224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1148 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1148  flagellar hook-filament junction protein  100 
 
 		 296 aa  594  1e-169  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0603  flagellar hook-associated protein 3  39.19 
 
 		 292 aa  198  9e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.891148  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3042  flagellar hook-associated protein FlgL  30.9 
 
 		 298 aa  138  1e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.947446  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0452  flagellar hook-associated protein FlgL  29.24 
 
 		 297 aa  133  3e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17130  flagellar hook-associated protein 3  27.72 
 
 		 301 aa  122  9e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0747  flagellar hook-associated protein FlgL  27.92 
 
 		 305 aa  121  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0439  flagellin-like  28.33 
 
 		 294 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0096  flagellar hook-associated protein FlgL  25 
 
 		 309 aa  113  5e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3227  flagellar hook-associated protein FlgL  29.01 
 
 		 297 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3456  flagellar hook-associated protein 3  27.36 
 
 		 295 aa  106  6e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0249  flagellar hook-associated protein FlgL  27.12 
 
 		 296 aa  103  4e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2242  flagellar hook-associated protein FlgL  26.8 
 
 		 302 aa  101  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0021  flagellar hook-associated protein 3  27.33 
 
 		 301 aa  99.4  7e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0671  flagellar hook-associated protein 3  26.3 
 
 		 305 aa  98.6  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0367286 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3030  flagellar hook-associated protein FlgL  28.3 
 
 		 301 aa  98.6  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3274  flagellar hook-associated protein 3  26.04 
 
 		 299 aa  97.4  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3754  flagellar hook-associated protein 3  24.92 
 
 		 306 aa  96.3  6e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3001  flagellar hook-associated protein 3  29.53 
 
 		 294 aa  96.3  6e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00024747 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2914  flagellar hook-associated protein FlgL  29.41 
 
 		 302 aa  95.9  7e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.481604  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4098  flagellar hook-associated protein 3  28.62 
 
 		 298 aa  94.4  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0865  flagellar hook-associated protein 3  24.4 
 
 		 304 aa  93.6  3e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2240  flagellar hook-associated protein 3  27.7 
 
 		 310 aa  91.7  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4194  flagellar hook-associated protein 3  24.55 
 
 		 327 aa  91.3  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0329  flagellar hook-associated protein 3  26.12 
 
 		 295 aa  90.5  3e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3838  flagellar hook-associated protein 3  24.6 
 
 		 306 aa  90.1  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0146959 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2931  flagellin-like  30.43 
 
 		 295 aa  89.7  6e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.763262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0392  flagellar hook-associated protein 3  25.91 
 
 		 298 aa  89.7  6e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1674  flagellar hook-associated protein FlgL  23 
 
 		 315 aa  89.4  6e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0842  flagellar hook-associated protein 3  24.05 
 
 		 304 aa  89.4  6e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3721  flagellar hook-associated protein FlgL  30.05 
 
 		 524 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1507  flagellar hook-associated protein FlgL  32.24 
 
 		 523 aa  87  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0759  flagellar hook-associated protein FlgL  28.35 
 
 		 326 aa  85.9  7e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.847019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0390  flagellar hook-associated protein 3  26.22 
 
 		 294 aa  85.5  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.133052  normal  0.988738 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0273  lateral flagellar hook associated protein 3  25.32 
 
 		 309 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.462118  normal  0.382201 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2235  flagellar hook-associated protein 3  24.35 
 
 		 328 aa  84.7  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000208019 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3361  flagellar hook-associated protein 3  25.32 
 
 		 309 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1331  flagellar hook-associated protein FlgL  25.56 
 
 		 311 aa  84  0.000000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.522926  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1945  flagellar hook-associated protein FlgL  30.05 
 
 		 530 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0770249  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1627  flagellar hook-associated protein FlgL  24.92 
 
 		 300 aa  82  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2368  flagellin-like  31.52 
 
 		 400 aa  80.9  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1352  flagellar hook-associated protein FlgL  26.64 
 
 		 287 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2042  flagellar hook-associated protein 3  24.66 
 
 		 305 aa  80.9  0.00000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.75647 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1350  flagellar hook-associated protein FlgL  31.69 
 
 		 400 aa  79  0.00000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31340  flagellar hook-associated protein 3  25.83 
 
 		 303 aa  79  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0213605 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1607  flagellar hook-associated protein FlgL  35 
 
 		 396 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.756895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1556  flagellar hook-associated protein FlgL  26.28 
 
 		 287 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0416222  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2400  flagellar hook-associated protein FlgL  30.05 
 
 		 411 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.60868  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3014  flagellar hook-associated protein FlgL  30.05 
 
 		 411 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00481401  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01079  flagellar hook-associated protein L  26.82 
 
 		 317 aa  77.4  0.0000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0213586  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3033  flagellar hook-associated protein FlgL  30.05 
 
 		 411 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1462  flagellar hook-associated protein FlgL  26.82 
 
 		 317 aa  77.4  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00628542  hitchhiker  0.000000476574 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1650  flagellar hook-associated protein 3  23.26 
 
