72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0555 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0555  UbiA prenyltransferase  100 
 
 		 290 aa  542  1e-153  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1733  UbiA prenyltransferase  65.33 
 
 		 276 aa  345  4e-94  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0740  UbiA prenyltransferase  68.61 
 
 		 275 aa  338  8e-92  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.572168 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0749  UbiA prenyltransferase  69.34 
 
 		 276 aa  265  8.999999999999999e-70  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.870578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0958  UbiA prenyltransferase  38.81 
 
 		 294 aa  171  2e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0636  prenyltransferase  37.5 
 
 		 277 aa  126  5e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1693  prenyltransferase  34.78 
 
 		 288 aa  94.4  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00802705  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0795  prenyltransferase  34.16 
 
 		 282 aa  90.9  2e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.686663  hitchhiker  0.00000276603 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1697  prenyltransferase  35.6 
 
 		 279 aa  89  8e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0315  prenyltransferase  31.13 
 
 		 283 aa  85.1  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2544  prenyltransferase  32 
 
 		 281 aa  81.6  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1142  UbiA prenyltransferase  31.67 
 
 		 267 aa  80.5  0.00000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1040  (S)-2,3-di-O-geranylgeranylglyceryl phosphate synthase  31.25 
 
 		 279 aa  79  0.0000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1679  prenyltransferase  31.84 
 
 		 281 aa  78.6  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.558367  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1843  prenyltransferase  33.02 
 
 		 279 aa  77.4  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.183334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1730  (S)-2,3-di-O-geranylgeranylglyceryl phosphate synthase  29.51 
 
 		 278 aa  77  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1933  (S)-2,3-di-O-geranylgeranylglyceryl phosphate synthase  27.78 
 
 		 284 aa  75.1  0.000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1647  Geranylgeranylglycerol-phosphate geranylgeranyltransferase  30.73 
 
 		 282 aa  74.3  0.000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.114853  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0995  (S)-2,3-di-O-geranylgeranylglyceryl phosphate synthase  31.34 
 
 		 278 aa  73.6  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0176059  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1016  UbiA prenyltransferase  36.3 
 
 		 284 aa  72  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0950  (S)-2,3-di-O-geranylgeranylglyceryl phosphate synthase  28.42 
 
 		 278 aa  69.7  0.00000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0977  (S)-2,3-di-O-geranylgeranylglyceryl phosphate synthase  29.1 
 
 		 278 aa  68.2  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.92785  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3192  UbiA prenyltransferase  32.87 
 
 		 283 aa  65.5  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.726332  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1338  prenyltransferase  34.75 
 
 		 285 aa  64.7  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.823422 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3485  UbiA prenyltransferase  25.99 
 
 		 291 aa  58.5  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0625  prenyltransferase  30.53 
 
 		 280 aa  57  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.24131  normal  0.221507 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12008  Maf-like protein  30.34 
 
 		 283 aa  56.6  0.0000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.528538  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1337  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  29.19 
 
 		 286 aa  56.6  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.286339 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1863  prenyltransferase  26.48 
 
 		 289 aa  56.6  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.959148  normal  0.340007 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0002  tocopherol phytyltransferase  22.27 
 
 		 299 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1449  UbiA prenyltransferase  31.77 
 
 		 284 aa  55.1  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.260951  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1782  UbiA prenyltransferase  26.4 
 
 		 247 aa  53.9  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2480  prenyltransferase  28.74 
 
 		 293 aa  53.1  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0220727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3311  prenyltransferase  27.54 
 
 		 291 aa  51.6  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2954  prenyltransferase  25.75 
 
 		 308 aa  52  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3714  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  31.03 
 
 		 315 aa  52  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.213938  hitchhiker  0.000489008 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0427  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  24.66 
 
 		 315 aa  52  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04831  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  24.22 
 
 		 315 aa  51.2  0.00002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.652512  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0771  Geranylgeranylglycerol-phosphate geranylgeranyltransferase  28.31 
 
 		 259 aa  51.2  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0487917  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04521  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  24.22 
 
 		 315 aa  51.2  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32069  predicted protein  24.09 
 
 		 319 aa  50.4  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0012  tocopherol phytyltransferase  25.74 
 
 		 318 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1105  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  31.33 
 
 		 299 aa  50.8  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.359039  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04901  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  23.32 
 
 		 315 aa  49.3  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0010  tocopherol phytyltransferase  25.32 
 
 		 318 aa  49.3  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3669  UbiA prenyltransferase  35.96 
 
 		 185 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000695269  normal  0.0238668 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1594  UbiA prenyltransferase  30.73 
 
 		 309 aa  47.8  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000126617 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2757  UbiA prenyltransferase  30.63 
 
 		 324 aa  47  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1155  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  29.94 
 
 		 376 aa  47  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.142622  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2079  prenyltransferase  28.3 
 
 		 287 aa  46.6  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.728738  normal  0.183793 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0806  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  25.33 
 
 		 317 aa  46.6  0.0005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.196063  hitchhiker  0.00946917 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0165  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  29.94 
 
 		 303 aa  46.2  0.0007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2362  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  30.95 
 
 		 328 aa  45.8  0.0009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.620404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0911  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  31.06 
 
 		 300 aa  45.1  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.714122 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1089  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  30.49 
 
 		 333 aa  45.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2015  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  25.24 
 
 		 287 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0915857 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1016  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  28.65 
 
 		 302 aa  44.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0726  tocopherol phytyltransferase  26.38 
 
 		 314 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00119936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0306  UbiA prenyltransferase  22.12 
 
 		 288 aa  43.9  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1449  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  29.81 
 
 		 333 aa  44.3  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.482254  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2061  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  29.45 
 
 		 309 aa  43.5  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0172201 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3396  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  27.5 
 
 		 286 aa  43.5  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.442555  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04811  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  24.66 
 
 		 316 aa  42.7  0.006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.233119  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04595  hypothetical protein  25.24 
 
 		 303 aa  43.1  0.006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.311519  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1759  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  24.66 
 
 		 316 aa  42.7  0.006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1236  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  26.48 
 
 		 318 aa  42.7  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5594  hypothetical protein  30.54 
 
 		 494 aa  42.7  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.626136  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3595  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  28.81 
 
 		 294 aa  42.4  0.008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3530  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  29.67 
 
 		 301 aa  42.4  0.009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.47035 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1573  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  25.56 
 
 		 317 aa  42.4  0.009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0576608  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0279  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  28.65 
 
 		 302 aa  42.4  0.009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0728517  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1089  UbiA prenyltransferase  32.28 
 
 		 313 aa  42.4  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>