More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0839 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0839  Co/Zn/Cd cation transporter  100 
 
 		 428 aa  874    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000456084  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1961  cation diffusion facilitator family transporter  51.31 
 
 		 437 aa  399  9.999999999999999e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1832  cation efflux system protein  29.68 
 
 		 410 aa  202  9e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0044  cation diffusion facilitator family transporter  31.56 
 
 		 381 aa  173  5e-42  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0618  cation diffusion facilitator family transporter  27.25 
 
 		 411 aa  159  7e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000865863  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1276  cation diffusion facilitator family transporter  29.12 
 
 		 416 aa  144  4e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2257  cation diffusion facilitator family transporter  28.77 
 
 		 416 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2017  hypothetical protein  28.11 
 
 		 380 aa  126  8.000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2012  hypothetical protein  28.38 
 
 		 380 aa  124  4e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1360  cation diffusion facilitator family transporter  28.42 
 
 		 396 aa  122  9.999999999999999e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1366  cation diffusion facilitator family transporter  25.5 
 
 		 422 aa  121  3e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0567  cation diffusion facilitator family transporter  27.5 
 
 		 402 aa  121  3e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.714766  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1127  cation diffusion facilitator family transporter  28.62 
 
 		 323 aa  117  6e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_273  cation efflux protein  31.01 
 
 		 311 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.02572  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0311  cation diffusion facilitator family transporter  30.66 
 
 		 311 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4257  cation diffusion facilitator family transporter  27.18 
 
 		 297 aa  110  5e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1861  cation diffusion facilitator family transporter  26.78 
 
 		 292 aa  109  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.350904  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1144  cation efflux family protein  25.69 
 
 		 289 aa  108  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0182712  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0167  cation diffusion facilitator family transporter  29.43 
 
 		 305 aa  108  2e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4529  cation efflux family protein  26.85 
 
 		 297 aa  108  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3126  cation diffusion facilitator family transporter  26.85 
 
 		 297 aa  108  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2100  cation diffusion facilitator family transporter  25.77 
 
 		 310 aa  108  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.70845  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0706  cation efflux family protein  27.18 
 
 		 297 aa  107  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1036  cation diffusion facilitator family transporter  26.49 
 
 		 387 aa  107  4e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.246594  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4305  cation efflux family protein  26.85 
 
 		 298 aa  106  7e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.901101  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4154  cation efflux family protein; cobalt-zinc-cadmium resistance protein  26.85 
 
 		 298 aa  106  7e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4544  cation efflux family protein  26.85 
 
 		 297 aa  106  7e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4640  cation efflux family protein  26.85 
 
 		 298 aa  106  7e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4143  cation efflux family protein; cobalt-zinc-cadmium resistance protein  26.85 
 
 		 297 aa  106  8e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4490  cation efflux family protein  26.85 
 
 		 297 aa  106  8e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000013867 
 
 
-
 
NC_002936  DET0331  cation efflux family protein  32.06 
 
 		 311 aa  106  9e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0983  cation efflux family protein  25 
 
 		 289 aa  105  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0179207  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2008  cation efflux family protein  26.83 
 
 		 293 aa  105  2e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.536733  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4494  cation efflux family protein  26.85 
 
 		 298 aa  104  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3764  cation efflux protein  26.8 
 
 		 389 aa  103  6e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0837533 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04060  cation diffusion facilitator family transporter  25.69 
 
 		 292 aa  103  7e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1774  cation diffusion facilitator family transporter  26.06 
 
 		 293 aa  103  7e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000103729  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1224  cation diffusion facilitator family transporter  26.61 
 
 		 421 aa  102  1e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0634  cation efflux family protein  25.26 
 
 		 314 aa  100  4e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2491  cation diffusion facilitator family transporter  26.28 
 
 		 288 aa  100  5e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2443  cation diffusion facilitator family transporter  26.28 
 
 		 288 aa  100  5e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2889  cation diffusion facilitator family transporter  28.47 
 
 		 388 aa  100  6e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000320508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1417  cation diffusion facilitator family transporter  27.41 
 
 		 384 aa  99.8  9e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3647  cation diffusion facilitator family transporter  26.33 
 
 		 395 aa  99.4  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0074  cation diffusion facilitator family transporter  25.26 
 
 		 313 aa  98.2  3e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0936  cation diffusion facilitator family transporter  26.64 
 
 		 300 aa  97.8  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2576  cation diffusion facilitator family transporter  24.91 
 
 		 423 aa  97.4  5e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00102277 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0663  cation diffusion facilitator family transporter  24.49 
 
 		 312 aa  95.9  1e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0132428  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0496  cation diffusion facilitator family transporter  27.12 
 
 		 318 aa  95.9  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.920568  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2428  cation diffusion facilitator family transporter  26.45 
 
 		 299 aa  95.9  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000439977  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0117  cation diffusion facilitator family transporter  26.64 
 