 		 297 aa  77  0.0000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0216  flagellar hook-associated protein FlgL  27.84 
 
 		 305 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0193  flagellin-like protein  22.95 
 
 		 870 aa  76.6  0.0000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1475  flagellar hook-associated protein FlgL  28.42 
 
 		 521 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.649013  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2563  flagellar hook-associated protein 3  26.49 
 
 		 317 aa  76.3  0.0000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000663156  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1815  flagellar hook-associated protein FlgL  27.01 
 
 		 287 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1206  flagellar hook-associated protein FlgL  26.49 
 
 		 317 aa  76.6  0.0000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0066805  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2328  flagellar hook-associated protein FlgL  31.82 
 
 		 397 aa  76.3  0.0000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1759  flagellar hook-associated protein FlgL  24.65 
 
 		 287 aa  75.9  0.0000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0151  flagellar hook-associated protein FlgL  31.71 
 
 		 407 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.838516 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1252  flagellar hook-associated protein FlgL  24.76 
 
 		 317 aa  75.9  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.724059  normal  0.244786 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2004  flagellar hook-associated protein FlgL  24.76 
 
 		 317 aa  75.5  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0025359  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1296  flagellar hook-associated protein FlgL  24.76 
 
 		 317 aa  75.5  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000479805 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2188  flagellar hook-associated protein FlgL  24.76 
 
 		 317 aa  75.5  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000101663 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1281  flagellar hook-associated protein FlgL  24.76 
 
 		 317 aa  75.5  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.482155  hitchhiker  0.000108184 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2045  flagellar hook-associated protein FlgL  26.16 
 
 		 317 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0140515  normal  0.0179401 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1535  flagellar hook-associated protein 3  26.89 
 
 		 312 aa  75.1  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4380  flagellar hook-associated protein FlgL  26.78 
 
 		 521 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004163  flagellar hook-associated protein FlgL  28.98 
 
 		 397 aa  74.3  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01298  flagellar hook-associated protein FlgL  29.55 
 
 		 396 aa  74.7  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2517  flagellar hook-associated protein FlgL  26.25 
 
 		 317 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0270874  hitchhiker  0.000364234 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50340  flagellar hook-associated protein FlgL  27.87 
 
 		 439 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000457191 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3783  flagellar hook-associated protein FlgL  31.1 
 
 		 407 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3239  flagellar hook-associated protein FlgL  33.94 
 
 		 403 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2242  flagellar hook-associated protein FlgL  25.91 
 
 		 317 aa  73.9  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0269991  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1355  flagellar hook-associated protein FlgL  33.75 
 
 		 396 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06164  flagellar hook-associated protein FlgL  29.63 
 
 		 401 aa  73.6  0.000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.80798  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01002  flagellar hook-associated protein FlgL  29.63 
 
 		 401 aa  73.6  0.000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0789594  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1597  flagellar hook-associated protein FlgL  25.93 
 
 		 317 aa  73.6  0.000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0666  flagellin domain protein  28.47 
 
 		 1008 aa  73.6  0.000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1621  flagellar hook-associated protein 3  26.46 
 
 		 302 aa  73.6  0.000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.296506 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1269  flagellar hook-associated protein FlgL  36.36 
 
 		 402 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2587  flagellar hook-associated protein FlgL  33.33 
 
 		 403 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1964  flagellar hook-associated protein FlgL  25.89 
 
 		 304 aa  72.8  0.000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3077  flagellar hook-associated protein FlgL  32.5 
 
 		 396 aa  73.2  0.000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1331  flagellar hook-associated protein FlgL  33.33 
 
 		 403 aa  72.8  0.000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.143794  normal  0.0994213 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1737  flagellar hook-associated protein FlgL  24.82 
 
 		 287 aa  72.8  0.000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1206  flagellar hook-associated protein FlgL  29.76 
 
 		 317 aa  72.4  0.000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0674951  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1516  flagellar hook-associated protein FlgL  24.82 
 
 		 287 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0831  flagellar hook-associated protein 3  22.85 
 
 		 298 aa  70.9  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.795766  normal  0.995497 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2308  flagellar hook-associated protein FlgL  34.09 
 
 		 401 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.24261 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2358  flagellar hook-associated protein 3  25.61 
 
 		 292 aa  70.9  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1527  flagellar hook-associated protein FlgL  24.82 
 
 		 287 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00165478  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1339  flagellar hook-associated protein FlgL  35.71 
 
 		 402 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2610  flagellar hook-associated protein 3  28.19 
 
 		 294 aa  70.9  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00831645  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1705  flagellar hook-associated protein FlgL  24.45 
 
 		 287 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1968  flagellar hook-associated protein FlgL  27.27 
 
 		 410 aa  70.1  0.00000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2514  flagellar hook-associated protein 3  27.85 
 
 		 294 aa  70.1  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0170039  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2840  flagellar hook-associated protein FlgL  27.87 
 
 		 562 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.878588  normal  0.22747 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>