More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_2270 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_2270  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 
345 aa  687    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.158683 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1926  radical SAM domain-containing protein  76.09 
 
 
347 aa  540  9.999999999999999e-153  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.265306  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0739  radical SAM domain-containing protein  73.18 
 
 
347 aa  539  9.999999999999999e-153  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0458  radical SAM domain-containing protein  70.14 
 
 
359 aa  481  1e-134  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0658  radical SAM domain-containing protein  43.02 
 
 
336 aa  260  2e-68  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2248  radical SAM domain-containing protein  40.59 
 
 
332 aa  239  5.999999999999999e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.0000000187282  normal  0.0755271 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0576  radical SAM domain-containing protein  32.4 
 
 
457 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.11056  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1363  radical SAM domain-containing protein  31.84 
 
 
458 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.359943  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1300  radical SAM domain-containing protein  32.4 
 
 
457 aa  199  6e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.32123  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1371  radical SAM domain-containing protein  32.4 
 
 
457 aa  198  9e-50  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.000145601 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0312  radical SAM domain-containing protein  32.17 
 
 
446 aa  178  1e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.977529  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4402  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.17 
 
 
326 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.320325  hitchhiker  0.00467523 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1148  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.77 
 
 
298 aa  74.3  0.000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4793  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.61 
 
 
326 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00113371  hitchhiker  0.00000239799 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0802  radical SAM family Fe-S protein  27.75 
 
 
561 aa  70.1  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.93988 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4120  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.49 
 
 
326 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0087  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.17 
 
 
337 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0823878  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2160  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.25 
 
 
322 aa  68.6  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.921473  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0082  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.36 
 
 
337 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3748  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.57 
 
 
337 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.247867  normal  0.0670544 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0273  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.49 
 
 
337 aa  66.6  0.0000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000395705 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3524  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.65 
 
 
340 aa  65.9  0.0000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.406525  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0183  radical SAM domain-containing protein  29.19 
 
 
608 aa  65.9  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.531791 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1476  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.94 
 
 
299 aa  65.9  0.000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0274  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.53 
 
 
337 aa  65.9  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.481355  hitchhiker  0.000000283417 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2231  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.78 
 
 
345 aa  65.5  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.813022  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0389  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.65 
 
 
337 aa  65.1  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.62159  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1394  radical SAM domain-containing protein  27.72 
 
 
451 aa  64.7  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.132829  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0285  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.11 
 
 
337 aa  64.7  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02954  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.58 
 
 
329 aa  64.3  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4452  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.53 
 
 
326 aa  63.9  0.000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2247  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.11 
 
 
348 aa  63.9  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.720005 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08560  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  29.29 
 
 
366 aa  63.9  0.000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.209245  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002954  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.58 
 
 
329 aa  63.5  0.000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.761201  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0958  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  37.66 
 
 
344 aa  63.2  0.000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.105392  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2025  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.19 
 
 
348 aa  63.5  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0930422  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2191  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.5 
 
 
344 aa  63.2  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.218235  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0284  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.06 
 
 
337 aa  63.2  0.000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0277  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.06 
 
 
337 aa  63.2  0.000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0281  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.06 
 
 
337 aa  63.2  0.000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3349  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.77 
 
 
346 aa  63.2  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.366452  normal  0.377224 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1190  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.98 
 
 
332 aa  62.8  0.000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.708354  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0952  Radical SAM domain protein  27.6 
 
 
437 aa  62  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00605498  hitchhiker  0.00000184095 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0544  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.81 
 
 
334 aa  62.4  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1498  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  26.91 
 
 
326 aa  62.4  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.286832  normal  0.0117341 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1003  radical SAM domain-containing protein  31.4 
 
 
489 aa  62  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00934778  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0948  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  38.36 
 
 
344 aa  62  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3480  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.46 
 
 
344 aa  61.2  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.460525 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0176  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.09 
 
 
320 aa  61.6  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2703  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.27 
 
