More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_3029 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_3029  hypothetical protein  100 
 
 		 194 aa  369  1e-101  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.415744  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0705  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  52.11 
 
 		 198 aa  206  2e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.561247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1334  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  54.17 
 
 		 202 aa  204  5e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0552137  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0797  hypothetical protein  53.89 
 
 		 202 aa  203  2e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.340002  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1373  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  53.37 
 
 		 200 aa  201  7e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.55479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0610  multiple antibiotic resistance (MarC)-like proteins  52.11 
 
 		 198 aa  200  9.999999999999999e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4869  membrane protein, MarC family  51.58 
 
 		 198 aa  199  3e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0936  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  53.12 
 
 		 202 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000278236 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3310  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  53.12 
 
 		 202 aa  195  4.0000000000000005e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4700  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  52.11 
 
 		 198 aa  195  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.548338  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4825  MarC membrane protein  52.11 
 
 		 198 aa  194  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.495877 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4409  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  50.53 
 
 		 198 aa  194  7e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1066  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  53.61 
 
 		 201 aa  194  9e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0142047  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4615  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  51.58 
 
 		 198 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.446372 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4878  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  52.11 
 
 		 198 aa  193  2e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5577  hypothetical protein  50.78 
 
 		 197 aa  191  8e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64240  MarC family protein  50.78 
 
 		 197 aa  191  8e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0206769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1840  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  49.74 
 
 		 200 aa  186  2e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000421483  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2947  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  49.48 
 
 		 197 aa  181  5.0000000000000004e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0399  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  46.63 
 
 		 200 aa  176  2e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.103709 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1463  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  46.11 
 
 		 200 aa  171  7.999999999999999e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.894258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3095  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  45.88 
 
 		 200 aa  164  5.9999999999999996e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.103088  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3814  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  37.56 
 
 		 210 aa  131  6.999999999999999e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0290  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  42.13 
 
 		 206 aa  130  1.0000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.713083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0417  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.5 
 
 		 202 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1278  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.8 
 
 		 212 aa  103  1e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0401  MarC family multiple antibiotic resistance protein  34.33 
 
 		 206 aa  100  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1406  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.15 
 
 		 213 aa  100  1e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0953  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  31.61 
 
 		 207 aa  100  1e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.838216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0686  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.65 
 
 		 213 aa  99.8  2e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3526  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  32.18 
 
 		 206 aa  99.8  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303666  normal  0.286765 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3557  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.33 
 
 		 206 aa  99.8  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.247513  hitchhiker  0.0000492857 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3226  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.08 
 
 		 207 aa  99.8  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1270  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.66 
 
 		 213 aa  99.4  3e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1818  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  32.5 
 
 		 205 aa  98.6  5e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.397202 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2679  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  32.18 
 
 		 206 aa  98.6  5e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356849  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0428  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  32.18 
 
 		 206 aa  98.6  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0407  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.18 
 
 		 206 aa  98.2  7e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.190902 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2045  hypothetical protein  33.17 
 
 		 207 aa  98.2  7e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00255531  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1961  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.56 
 
 		 213 aa  97.1  1e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0346  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  32.18 
 
 		 206 aa  97.4  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.383588  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2949  hypothetical protein  29.08 
 
 		 207 aa  96.7  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.514078  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2711  MarC membrane protein  32.67 
 
 		 206 aa  96.3  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0635  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  30.35 
 
 		 201 aa  96.7  2e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.586575 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3690  hypothetical protein  32.67 
 
 		 206 aa  96.3  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.984937  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0331  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.18 
 
 		 206 aa  96.3  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3721  MarC membrane protein  32.67 
 
 		 206 aa  96.3  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.596949  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3242  MarC membrane protein  32.67 
 
 		 206 aa  96.3  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2990  hypothetical protein  32.67 
 
 		 206 aa  96.3  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.792349  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0355  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.68 
 
 		 206 aa  96.7  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.458882 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0603  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  30.35 
 
 		 201 aa  96.7  2e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.708242  normal  0.450021 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1791  MarC membrane protein  32.67 
 
