33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0964 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0964  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 300 aa  608  1e-173  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1901  radical SAM domain-containing protein  72.24 
 
 		 298 aa  449  1e-125  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.844314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0768  radical SAM domain-containing protein  68.77 
 
 		 300 aa  439  9.999999999999999e-123  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00853946 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1414  radical SAM domain-containing protein  71.03 
 
 		 290 aa  435  1e-121  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0464  radical SAM domain-containing protein  38.33 
 
 		 353 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1063  Radical SAM domain protein  36.43 
 
 		 350 aa  169  7e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.540032  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2157  radical SAM domain-containing protein  35.36 
 
 		 343 aa  167  2e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.350893  hitchhiker  0.000485535 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0784  radical SAM family protein  34.33 
 
 		 337 aa  166  5e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00132902  normal  0.107419 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0398  radical SAM domain-containing protein  33.69 
 
 		 371 aa  166  5e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0698777  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0106  Radical SAM domain protein  36.09 
 
 		 343 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1789  radical SAM domain-containing protein  39.11 
 
 		 341 aa  162  9e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0772  Radical SAM domain protein  34.94 
 
 		 353 aa  161  1e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00827536  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2062  radical SAM domain-containing protein  37.72 
 
 		 341 aa  160  3e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.539759 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0439  radical SAM domain-containing protein  33.1 
 
 		 371 aa  159  8e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1481  radical SAM domain-containing protein  32.73 
 
 		 371 aa  156  4e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0924558  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0983  radical SAM domain-containing protein  35.02 
 
 		 380 aa  154  1e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.156314  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0508  radical SAM domain-containing protein  31.34 
 
 		 373 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0273  hypothetical protein  33.83 
 
 		 353 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.888723  normal  0.245364 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0043  radical SAM family Fe-S protein  33.33 
 
 		 348 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0016  radical SAM domain-containing protein  35.14 
 
 		 344 aa  144  2e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.238462  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0117  hypothetical protein  33.33 
 
 		 334 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1246  Radical SAM domain protein  31.11 
 
 		 346 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0936  Radical SAM domain protein  31.25 
 
 		 343 aa  126  5e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.674566 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0312  Radical SAM domain protein  30.4 
 
 		 332 aa  124  3e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.139539 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1383  Radical SAM domain protein  32.23 
 
 		 331 aa  121  9.999999999999999e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.632636  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3338  Radical SAM domain protein  30.04 
 
 		 331 aa  119  4.9999999999999996e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1025  Radical SAM domain protein  25.84 
 
 		 409 aa  91.3  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1369  hypothetical protein  23.46 
 
 		 471 aa  80.5  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3410  Radical SAM domain protein  24.18 
 
 		 433 aa  74.7  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.736979  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2101  radical SAM family protein  24.4 
 
 		 417 aa  49.7  0.00007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1327  Radical SAM domain protein  21.77 
 
 		 375 aa  48.9  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000215386  hitchhiker  0.00000524996 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0297  pyruvate formate-lyase activating enzyme  21.79 
 
 		 247 aa  46.2  0.0006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2719  pyruvate formate-lyase activating enzyme  25 
 
 		 241 aa  45.1  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>