 
 		 293 aa  77  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.539858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1866  hypothetical protein  29.03 
 
 		 290 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2742  hypothetical protein  28.8 
 
 		 308 aa  74.3  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3941  hypothetical protein  27.44 
 
 		 280 aa  73.6  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.177323  normal  0.483872 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0631  hypothetical protein  27.16 
 
 		 301 aa  71.6  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.945692 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04883  hypothetical protein  27.42 
 
 		 301 aa  72  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2949  hypothetical protein  28.62 
 
 		 290 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.191447 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1649  DMT family permease  27.14 
 
 		 290 aa  69.7  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.799428  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2724  hypothetical protein  26.86 
 
 		 300 aa  69.7  0.00000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.35059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1941  hypothetical protein  25.44 
 
 		 302 aa  68.6  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.192478  normal  0.151746 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2052  hypothetical protein  26.96 
 
 		 290 aa  68.6  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00300116  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1077  hypothetical protein  31.22 
 
 		 297 aa  68.2  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.407086 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>