32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1200 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_1200  hypothetical protein  100 
 
 		 335 aa  681    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142665 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0964  hypothetical protein  79.46 
 
 		 336 aa  568  1e-161  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.198535  normal  0.689775 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1357  hypothetical protein  78.87 
 
 		 375 aa  564  1e-160  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.138079  normal  0.215405 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4367  hypothetical protein  79.17 
 
 		 336 aa  565  1e-160  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.222302 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4492  hypothetical protein  80.56 
 
 		 336 aa  552  1e-156  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0946277  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4381  hypothetical protein  74.03 
 
 		 335 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4076  hypothetical protein  73.73 
 
 		 335 aa  534  1e-151  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0944  hypothetical protein  69.72 
 
 		 337 aa  477  1e-134  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.659342  normal  0.734525 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57060  hypothetical protein  61.19 
 
 		 335 aa  442  1e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4961  hypothetical protein  60.9 
 
 		 333 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.694286  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2264  hypothetical protein  45.88 
 
 		 346 aa  317  2e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0693815  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2570  hypothetical protein  45.88 
 
 		 346 aa  315  8e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57070  hypothetical protein  46.27 
 
 		 333 aa  311  1e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4962  hypothetical protein  46.15 
 
 		 333 aa  308  8e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.391829  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1764  hypothetical protein  42.03 
 
 		 351 aa  295  9e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0943  hypothetical protein  44.69 
 
 		 330 aa  286  4e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.367805 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1846  protein of unknown function DUF481  40.88 
 
 		 351 aa  285  7e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0113  hypothetical protein  26.82 
 
 		 331 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0117  hypothetical protein  26.99 
 
 		 331 aa  102  9e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0118  hypothetical protein  26.99 
 
 		 331 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0114  hypothetical protein  25.89 
 
 		 329 aa  99  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0687801 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0109  hypothetical protein  25.55 
 
 		 329 aa  97.8  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0113  hypothetical protein  25.47 
 
 		 318 aa  97.1  4e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0527  hypothetical protein  24.18 
 
 		 346 aa  90.9  3e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0881  alanine racemase region  23.92 
 
 		 356 aa  80.1  0.00000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.140785  hitchhiker  0.000185996 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1182  hypothetical protein  25.53 
 
 		 382 aa  74.3  0.000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.155999 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2347  hypothetical protein  28.02 
 
 		 333 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000241931  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3691  hypothetical protein  21.9 
 
 		 363 aa  53.5  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0114  hypothetical protein  40.82 
 
 		 177 aa  49.7  0.00007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.806445 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0708  hypothetical protein  23.92 
 
 		 239 aa  48.1  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0842  hypothetical protein  23.11 
 
 		 347 aa  46.2  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.583593 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0403  hypothetical protein  23.43 
 
 		 376 aa  44.3  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>