More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2626 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2626  flagellar biosynthesis protein FlhB  100 
 
 		 368 aa  736    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.447547 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2955  flagellar biosynthesis protein FlhB  44.48 
 
 		 363 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.111273 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4188  flagellar biosynthesis protein FlhB  41.46 
 
 		 362 aa  265  1e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3256  flagellar biosynthesis protein FlhB  41.76 
 
 		 362 aa  231  2e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2611  flagellar biosynthesis protein FlhB  41.87 
 
 		 359 aa  225  8e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0659978 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1322  flagellar biosynthesis protein FlhB  42.02 
 
 		 359 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2981  flagellar biosynthesis protein FlhB  41.76 
 
 		 359 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.760938 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1930  flagellar biosynthetic protein FlhB  34.86 
 
 		 363 aa  197  4.0000000000000005e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.922236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1384  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.52 
 
 		 360 aa  192  1e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.696508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2603  flagellar biosynthetic protein FlhB  36.34 
 
 		 354 aa  187  2e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.371847  normal  0.56 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2826  flagellar biosynthetic protein FlhB  36.34 
 
 		 354 aa  187  3e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.986887  normal  0.270742 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1547  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.75 
 
 		 383 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2575  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.33 
 
 		 359 aa  183  4.0000000000000006e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.011127 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3698  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.99 
 
 		 380 aa  182  6e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0239481 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1245  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.16 
 
 		 390 aa  181  1e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2633  flagellar biosynthetic protein FlhB  36.41 
 
 		 355 aa  181  1e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.295644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5492  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.07 
 
 		 359 aa  180  4e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.14397  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2604  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.64 
 
 		 383 aa  177  4e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5615  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.43 
 
 		 380 aa  176  5e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.891713  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1316  flagellar biosynthetic protein FlhB  35.62 
 
 		 366 aa  176  8e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0981  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.96 
 
 		 390 aa  174  2.9999999999999996e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0800953 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4066  flagellar biosynthetic protein FlhB  34.13 
 
 		 387 aa  173  5e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4178  flagellar biosynthetic protein FlhB  34.13 
 
 		 387 aa  173  5e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.232408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2432  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.4 
 
 		 386 aa  173  5e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2069  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.13 
 
 		 383 aa  172  5.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00553621 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1331  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.13 
 
 		 383 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384239  hitchhiker  0.0000000000516194 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2334  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.13 
 
 		 386 aa  171  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.178036  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0249  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.56 
 
 		 399 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.190542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2074  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.13 
 
 		 383 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000897295 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3370  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.92 
 
 		 398 aa  171  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00184569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2129  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.13 
 
 		 383 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000192021 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1208  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.13 
 
 		 383 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1862  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.4 
 
 		 383 aa  171  1e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.90359  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1394  flagellar biosynthetic FlhB transmembrane protein  33.42 
 
 		 387 aa  171  2e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00896638  normal  0.765457 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0669  flagellar biosynthesis protein FlhB  30 
 
 		 350 aa  170  3e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0757109  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2840  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.56 
 
 		 399 aa  170  3e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.151701  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0267  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.56 
 
 		 399 aa  170  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.110201  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16690  flagellar biosynthetic protein FlhB  30.17 
 
 		 356 aa  171  3e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3804  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.72 
 
 		 403 aa  170  4e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0130  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.51 
 
 		 406 aa  169  5e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.561684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0175  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.87 
 
 		 399 aa  168  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.212371 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1409  flagellar biosynthetic protein FlhB  37.46 
 
 		 361 aa  168  2e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4406  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.6 
 
 		 357 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.202983  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0018  flagellar biosynthetic protein FlhB  34.78 
 
 		 374 aa  166  4e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000395256  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0379  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.51 
 
 		 357 aa  166  9e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0959  type III secretion exporter  33.94 
 
 		 377 aa  165  9e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0484  flagellar biosynthetic protein FlhB  32.97 
 
 		 392 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0127914  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0018  flagellar biosynthetic protein FlhB  34.49 
 
 		 374 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000937461  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2230  flagellar biosynthetic protein FlhB  35.2 
 