 		 206 aa  96.3  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2762  MarC membrane protein  32.67 
 
 		 206 aa  96.3  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3663  MarC membrane protein  32.67 
 
 		 206 aa  96.3  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1694  hypothetical protein  30.58 
 
 		 210 aa  96.3  3e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0657108 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2756  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.32 
 
 		 206 aa  95.1  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1410  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  29.44 
 
 		 231 aa  94.4  8e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1391  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  30.05 
 
 		 198 aa  94.7  8e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2154  hypothetical protein  31.19 
 
 		 210 aa  94.4  9e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0620075  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2242  hypothetical protein  29.8 
 
 		 212 aa  94.4  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.177472  normal  0.0116098 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0570  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.12 
 
 		 217 aa  94  1e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1812  hypothetical protein  31.55 
 
 		 210 aa  93.6  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2370  hypothetical protein  31.55 
 
 		 210 aa  93.6  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0117247  normal  0.036415 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1956  hypothetical protein  31.55 
 
 		 210 aa  93.6  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.466227 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1923  hypothetical protein  31.55 
 
 		 210 aa  93.6  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1949  hypothetical protein  31.55 
 
 		 210 aa  93.6  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0303133  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1929  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  34.65 
 
 		 215 aa  92.4  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.604403  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2137  hypothetical protein  31.55 
 
 		 210 aa  92.4  3e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0258  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  27.45 
 
 		 212 aa  91.7  5e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0133581 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2896  multidrug ABC transporter  30.73 
 
 		 206 aa  92  5e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1540  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  30.73 
 
 		 206 aa  92  5e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.29956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0253  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  27.45 
 
 		 212 aa  91.7  5e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.592133  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0372  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  27.36 
 
 		 215 aa  91.7  6e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0644  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  36.08 
 
 		 210 aa  91.3  7e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0517184  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0186  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  30.41 
 
 		 210 aa  90.9  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.969233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1910  hypothetical protein  31.19 
 
 		 207 aa  90.9  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000443138  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1684  hypothetical protein  31.07 
 
 		 210 aa  90.9  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.197685  normal  0.181239 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1789  hypothetical protein  31.07 
 
 		 210 aa  90.9  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.153384  normal  0.0804929 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1911  hypothetical protein  29.21 
 
 		 213 aa  89.7  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0139262  unclonable  0.00000197593 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2879  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.57 
 
 		 207 aa  89.4  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0513768 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3245  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  30.15 
 
 		 207 aa  89.4  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1125  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.26 
 
 		 207 aa  89.4  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0974003 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1759  hypothetical protein  30.58 
 
 		 210 aa  89.4  3e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0131249  normal  0.465228 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3108  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  30.65 
 
 		 207 aa  89  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1832  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.05 
 
 		 211 aa  88.6  6e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.475063  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1233  hypothetical protein  29.19 
 
 		 208 aa  88.2  7e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1844  hypothetical protein  31.98 
 
 		 207 aa  87.8  9e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.678437  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1917  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.53 
 
 		 211 aa  87.8  9e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0692726  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2046  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  29.17 
 
 		 211 aa  87  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0272  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  30.65 
 
 		 214 aa  87.8  1e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2943  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.96 
 
 		 205 aa  87  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.434605 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0319  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  27.72 
 
 		 211 aa  87.4  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1240  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.5 
 
 		 209 aa  86.7  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.185324  normal  0.313526 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0364  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  27 
 
 		 231 aa  85.9  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.840532  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2348  hypothetical protein  30.2 
 
 		 210 aa  86.3  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0647314  hitchhiker  0.000000838099 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8100  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.65 
 
 		 203 aa  85.9  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1199  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.42 
 
 		 217 aa  85.5  4e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03019  hypothetical protein  30.85 
 
 		 212 aa  85.5  5e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0906  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  29.95 
 
 		 203 aa  84.7  7e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.201578  normal  0.0510602 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0187  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.81 
 
 		 213 aa  84.7  8e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>