274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3946 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008687  Pden_3946  phospholipase/carboxylesterase  100 
 
 
219 aa  445  1.0000000000000001e-124  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2728  phospholipase/carboxylesterase  72.02 
 
 
220 aa  305  3e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.56176  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1386  phospholipase/carboxylesterase  72.02 
 
 
220 aa  304  6e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.167947  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2077  phospholipase/carboxylesterase  70.18 
 
 
220 aa  292  3e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.16777  normal  0.214877 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1688  putative phospholipase / carboxylesterase  64.68 
 
 
223 aa  283  1.0000000000000001e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00377416  normal  0.0415953 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1158  phospholipase/carboxylesterase  59.55 
 
 
221 aa  259  2e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0188854 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1965  phospholipase/carboxylesterase  63.68 
 
 
221 aa  248  4e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0342368  normal  0.433587 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1632  phospholipase/carboxylesterase  45.59 
 
 
224 aa  162  3e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2039  phospholipase/carboxylesterase  44.83 
 
 
223 aa  162  5.0000000000000005e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2724  phospholipase/carboxylesterase  44.91 
 
 
237 aa  160  2e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.124054  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1845  phospholipase/Carboxylesterase  45.24 
 
 
224 aa  159  3e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4879  phospholipase/carboxylesterase  44.95 
 
 
227 aa  157  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0704393 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2351  phospholipase/carboxylesterase  40 
 
 
221 aa  154  8e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.368946  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3842  phospholipase/carboxylesterase  43.19 
 
 
236 aa  152  2.9999999999999998e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1900  phospholipase/Carboxylesterase  41.51 
 
 
235 aa  151  8.999999999999999e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.603276 
 
 
-
 
NC_002978  WD1006  phospholipase/carboxylesterase family protein  36.28 
 
 
214 aa  140  1.9999999999999998e-32  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1189  phospholipase/Carboxylesterase  44.88 
 
 
221 aa  139  3e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0360922 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0432  phospholipase/carboxylesterase  39.78 
 
 
233 aa  132  6e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.332711 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3241  phospholipase/carboxylesterase  39.51 
 
 
222 aa  128  8.000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.774909  normal  0.296389 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1326  phospholipase/carboxylesterase  39.55 
 
 
222 aa  128  9.000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0446  phospholipase/carboxylesterase  40.61 
 
 
243 aa  120  1.9999999999999998e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0890683  normal  0.0467521 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1494  phospholipase/carboxylesterase  39.27 
 
 
256 aa  116  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.259302  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7027  phospholipase/Carboxylesterase  37.62 
 
 
198 aa  116  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5201  phospholipase/carboxylesterase  39.06 
 
 
277 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.879928  normal  0.366851 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5255  phospholipase/Carboxylesterase  36.36 
 
 
213 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5529  phospholipase/Carboxylesterase  32.7 
 
 
219 aa  103  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.748493 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0181  phospholipase/carboxylesterase  31.71 
 
 
213 aa  102  4e-21  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1130  putative hydrolase ypfH  34 
 
 
219 aa  102  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0935  phospholipase/carboxylesterase family protein  31.71 
 
 
213 aa  99  5e-20  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04140  carboxylesterase  31.42 
 
 
222 aa  91.7  7e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.628824  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4424  phospholipase/Carboxylesterase  33.67 
 
 
204 aa  91.3  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4488  phospholipase/Carboxylesterase  33.67 
 
 
204 aa  91.3  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.332778 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3639  Carboxylesterase  34.47 
 
 
223 aa  88.6  6e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4485  phospholipase/Carboxylesterase  33.01 
 
 
212 aa  87.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1999  phospholipase/carboxylesterase family protein  31.78 
 
 
221 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3533  Carboxylesterase  32.47 
 
 
219 aa  84.3  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.755115  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2498  phospholipase/carboxylesterase  31.94 
 
 
220 aa  82.4  0.000000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2626  carboxylesterase  31.98 
 
 
223 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000180149  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2918  phospholipase/carboxylesterase  29.17 
 
 
218 aa  81.6  0.000000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2701  carboxylesterase  32.3 
 
 
223 aa  81.3  0.000000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0223431  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1759  Carboxylesterase  31.98 
 
 
223 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000153879  hitchhiker  0.00754405 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2265  carboxylesterase  30.84 
 
 
221 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2337  carboxylesterase  30.84 
 
 
221 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.387077  normal  0.0702195 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14080  carboxylesterase  33.33 
 
 
215 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.022206 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2455  phospholipase/carboxylesterase  30.84 
 
 
221 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1907  carboxylesterase  31.96 
 
 
226 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000226911  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3813  phospholipase/carboxylesterase  31.79 
 
 
230 aa  79.3  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0993955  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2136  carboxylesterase  31.02 
 