 		 355 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0181  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.6 
 
 		 399 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.824859  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2328  type III secretion exporter  33.33 
 
 		 363 aa  164  3e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.645604  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0194  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.33 
 
 		 399 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1412  flagellar biosynthetic protein FlhB  30.42 
 
 		 363 aa  163  4.0000000000000004e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.342211  normal  0.890154 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0240  flagellar biosynthetic protein FlhB  29.28 
 
 		 353 aa  162  7e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.760621  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1137  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.88 
 
 		 359 aa  162  1e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0658  flagellar biosynthetic protein FlhB  32.22 
 
 		 353 aa  161  2e-38  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.622115  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1519  flagellar biosynthesis protein FlhB  30.69 
 
 		 383 aa  160  3e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1522  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.88 
 
 		 358 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.23127  normal  0.258787 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31030  flagellar biosynthesis pathway, component FlhB  38.87 
 
 		 422 aa  159  6e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2977  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.44 
 
 		 398 aa  159  7e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0868  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein  30.2 
 
 		 369 aa  159  7e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1330  flagellar biosynthesis protein FlhB  29.17 
 
 		 358 aa  159  8e-38  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1163  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.69 
 
 		 351 aa  159  8e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4135  flagellar biosynthetic protein FlhB  31.49 
 
 		 350 aa  159  1e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0846766  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3844  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.72 
 
 		 401 aa  159  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2447  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.71 
 
 		 382 aa  157  2e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3128  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.72 
 
 		 401 aa  158  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3772  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.51 
 
 		 358 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0655991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1695  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.72 
 
 		 401 aa  158  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3925  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.72 
 
 		 401 aa  158  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.807758  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3423  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.72 
 
 		 401 aa  158  2e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3170  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.63 
 
 		 405 aa  157  3e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3443  type III secretion exporter  33.33 
 
 		 358 aa  157  3e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.942918 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2964  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.98 
 
 		 411 aa  157  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00775742 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0999  flagellar biosynthesis protein FlhB  29.41 
 
 		 357 aa  157  3e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0341  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.7 
 
 		 359 aa  157  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00619914 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3011  YscD family type III secretion protein  31.22 
 
 		 346 aa  157  4e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.859866  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4412  type III secretion exporter  32.89 
 
 		 390 aa  156  4e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2847  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.16 
 
 		 405 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1309  flagellar biosynthesis protein FlhB  30.89 
 
 		 392 aa  156  5.0000000000000005e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.791915  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2821  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.87 
 
 		 356 aa  156  6e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.117691  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1397  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.79 
 
 		 359 aa  155  1e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.247493  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3217  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.06 
 
 		 354 aa  155  1e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.447718 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2617  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.86 
 
 		 382 aa  155  1e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000137265 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3484  flagellar biosynthetic protein FlhB  30.27 
 
 		 376 aa  154  2e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.994028  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0063  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.89 
 
 		 405 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00962  flagellar biosynthesis protein FlhB  30.85 
 
 		 376 aa  154  2e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.118534  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06204  flagellar biosynthesis protein FlhB  30.85 
 
 		 376 aa  154  2e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.236866  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0213  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.88 
 
 		 379 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.687218  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1760  flagellar biosynthetic protein FlhB  34.28 
 
 		 382 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.304563  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0054  flagellar biosynthesis protein FlhB  29.13 
 
 		 390 aa  154  2.9999999999999998e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0380  flagellar biosynthesis protein FlhB  28.99 
 
 		 362 aa  154  2.9999999999999998e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.441846  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2112  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.28 
 
 		 382 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0648  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.72 
 
 		 353 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.214387 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1379  flagellar biosynthesis protein FlhB  28.3 
 
 		 377 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.294814 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01851  flagellar biosynthesis protein B  34.57 
 
 		 382 aa  153  4e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01840  hypothetical protein  34.57 
 
 		 382 aa  153  4e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1752  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.57 
 
 		 382 aa  153  4e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1975  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.57 
 
 		 382 aa  153  4e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1153  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.02 
 
 		 356 aa  153  4e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>