More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0088 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0088  oligopeptidase A  100 
 
 		 680 aa  1390    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0114  oligopeptidase A  40.12 
 
 		 695 aa  457  1e-127  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.357976  normal  0.13234 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0096  oligopeptidase A  39.64 
 
 		 683 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.32998  hitchhiker  0.00599775 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0111  oligopeptidase A  39.67 
 
 		 695 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4461  oligopeptidase A  38.62 
 
 		 682 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0111  oligopeptidase A  39.67 
 
 		 695 aa  451  1e-125  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000602107 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00790  oligopeptidase A  39.76 
 
 		 681 aa  449  1e-125  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.983257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0045  oligopeptidase A  39.76 
 
 		 683 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0144  oligopeptidase A  39.46 
 
 		 683 aa  444  1e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0090  oligopeptidase A  39.19 
 
 		 692 aa  445  1e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0067  oligopeptidase A  39.64 
 
 		 681 aa  439  1e-121  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01090  oligopeptidase A  38.5 
 
 		 681 aa  437  1e-121  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0320  oligopeptidase A  32.52 
 
 		 676 aa  358  1.9999999999999998e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2570  oligopeptidase A  32.78 
 
 		 680 aa  357  3.9999999999999996e-97  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4217  Oligopeptidase A  33.93 
 
 		 679 aa  350  3e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4065  oligopeptidase A  33.13 
 
 		 679 aa  347  3e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0087  oligopeptidase A  33.48 
 
 		 679 aa  347  4e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0006  Oligopeptidase A  32.48 
 
 		 686 aa  347  5e-94  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4256  oligopeptidase A  33.63 
 
 		 679 aa  347  5e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2533  oligopeptidase A  33.83 
 
 		 679 aa  347  5e-94  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.437216  normal  0.440356 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4392  oligopeptidase A  33.63 
 
 		 679 aa  346  8e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4699  oligopeptidase A  33.33 
 
 		 679 aa  345  1e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0124  oligopeptidase A  33.63 
 
 		 679 aa  344  2.9999999999999997e-93  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001952  oligopeptidase A  31.89 
 
 		 680 aa  343  9e-93  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1253  oligopeptidase A  33.18 
 
 		 682 aa  342  1e-92  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0054  oligopeptidase A  31.88 
 
 		 681 aa  342  1e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0345207  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3546  oligopeptidase A  33.03 
 
 		 678 aa  342  1e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3842  oligopeptidase A  33.43 
 
 		 679 aa  341  2.9999999999999998e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3935  oligopeptidase A  33.43 
 
 		 679 aa  340  4e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4051  oligopeptidase A  33.58 
 
 		 679 aa  340  4e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03492  oligopeptidase A  32.67 
 
 		 678 aa  340  7e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0212  oligopeptidase A  32.42 
 
 		 683 aa  339  8e-92  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3595  oligopeptidase A  32.94 
 
 		 679 aa  339  9e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0124  oligopeptidase A  32.88 
 
 		 679 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3657  oligopeptidase A  32.28 
 
 		 679 aa  337  3.9999999999999995e-91  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.601769 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0007  oligopeptidase A  32.44 
 
 		 680 aa  336  1e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.73797  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3874  oligopeptidase A  31.68 
 
 		 679 aa  335  2e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0208  oligopeptidase A  31.64 
 
 		 679 aa  334  3e-90  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0113  peptidase M3A and M3B, thimet/oligopeptidase F  33.58 
 
 		 664 aa  334  3e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0399  oligopeptidase A  32.48 
 
 		 694 aa  333  5e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.905041  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0031  oligopeptidase A  32.29 
 
 		 685 aa  333  6e-90  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00526  Zn-dependent oligopeptidase  31.44 
 
 		 695 aa  332  2e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4207  oligopeptidase A  31.38 
 
 		 680 aa  330  8e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3907  oligopeptidase A  31.74 
 
 		 680 aa  329  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3864  oligopeptidase A  31.74 
 
 		 680 aa  329  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3787  oligopeptidase A  31.74 
 
 		 680 aa  329  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0010  oligopeptidase A  32.19 
 
 		 680 aa  329  1.0000000000000001e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3968  oligopeptidase A  31.74 
 
 		 680 aa  329  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3797  oligopeptidase A  31.59 
 
 		 680 aa  328  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0067  oligopeptidase A  32.14 
 
 		 683 aa  328  2.0000000000000001e-88  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03347  oligopeptidase A  31.89 
 
 		 680 aa  327  6e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.642114  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0217  Oligopeptidase A  31.89 
 