 
345 aa  61.2  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3588  radical SAM domain-containing protein  28.35 
 
 
446 aa  60.8  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1390  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.37 
 
 
296 aa  61.2  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.212128  normal  0.415748 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2052  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.83 
 
 
344 aa  61.2  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.128137 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2362  Radical SAM domain protein  27.23 
 
 
512 aa  60.8  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.199489 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3073  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.89 
 
 
330 aa  60.8  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.342071  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2507  radical SAM domain-containing protein  26.4 
 
 
421 aa  60.8  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1582  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  36.36 
 
 
349 aa  60.5  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.519622  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0859  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.31 
 
 
351 aa  60.1  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.136733 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1832  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.02 
 
 
380 aa  60.1  0.00000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1322  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  26.92 
 
 
317 aa  59.7  0.00000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.331504  normal  0.241678 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0197  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.82 
 
 
320 aa  59.7  0.00000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3141  Radical SAM domain protein  28.93 
 
 
441 aa  59.7  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0369  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.74 
 
 
321 aa  59.7  0.00000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000001817  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03862  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.11 
 
 
280 aa  59.7  0.00000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1337  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.16 
 
 
308 aa  59.3  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0490637  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0157  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.82 
 
 
320 aa  59.3  0.0000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2804  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.44 
 
 
341 aa  58.9  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.933845  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1288  molybdenum cofactor synthesis protein  36.56 
 
 
330 aa  58.2  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1400  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.95 
 
 
323 aa  58.2  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0925  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  31.11 
 
 
339 aa  58.5  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3051  Radical SAM domain protein  30.28 
 
 
461 aa  58.2  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.684834  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1033  radical SAM domain-containing protein  23.94 
 
 
287 aa  58.5  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1314  radical SAM domain-containing protein  28.87 
 
 
470 aa  58.2  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.147685  hitchhiker  0.000205505 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2135  Radical SAM domain protein  25.62 
 
 
285 aa  57.8  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000451795 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1873  Radical SAM domain protein  27.23 
 
 
450 aa  57.8  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0158  molybdenum cofactor synthesis-like  27.42 
 
 
331 aa  57.4  0.0000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194349  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1986  radical SAM domain-containing protein  25.48 
 
 
453 aa  57.4  0.0000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1203  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.72 
 
 
308 aa  57  0.0000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.31848  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0843  radical SAM domain-containing protein  29.23 
 
 
487 aa  57  0.0000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.996552  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2110  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.27 
 
 
356 aa  57  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.163596  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1440  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.21 
 
 
347 aa  57  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.160949  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5047  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.95 
 
 
353 aa  57  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.735046  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50634  predicted protein  30.3 
 
 
336 aa  56.6  0.0000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.612985 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34160  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  29.76 
 
 
339 aa  56.6  0.0000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.142269  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2515  radical SAM domain-containing protein  25.23 
 
 
471 aa  56.2  0.0000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2072  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  35.06 
 
 
329 aa  56.6  0.0000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3389  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  39.74 
 
 
345 aa  56.2  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.142655 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1879  molybdenum cofactor synthesis-like  27.13 
 
 
354 aa  56.2  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0169  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.76 
 
 
375 aa  55.8  0.0000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.280654  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19300  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  27.63 
 
 
333 aa  56.2  0.0000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00282794  normal  0.0296768 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2859  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.73 
 
 
330 aa  55.5  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00116324  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2615  Radical SAM domain protein  26.39 
 
 
471 aa  55.5  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1990  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.59 
 
 
335 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1762  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.36 
 
 
333 aa  55.8  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.114768 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1759  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.77 
 
 
356 aa  55.1  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.103881  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2295  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.04 
 
 
329 aa  55.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2073  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  38.96 
 
 
344 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.292381  normal  0.516517 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2190  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  23.6 
 
 
318 aa  54.7  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0597  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.79 
 
 
348 aa  55.1  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2177  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.95 
 
 
339 aa  55.1  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.697668  normal  0.807394 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>