 		 400 aa  96.3  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2005  cation diffusion facilitator family transporter  25.17 
 
 		 299 aa  95.1  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3075  cation diffusion facilitator family transporter  27.78 
 
 		 304 aa  95.5  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.553073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3458  cation diffusion facilitator family transporter  25.27 
 
 		 413 aa  94.7  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1496  cation diffusion facilitator family transporter  26.58 
 
 		 400 aa  94  5e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1214  cation diffusion facilitator family transporter  26.58 
 
 		 406 aa  93.6  5e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0101557  hitchhiker  0.000000113777 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2245  cation diffusion facilitator family transporter  28.25 
 
 		 483 aa  92.4  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3406  cation diffusion facilitator family transporter  27.96 
 
 		 337 aa  92  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0491  cation diffusion facilitator family transporter  25.8 
 
 		 354 aa  92  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0566502 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0344  cation transporter  25.61 
 
 		 427 aa  92.4  2e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00235154  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0710  cation diffusion facilitator family transporter  26.5 
 
 		 476 aa  92  2e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1788  cation diffusion facilitator family transporter  25.66 
 
 		 299 aa  92  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0431575 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1379  cation diffusion facilitator family transporter  25.15 
 
 		 481 aa  91.7  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.892961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1531  cation diffusion facilitator family transporter  26.1 
 
 		 317 aa  91.3  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0625  cation diffusion facilitator family transporter  25.41 
 
 		 391 aa  91.3  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0465  cation efflux family protein  25.41 
 
 		 391 aa  91.3  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.326406  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3150  cation diffusion facilitator family transporter  23.33 
 
 		 401 aa  91.3  3e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0321624 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0553  cation diffusion facilitator family transporter  27.03 
 
 		 388 aa  90.1  7e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1752  cation diffusion facilitator family transporter  25.17 
 
 		 301 aa  89.7  8e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00011926  normal  0.0299978 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0745  cation diffusion facilitator family transporter  26.01 
 
 		 460 aa  89.7  8e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1517  cation diffusion facilitator family transporter  24.57 
 
 		 378 aa  89.7  1e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1450  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  24.57 
 
 		 378 aa  89.7  1e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.59644  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0938  cation diffusion facilitator family transporter  26.51 
 
 		 387 aa  89  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1582  cation diffusion facilitator family transporter  24.18 
 
 		 299 aa  89.4  1e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0974  cation diffusion facilitator family transporter  25.65 
 
 		 466 aa  88.6  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2098  cation diffusion facilitator family transporter  24.31 
 
 		 285 aa  89  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1587  cation diffusion facilitator family transporter  26.69 
 
 		 307 aa  87.4  4e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.697729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1668  cation diffusion facilitator family transporter  25.7 
 
 		 291 aa  87.8  4e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0340924  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2090  cation efflux family protein  26.94 
 
 		 302 aa  87.4  5e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5170  cation efflux protein  26.67 
 
 		 303 aa  87  5e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0050  cation diffusion facilitator family transporter  26.1 
 
 		 317 aa  87.4  5e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.374526 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0210  cation diffusion facilitator family transporter  26.33 
 
 		 404 aa  87  5e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.904407 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1848  cation diffusion facilitator family transporter  25.8 
 
 		 460 aa  87  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.762115 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0196  cation diffusion facilitator family transporter  26.33 
 
 		 404 aa  87  6e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.831911  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2423  cation diffusion facilitator family transporter  24.64 
 
 		 291 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3261  cation efflux system protein  26.59 
 
 		 305 aa  85.9  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.826048  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1011  cation diffusion facilitator family transporter  25.8 
 
 		 289 aa  85.9  0.000000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0282  cation diffusion facilitator family transporter  25.74 
 
 		 385 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.369403  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1992  cation diffusion facilitator family transporter  29.08 
 
 		 389 aa  85.1  0.000000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0846  cation diffusion facilitator family transporter  28.12 
 
 		 459 aa  85.5  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0034385  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0900  cation diffusion facilitator family transporter  21.68 
 
 		 285 aa  85.1  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000200254  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4982  cation diffusion facilitator family transporter  26.76 
 
 		 307 aa  85.1  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0279964 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11850  cation diffusion facilitator family transporter  24.49 
 
 		 312 aa  85.5  0.000000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0399  cation diffusion facilitator family transporter  25.73 
 
 		 418 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.329701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0264  cation diffusion facilitator family transporter  25.52 
 
 		 385 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.56079 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0589  cation diffusion facilitator family transporter  27.3 
 
 		 285 aa  85.5  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000134664  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3895  cation diffusion facilitator family transporter  27.39 
 
 		 307 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.640647  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1675  cation diffusion facilitator family transporter  27.12 
 
 		 307 aa  84.7  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.282896  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2941  cation diffusion facilitator family transporter  27.12 
 
 		 307 aa  84.7  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0245  cation diffusion facilitator family transporter  24.65 
 
 		 291 aa  84.3  0.000000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>