 		 680 aa  327  6e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03300  hypothetical protein  31.89 
 
 		 680 aa  327  6e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.762273  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3787  oligopeptidase A  31.89 
 
 		 680 aa  327  6e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.894892 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3698  oligopeptidase A  31.89 
 
 		 680 aa  327  6e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0218  oligopeptidase A  31.89 
 
 		 680 aa  327  6e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0145  oligopeptidase A  31.34 
 
 		 679 aa  326  7e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.491748  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3824  oligopeptidase A  31.89 
 
 		 680 aa  326  8.000000000000001e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0122  oligopeptidase A  31.93 
 
 		 680 aa  326  9e-88  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3980  oligopeptidase A  31.89 
 
 		 680 aa  326  9e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4845  oligopeptidase A  31.74 
 
 		 680 aa  325  2e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.88545 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4701  oligopeptidase A  31.52 
 
 		 680 aa  322  9.999999999999999e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0141  oligopeptidase A  31.41 
 
 		 685 aa  320  7e-86  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0156  oligopeptidase A  31.11 
 
 		 683 aa  316  9.999999999999999e-85  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3911  oligopeptidase A  30.88 
 
 		 680 aa  315  9.999999999999999e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4047  oligopeptidase A  31.08 
 
 		 682 aa  315  1.9999999999999998e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.980043  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0116  oligopeptidase A  31.08 
 
 		 680 aa  315  1.9999999999999998e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4086  oligopeptidase A  31.07 
 
 		 680 aa  315  2.9999999999999996e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.902618 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0006  Oligopeptidase A  30.54 
 
 		 682 aa  310  4e-83  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.322163  normal  0.727066 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0791  oligopeptidase A  30.03 
 
 		 679 aa  308  1.0000000000000001e-82  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0116  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  32.98 
 
 		 664 aa  307  3e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.186109 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4986  oligopeptidase A  30.31 
 
 		 683 aa  305  2.0000000000000002e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4196  oligopeptidase A  30.47 
 
 		 680 aa  301  2e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4479  oligopeptidase A  30.77 
 
 		 680 aa  301  3e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2397  oligopeptidase A  32.29 
 
 		 685 aa  300  8e-80  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0054  oligopeptidase A  30.75 
 
 		 695 aa  297  4e-79  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0159  oligopeptidase A  27.79 
 
 		 677 aa  289  1e-76  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2166  oligopeptidase A  27.79 
 
 		 677 aa  289  1e-76  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0084  oligopeptidase A  30.84 
 
 		 731 aa  282  2e-74  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.611624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2240  oligopeptidase A  31.16 
 
 		 712 aa  278  2e-73  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2618  oligopeptidase A  29.54 
 
 		 699 aa  278  2e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0078  oligopeptidase A  30.41 
 
 		 741 aa  278  3e-73  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1726  oligopeptidase A  29.54 
 
 		 699 aa  277  4e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.328644  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3084  oligopeptidase A  29.54 
 
 		 699 aa  277  4e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2235  oligopeptidase A  29.54 
 
 		 699 aa  277  4e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1507  oligopeptidase A  29.54 
 
 		 699 aa  277  4e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2750  oligopeptidase A  29.54 
 
 		 699 aa  277  5e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0150  oligopeptidase A  28.4 
 
 		 679 aa  277  6e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0372443 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1860  oligopeptidase A  28.76 
 
 		 700 aa  276  1.0000000000000001e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.709239  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2674  oligopeptidase A  29.39 
 
 		 699 aa  276  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.295345  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1534  oligopeptidase A  29.79 
 
 		 716 aa  276  1.0000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.122877 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2483  oligopeptidase A  29.94 
 
 		 703 aa  275  2.0000000000000002e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1481  Oligopeptidase A  29.96 
 
 		 714 aa  274  4.0000000000000004e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2051  oligopeptidase A  29.35 
 
 		 695 aa  273  8.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.347537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1129  oligopeptidase A  29.48 
 
 		 695 aa  273  8.000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.60188  normal  0.628312 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2178  oligopeptidase A  29.65 
 
 		 695 aa  272  2e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.61297  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3646  oligopeptidase A  29.61 
 
 		 684 aa  271  2.9999999999999997e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1476  oligopeptidase A  29.14 
 
 		 704 aa  270  5e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0816638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0885  Oligopeptidase A  28.88 
 
 		 694 aa  270  8.999999999999999e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2141  oligopeptidase A  29.39 
 
 		 695 aa  269  1e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.388715  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>