 
224 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000191828  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1950  carboxylesterase  32.78 
 
 
223 aa  79.3  0.00000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000802695  normal  0.0250693 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2101  phospholipase/carboxylesterase  31.53 
 
 
223 aa  78.6  0.00000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0242  esterase  33.17 
 
 
190 aa  77.8  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0054  carboxylesterase  33.15 
 
 
248 aa  77.8  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.691003  normal  0.104617 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2310  carboxylesterase  30.87 
 
 
222 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0300805  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2022  carboxylesterase  33.33 
 
 
226 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000559029  normal  0.99764 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1888  phospholipase/Carboxylesterase  30.27 
 
 
206 aa  76.6  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1246  carboxylesterase  33.33 
 
 
215 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1113  phospholipase/carboxylesterase  35.96 
 
 
224 aa  76.6  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.668569  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3402  carboxylesterase  31.28 
 
 
220 aa  77  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0345  carboxylesterase  31.05 
 
 
223 aa  77  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.268278  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4278  putative carboxylesterase  30.97 
 
 
229 aa  76.6  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2312  carboxylesterase  29.28 
 
 
223 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0295169  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1261  carboxylesterase  32.56 
 
 
224 aa  75.9  0.0000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00152  putative phospholipase/carboxylesterase family protein  30.23 
 
 
223 aa  75.5  0.0000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0263167  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1307  phospholipase/carboxylesterase  31.89 
 
 
220 aa  75.5  0.0000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.839904  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3420  phospholipase/Carboxylesterase  32.47 
 
 
205 aa  74.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0129  phospholipase/carboxylesterase  29.51 
 
 
208 aa  74.3  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2561  phospholipase/Carboxylesterase  29.21 
 
 
229 aa  74.7  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.299124  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2138  carboxylesterase  30.05 
 
 
234 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000145278  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1228  carboxylesterase  30.41 
 
 
224 aa  74.3  0.000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_52268  lysophospholipase  29.95 
 
 
209 aa  73.9  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5017  phospholipase/Carboxylesterase  26.79 
 
 
205 aa  73.9  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122217  normal  0.0411034 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2061  phospholipase/Carboxylesterase  28.04 
 
 
223 aa  73.6  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1685  phospholipase/Carboxylesterase  29.65 
 
 
212 aa  72.8  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0645369  normal  0.777462 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4553  carboxylesterase  33.86 
 
 
218 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2670  carboxylesterase  31.02 
 
 
223 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000549714  hitchhiker  0.00990238 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0789  phospholipase/carboxylesterase  29.65 
 
 
206 aa  73.2  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0528689 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0941  phospholipase/carboxylesterase  29.85 
 
 
552 aa  72.4  0.000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.443784 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0569  phospholipase/Carboxylesterase  33.97 
 
 
218 aa  72  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4429  carboxylesterase  34.43 
 
 
218 aa  72  0.000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.708757 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2412  phospholipase/carboxylesterase  26.97 
 
 
227 aa  72  0.000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0536257  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3782  carboxylesterase  29.58 
 
 
222 aa  71.6  0.000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0317  serine esterase  30.04 
 
 
222 aa  71.6  0.000000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00441133 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2604  esterase YpfH  27.36 
 
 
232 aa  70.9  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2845  esterase YpfH  27.55 
 
 
232 aa  70.9  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2620  esterase YpfH  27.36 
 
 
232 aa  70.9  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3695  esterase YpfH  27.36 
 
 
232 aa  70.9  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1203  esterase YpfH  27.36 
 
 
232 aa  70.9  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.176443  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0551  carboxylesterase protein  27.98 
 
 
226 aa  71.2  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.315382  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0903  carboxylesterase  33.73 
 
 
218 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.892603  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2753  esterase YpfH  27.36 
 
 
232 aa  70.9  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3306  phospholipase/carboxylesterase family protein  30.48 
 
 
240 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.703144  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0108  phospholipase/carboxylesterase family protein  27.88 
 
 
222 aa  70.9  0.00000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000237023  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1846  carboxylesterase  26.76 
 
 
225 aa  70.5  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1272  Carboxylesterase  31.72 
 
 
220 aa  70.5  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02365  predicted hydrolase  26.87 
 
 
232 aa  70.1  0.00000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1196  phospholipase/Carboxylesterase  26.87 
 
 
232 aa  70.1  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3140  phospholipase/carboxylesterase  29.95 
 
 
240 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0649605  normal  0.347756 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02327  hypothetical protein  26.87 
 
 
232 aa  70.1  0.00000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2130  carboxylesterase  31.84 
 
 
222 aa  70.1  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.939077  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2969  esterase YpfH  25.76 
 
 
231 aa  69.3  0.00000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.520422 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>